Ve většině skupin samec po úspěšném přiblížení k samici a jejím nasednutí vloží levý pedipalp do levého otvoru pohlavních orgánů a pravý pedipalp do pravého otvoru. U některých primitivních pavouků (např. haplogynů, mygalomorfů) a několika dalších vkládá samec do genitální štěrbiny samice oba pedipalpy současně.
Samičí genitální struktura neboli epigynum je zpevněná destička na spodní straně břicha před gonoporem. Po přenosu spermií do epigynum se spermie přesouvají do schránek (spermatek), které se spojují s vejcovody. Vajíčka jsou oplodněna při průchodu vejcovody a ven gonoporem.
Síla, která způsobuje vstřikování spermií z pedipalpu samce do schránky samice, nebyla s jistotou zjištěna, ale může se jednat o zvýšený krevní tlak rozšiřující měkkou cévní tkáň (hematodocha) mezi tvrdými destičkami pedipalpu. To způsobí, že se baňkovitá struktura obsahující kanálek stočí a zahákne do epigynum samice a vstříkne spermie, jako by byly vytlačovány z baňkové injekční stříkačky.
Páření může u některých druhů trvat jen několik sekund, u jiných však hodiny. Někteří samci si dobíjejí pedipalpy a páří se znovu se stejnou samicí. Po páření samci některých druhů potírají epigynum sekretem, tzv. epigynální zátkou, která brání samici v druhém páření. Samci pavouků obvykle umírají brzy po páření nebo dokonce během něj. Samice jednoho evropského druhu sklípkana se zakousne do břicha samce a drží se ho během páření. Některé samice sice po páření samce sežerou, ale tato praxe není běžná. Například samec černé vdovy (rod Latrodectus) obvykle umírá několik dní po páření, i když občas je po páření tak slabý, že ho samice chytí a sežere. Předpokládá se, že samci pavouků rodu Nephilengys malabarensis z jihovýchodní Asie a jihozápadního Pacifiku unikají sexuálnímu kanibalismu díky kopulaci na dálku, při níž se kopulační orgán samce během páření oddělí a zůstává v samici, což umožňuje delší přenos spermatu. Samice některých druhů se páří pouze jednou, zatímco jiné se páří několikrát se stejným samcem nebo se páří s několika různými samci. Dlouhověké samice mygalomorfních pavouků se musí pářit opakovaně, protože jednou až dvakrát ročně svlékají kůži včetně výstelky spermatéky.
.
