Craig Venter

Hlavní článek: Venter byl nadšený z toho, že genomika může radikálně změnit zdravotnictví. Venter věřil, že shotgun sekvenování je nejrychlejší a nejefektivnější způsob, jak získat užitečná data o lidském genomu. Projekt lidského genomu však tuto metodu odmítl, protože někteří genetici se domnívali, že by nebyla dostatečně přesná pro tak složitý genom, jako je genom člověka, že by byla logisticky náročnější a že by stála podstatně více.

Venter považoval pomalé tempo pokroku v projektu lidského genomu za příležitost, jak pokračovat ve svém zájmu o patentování genů, a proto hledal finanční prostředky v soukromém sektoru, aby mohl založit společnost Celera Genomics. Společnost plánovala profitovat ze své práce vytvářením genomických dat, která by si uživatelé mohli předplatit za poplatek. Tento cíl následně vytvořil tlak na veřejný program genomu a podnítil několik skupin, aby zdvojnásobily své úsilí o vytvoření úplné sekvence. Venterovo úsilí mu přineslo proslulost, protože se se svým týmem ze společnosti Celera Corporation podělil o zásluhy za sekvenování prvního návrhu lidského genomu v rámci veřejně financovaného projektu Human Genome Project.

V roce 2000 Venter a Francis Collins z Národního ústavu zdraví a amerického veřejného genomového projektu společně oznámili zmapování lidského genomu, a to celé tři roky před očekávaným koncem veřejného genomového programu. Oznámení bylo učiněno společně s americkým prezidentem Billem Clintonem a britským premiérem Tonym Blairem. Venter a Collins se tak podělili o ocenění „Životopis roku“ od A&E Network. 15. února 2001 konsorcium Projektu lidského genomu zveřejnilo první lidský genom v časopise Nature, o den později následovala publikace Celery v Science. Navzdory některým tvrzením, že shotgun sekvenování je v některých ohledech méně přesné než metoda klon po klonu, kterou zvolil Projekt lidského genomu, se tato technika stala široce přijímanou vědeckou komunitou.

Venter byl počátkem roku 2002 propuštěn společností Celera. Podle jeho životopisu byl Venter propuštěn kvůli konfliktu s hlavním investorem Tonym Whitem, který mu konkrétně zakázal účast na slavnostním ceremoniálu v Bílém domě na oslavu úspěchu sekvenování lidského genomu.

Global Ocean Sampling ExpeditionEdit

Globální expedice vzorkování oceánů (GOS) je projekt zkoumání genomu oceánů, jehož cílem je posoudit genetickou rozmanitost v mořských mikrobiálních společenstvech a pochopit jejich roli v základních procesech v přírodě. Projekt byl zahájen v srpnu 2003 jako pilotní projekt odběru vzorků v Sargasovém moři a 4. března 2004 Venter oznámil zahájení celé expedice. Projekt, který využíval Venterovu osobní jachtu Sorcerer II, začal v kanadském Halifaxu, obeplul zeměkouli a v lednu 2006 se vrátil do USA.

Synthetic GenomicsEdit

V červnu 2005 Venter spoluzaložil společnost Synthetic Genomics, která se zabývá využíváním modifikovaných mikroorganismů k výrobě čistých paliv a biochemických látek. V červenci 2009 oznámila společnost ExxonMobil spolupráci se Synthetic Genomics v hodnotě 600 milionů dolarů na výzkumu a vývoji biopaliv nové generace. Venter nadále pracuje na vytvoření upravených diatomických mikrořas pro výrobu biopaliv.

Venter usiluje o patentování prvního částečně syntetického druhu, který se pravděpodobně bude jmenovat Mycoplasma laboratorium. Spekuluje se, že tento směr výzkumu by mohl vést k výrobě bakterií, které by byly upraveny tak, aby prováděly specifické reakce, například vyráběly paliva, léky, bojovaly proti globálnímu oteplování a podobně.

V květnu 2010 se týmu vědců vedenému Venterem jako prvnímu podařilo vytvořit něco, co bylo označeno jako „syntetický život“. Podařilo se to tak, že syntetizovali velmi dlouhou molekulu DNA obsahující celý genom bakterie a vnesli ji do jiné buňky, což je obdoba úspěchu skupiny Eckarda Wimmera, který syntetizoval a podvázal genom RNA viru a „zavedl“ jej do buněčného lyzátu. Jednobuněčný organismus obsahuje čtyři „vodoznaky“ zapsané do své DNA, které jej identifikují jako syntetický a pomáhají vysledovat jeho potomky. Vodoznaky obsahují

1. Kódovou tabulku pro celou abecedu s interpunkcí
2. Jména 46 přispívajících vědců
3. Tři citáty
4. Tajnou e-mailovou adresu buňky.

