Mnoho egyptských bohů a bohyň začínalo na jednom místě a po celou dobu své historie mělo své vlastní město, kde byli uctíváni, a mnoho velkých měst a městeček je známo jako rodiště svého boha nebo bohyně. Nebyla však nalezena žádná místní města, kde by byla Isis uctívána; po celou dobu její rané historie nejsou známy žádné její chrámy. Isis se začala uctívat až ve 30. dynastii; do té doby byla Isis uctívána v chrámech jiných bohů nebo bohyň. Nicméně ještě za 30. dynastie byla Isis uctívána společně s Horem a Osirisem. Chrámy Isidy se staly běžnými v době římské. Ve Philae jí byl postaven chrám.
V této době se Isidiny chrámy začaly šířit i mimo Egypt. Na mnoha místech její stoupenci převzali uctívání semitské bohyně Astarty, a to kvůli podobnosti jmen. V helénistické době se stala také bohyní, která chránila námořníky.
Ve všech částech řecko-římského světa se Isis stala jednou z nejvýznamnějších postav „mysterijních náboženství“ a mnozí klasičtí spisovatelé někdy psali o jejích chrámech i následovnících. Chrámy Isidě byly postaveny v Iráku, Řecku, Římě, dokonce až v severní Anglii, kde byly u Hadriánova valu nalezeny pozůstatky chrámu. Ve Philae byla uctívána až do 6. století, po nástupu křesťanství. Obvykle se říká, že pád jejích chrámů znamenal konec starověkého Egypta.
