Lynn Margulis, (narozena 5. března 1938, Chicago, Illinois, USA – zemřela 22. listopadu 2011, Amherst, Massachusetts), americká bioložka, jejíž sériová endosymbiotická teorie vývoje eukaryotických buněk způsobila převrat v moderním pojetí vzniku života na Zemi.
Margulis vyrůstala v Chicagu. Intelektuálně předčasně vyspělá absolvovala v roce 1957 bakalářské studium na Chicagské univerzitě. Brzy poté se provdala za amerického astronoma Carla Sagana, s nímž měla dvě děti; jedno z nich, Dorion, se stalo jejím častým spolupracovníkem. Manželé se rozvedli v roce 1964. Margulisová získala v roce 1960 magisterský titul v oboru zoologie a genetiky na Wisconsinské univerzitě v Madisonu a v roce 1965 doktorát z genetiky na Kalifornské univerzitě v Berkeley. V roce 1966 nastoupila na katedru biologie Bostonské univerzity, kde vyučovala až do roku 1988, kdy byla jmenována významnou univerzitní profesorkou na katedře botaniky Massachusettské univerzity v Amherstu. Tento titul si ponechala i poté, co se její příslušnost k univerzitě v roce 1993 změnila na katedru biologie a následně v roce 1997 na katedru geověd.
Po většinu své kariéry byla Margulisová svými kolegy, kteří prosazovali tradiční darwinistický přístup k biologii „přežití nejsilnějších“, považována za radikála. Její myšlenky, které se zaměřovaly na symbiózu – životní uspořádání dvou různých organismů ve spojení, které může být buď prospěšné, nebo nepříznivé – byly často přijímány skepticky, a dokonce nepřátelsky. Mezi její nejvýznamnější práce patřilo vypracování sériové endosymbiotické teorie (SET) vzniku buněk, podle níž se eukaryotické buňky (buňky s jádrem) vyvinuly symbiotickým spojením bakterií bez jádra, které předtím existovaly samostatně. Podle této teorie jsou mitochondrie a chloroplasty, dvě hlavní organely eukaryotických buněk, potomky kdysi volně žijících bakteriálních druhů. Tento koncept vysvětlila ve své první knize Origin of Eukaryotic Cells (1970). V té době byla její teorie považována za přitaženou za vlasy, ale od té doby byla široce přijata. Rozvinula ji ve své klasické knize Symbiosis in Cell Evolution (Symbióza v evoluci buněk) z roku 1981, kde navrhla, že další symbiotické spojení buněk s bakteriemi – tentokrát spirochetami, typem bakterií, které se rychle vlní – se vyvinulo ve vnitřní dopravní systém jaderné buňky. Margulisová dále postulovala, že eukaryotické řasinky byly původně také spirochety a že cytoplazma se vyvinula ze symbiotického vztahu mezi eubakteriemi a archeobakteriemi (viz archea).
Její kniha Five Kingdoms (Pět říší) z roku 1982, kterou napsala společně s americkou bioložkou Karlene V. Schwartzovou, formuluje systém pěti říší pro klasifikaci života na Zemi – živočichů, rostlin, bakterií (prokaryot), hub a prvoků. Říše protistů, která zahrnuje většinu jednobuněčných organismů (a mnohobuněčných řas) v jiných systémech, je odmítnuta jako příliš obecná. Mnoho organismů obvykle řazených mezi protisty je řazeno do jedné z ostatních čtyř říší; protoktisté tvoří zbývající organismy, které jsou všechny vodní a zahrnují řasy a slizovce. Margulis editoval části kompendia Handbook of Protoctista (1990).
Další oblastí zájmu Margulisové byla její dlouholetá spolupráce s britským vědcem Jamesem Lovelockem na kontroverzní hypotéze Gaia. Ta navrhuje, že na Zemi lze pohlížet jako na jediný samoregulující se organismus – tedy komplexní entitu, jejíž živé a anorganické prvky jsou na sobě vzájemně závislé a jejíž životní formy aktivně modifikují prostředí tak, aby si udržely příznivé podmínky.
Kromě vědeckých publikací Margulisová napsala řadu knih, v nichž interpretovala vědecké koncepty a hádanky pro populární publikum. Patří mezi ně například Mystery Dance: O vývoji lidské sexuality (1991), Co je život? (1995), What Is Sex? (1997) a Oslňovat postupně: (2007), které napsala společně se svým synem. Napsala také knihu povídek Svítící ryby (2007). Její pozdější počiny vyšly pod hlavičkou Sciencewriters Books nakladatelství Chelsea Green Publishing, které spoluzaložila s Dorionem v roce 2006.
Margulisová byla v roce 1983 zvolena do Národní akademie věd a byla jednou ze tří amerických členů Ruské akademie přírodních věd. V roce 1999 jí byla udělena cena Williama Proctera mezinárodní vědecké společnosti Sigma Xi a americká Národní medaile za vědu. V roce 2008 obdržela Darwin-Wallaceovu medaili Linneovy společnosti v Londýně. Spolu s Dorionem byla spoluautorkou článku o životě v Encyclopædia Britannica.
.