Dne 25. března 2016 Venter oznámil vytvoření Syn 3.0, syntetického genomu, který má nejméně genů ze všech volně žijících organismů (473 genů). Jejich cílem bylo odstranit všechny nepodstatné geny a ponechat pouze minimální sadu nezbytnou k zajištění života. tato ořezaná, rychle se rozmnožující buňka má být cenným nástrojem pro výzkumníky v této oblasti.

V srpnu 2018 Venter odešel z funkce předsedy správní rady s tím, že se chce soustředit na svou práci v Institutu J. Craiga Ventera. Zůstane vědeckým poradcem správní rady.

J. Craig Venter InstituteEdit

Venter je v současné době výkonným ředitelem neziskové organizace J. Craig Venter Institute, která provádí výzkum v oblasti syntetické biologie. Venter tuto organizaci založil v roce 2006. Má zařízení v La Jolla a v Rockville v Marylandu a zaměstnává více než 200 lidí.

Individuální lidský genomEdit

4. září 2007 zveřejnil tým vedený Samem Levym jeden z prvních genomů individuálního člověka – Venterovu vlastní sekvenci DNA. Některé sekvence ve Venterově genomu jsou spojeny s vlhkým ušním mazem, zvýšeným rizikem asociálního chování, Alzheimerovou chorobou a kardiovaskulárními chorobami. Tato publikace byla zajímavá zejména tím, že se pokusila oddělit dva haplotypy (dvě kopie každého chromozomu), i když toho dosáhla jen omezeně. Publikovaný genom měl pouze 3 miliardy bází, nikoliv plných 6 miliard, které by obsahovala plně diploidní sekvence. Uplynulo dalších 10 let, než se začaly objevovat první lidské genomy s vyřešenými haplotypy.

The Human Reference Genome Browser je webová aplikace pro navigaci a analýzu nedávno publikovaného Venterova genomu. Databáze HuRef se skládá z přibližně 32 milionů čtení DNA sekvenovaných pomocí mikrofluidního Sangerova sekvenování, sestavených do 4 528 scaffoldů a 4,1 milionu variací DNA identifikovaných analýzou genomu. Tyto varianty zahrnují jednonukleotidové polymorfismy (SNP), blokové záměny, krátké a velké indely a strukturální odchylky, jako jsou inzerce, delece, inverze a změny počtu kopií.

Prohlížeč umožňuje vědcům procházet sestavu genomu HuRef a sekvenční odchylky a porovnávat ji se sestavou NCBI human build 36 v kontextu anotací NCBI a Ensembl. Prohlížeč poskytuje srovnávací pohled mezi konsensuálními sekvencemi NCBI a HuRef, sekvenčním multipřipojením sestavy HuRef, anotacemi Ensembl a dbSNP, variantami HuRef a podkladovými důkazy o variantách a funkční analýzou. Rozhraní také představuje bloky haplotypů, z nichž lze odvodit sekvenci diploidního genomu, a vztah variant ke genovým anotacím. Zobrazení variant a genových anotací je propojeno s externími veřejnými zdroji včetně dbSNP, Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) a Gene Ontology (GO).

Uživatelé mohou vyhledávat v genomu HuRef pomocí názvů genů HUGO, identifikátorů Ensembl a dbSNP, umístění kontigů nebo scaffoldů HuRef nebo umístění chromozomů NCBI. Uživatelé pak mohou snadno a rychle procházet jakoukoli genomovou oblast pomocí jednoduchého a intuitivního ovládání posouvání a zvětšování; navíc lze data relevantní pro konkrétní lokusy exportovat pro další analýzu.

Human Longevity, Inc.edit

Dne 4. března 2014 Venter a spoluzakladatelé Peter Diamandis a Robert Hariri oznámili založení společnosti Human Longevity, Inc. zaměřené na prodloužení zdravého, „vysoce výkonného“ lidského života. V době oznámení již společnost získala 70 milionů dolarů v rámci rizikového financování, které mělo trvat 18 měsíců. Venter působil jako předseda představenstva a výkonný ředitel (CEO) až do května 2018, kdy odešel do důchodu. Společnost uvedla, že plánuje sekvenovat 40 000 genomů ročně, přičemž zpočátku se zaměří na genomy rakoviny a genomy pacientů s rakovinou.

Společnost Human Longevity podala v roce 2018 na Ventera žalobu, v níž ho obvinila z krádeže obchodního tajemství. Obvinění uváděla, že Venter odešel se svým firemním počítačem, který obsahoval cenné informace, jež by mohly být použity k založení konkurenčního podniku. kalifornský soudce nakonec žalobu zamítl na základě toho, že společnost Human Longevity nebyla schopna předložit případ, který by splňoval právní práh požadovaný pro to, aby společnost, resp. jednotlivec, mohl podat žalobu v případě, že mu bylo odcizeno obchodní tajemství.

Posláním společnosti Human Longevity je prodloužit zdravý lidský život pomocí diagnostiky s vysokým rozlišením na základě velkých dat z genomiky, metabolomiky, mikrobiomiky a proteomiky a pomocí terapie kmenovými buňkami.

.