Fold change (FC) jest miarą opisującą stopień zmiany ilościowej między wartością końcową a oryginalną. Na przykład, dla zestawu danych o wartości początkowej 20 i wartości końcowej 80, odpowiednia zmiana fałdowa wynosi 3, lub w potocznym rozumieniu, trzykrotny wzrost. Zmiana fałdowa jest obliczana po prostu jako stosunek zmian między wartością końcową a wartością pierwotną do wartości początkowej. Tak więc, jeśli wartość początkowa to X, a wartość końcowa to Y, zmiana fałdowa to (Y – X)/X lub równoważnie Y/X – 1. Jako inny przykład, zmiana z 60 na 30 byłaby zmianą fałdową -0,5, podczas gdy zmiana z 30 na 60 byłaby zmianą fałdową 1 (zmiana 2 razy większa od początkowej).

Jednakże, zamieszanie i niejednoznaczność mogą wynikać z tego użycia. Na przykład, chociaż 2 razy to 200% lub 2x, 2-krotny wzrost, jest, jak wspomniano powyżej, rozumiany przez niektórych jako wzrost o 300%, jak w „90 jest 2 razy większy niż 30”. Jednak kilka słowników, w tym Oxford English Dictionary i Merriam-Webster Dictionary, a także Collins’s Dictionary of Mathematics, definiują „-fold”, aby oznaczać „razy”, jak w „3-fold” = „4 razy”. Prawdopodobnie z powodu tej definicji, wielu badaczy używać zarówno „fold” i „fold zmiana” być synonimem „razy”, jak w „2-krotnie większe” = „2 razy większe.” Wśród niektórych ekspertów w tej dziedzinie wykorzystanie utrzymuje się z fold zmiany jak w „40 jest 1-krotnie większa niż 20.” Dlatego można argumentować, że należy całkowicie unikać stosowania zmiany fałdowej, jak w „X jest 3-krotnie większy niż 15”, ponieważ niektórzy będą interpretować to jako oznaczające X jest 45, podczas gdy inni będą rozumieć to jako oznaczające, że A jest 60.

Metoda zmiany fałdowej jest często stosowana w analizie danych ekspresji genów w transkryptomice, proteomice i metabolomice, do pomiaru zmian w różnych warunkach. Oczywistą zaletą analizy fold change jest to, że ma ona sens dla biologów. Wadą i poważnym ryzykiem związanym z wykorzystaniem metody zmiany fałdowej w tym kontekście jest to, że jest ona stronnicza i może pominąć geny ulegające ekspresji różnicowej z dużymi różnicami (Y-X), ale małymi stosunkami (X/Y), co prowadzi do wysokiego odsetka pominięć przy wysokich intensywnościach.

Jak złożyć zamówienie:

*Jeśli Twoja organizacja wymaga podpisania umowy o poufności, skontaktuj się z nami przez e-mail

* Tylko do użytku badawczego. Nie do użytku w procedurach diagnostycznych.
Nasi przedstawiciele ds. obsługi klienta są dostępni 24 godziny na dobę, 7 dni w tygodniu. Zapytanie

admin

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.

lg