Efter at have arbejdet som lektor og senere som professor ved State University of New York i Buffalo blev han ansat ved National Institutes of Health i 1984.
EST-kontroversenRediger
Mens han var ansat ved NIH, lærte Venter at identificere mRNA og begyndte at lære mere om de mRNA’er, der udtrykkes i den menneskelige hjerne. De korte cDNA-sekvensfragmenter, som han var interesseret i, kaldes udtrykte sekvensmærker eller EST’er. NIH’s kontor for teknologioverførsel og Venter besluttede at tage de EST’er, som andre havde opdaget, til sig i et forsøg på at patentere de gener, der blev identificeret på grundlag af undersøgelser af mRNA-ekspression i den menneskelige hjerne. Da Venter afslørede denne strategi under en høring i Kongressen, udbrød der en storm af kontroverser. NIH stoppede senere indsatsen og opgav de patentansøgninger, som det havde indgivet, efter offentlighedens ramaskrig.
Human Genome ProjectRediger
Venter var passioneret omkring genomforskningens evne til at ændre sundhedsvæsenet radikalt. Venter mente, at shotgun-sekventering var den hurtigste og mest effektive måde at få brugbare data om det menneskelige genom på. Metoden blev imidlertid afvist af Human Genome Project, da nogle genetikere mente, at den ikke ville være præcis nok til et så kompliceret genom som menneskets, at den ville være logistisk vanskeligere, og at den ville koste betydeligt mere.
Venter så den langsomme fremgang i Human Genome Project som en mulighed for at fortsætte sin interesse for at patentere gener, så han søgte finansiering fra den private sektor for at starte Celera Genomics. Virksomheden planlagde at tjene på deres arbejde ved at skabe genomiske data, som brugerne kunne abonnere på mod et gebyr. Målet lagde følgelig pres på det offentlige genomprogram og ansporede flere grupper til at fordoble deres indsats for at fremstille den fulde sekvens. Venters indsats gav ham berømmelse, da han og hans team hos Celera Corporation delte æren for at have sekventeret det første udkast til det menneskelige genom sammen med det offentligt finansierede Human Genome Project.
I 2000 annoncerede Venter og Francis Collins fra National Institutes of Health og U.S. Public Genome Project i fællesskab kortlægningen af det menneskelige genom, hele tre år før den forventede afslutning af Public Genome Program. Meddelelsen blev givet sammen med USA’s præsident Bill Clinton og den britiske premierminister Tony Blair. Venter og Collins delte således en pris for “Årets biografi” fra A&E Network.Den 15. februar 2001 offentliggjorde konsortiet for Human Genome Project det første menneskelige genom i tidsskriftet Nature, efterfulgt af en Celera-publikation i Science dagen efter. På trods af nogle påstande om, at shotgun-sekventering på nogle måder var mindre præcis end den klon-for-klon-metode, der blev valgt af Human Genome Project, blev teknikken bredt accepteret af det videnskabelige samfund.
Venter blev fyret af Celera i begyndelsen af 2002. Ifølge hans biografi blev Venter fyret på grund af en konflikt med hovedinvestoren, Tony White, som specifikt udelukkede ham fra at deltage i ceremonien i Det Hvide Hus, hvor man fejrede, at det var lykkedes at sekventere det menneskelige genom.
Global Ocean Sampling ExpeditionEdit
The Global Ocean Sampling Expedition (GOS) er et genomprojekt til udforskning af havet med det formål at vurdere den genetiske diversitet i marine mikrobielle samfund og at forstå deres rolle i naturens grundlæggende processer. Venter startede som et pilotprojekt for prøveudtagning i Sargassohavet i august 2003 og annoncerede den 4. marts 2004, at ekspeditionen ville blive fuldt udbygget. Projektet, som benyttede Venters personlige yacht, Sorcerer II, startede i Halifax, Canada, gik rundt om jorden og vendte tilbage til USA i januar 2006.
Synthetic GenomicsEdit
I juni 2005 var Venter medstifter af Synthetic Genomics, et firma, der har til formål at anvende modificerede mikroorganismer til at fremstille rent brændstof og biokemikalier. I juli 2009 annoncerede ExxonMobil et samarbejde på 600 millioner dollars med Synthetic Genomics om forskning i og udvikling af næste generation af biobrændstoffer. Venter arbejder fortsat på at skabe manipulerede diatomiske mikroalger til produktion af biobrændstoffer.
Venter forsøger at få patent på den første delvist syntetiske art, der muligvis skal hedde Mycoplasma laboratorium. Der spekuleres i, at denne forskningslinje kan føre til produktion af bakterier, der er blevet manipuleret til at udføre specifikke reaktioner, f.eks. til at producere brændstof, fremstille medicin, bekæmpe den globale opvarmning osv.
I maj 2010 lykkedes det for et hold forskere under ledelse af Venter som de første at skabe det, der blev beskrevet som “syntetisk liv”. Dette blev gjort ved at syntetisere et meget langt DNA-molekyle, der indeholder et helt bakteriegenom, og introducere dette i en anden celle, analogt med den bedrift, som Eckard Wimmers gruppe opnåede, hvor de syntetiserede og ligerede et RNA-virusgenom og “bootede” det i cellelysat. Den encellede organisme indeholder fire “vandmærker”, der er skrevet ind i dens DNA for at identificere den som syntetisk og for at hjælpe med at spore dens efterkommere. Vandmærkerne omfatter
- Kodetabel for hele alfabetet med tegnsætning
- Navne på 46 medvirkende forskere
- Tre citater
- Den hemmelige e-mail-adresse for cellen.
Den 25. marts 2016 rapporterede Venter om skabelsen af Syn 3.0, et syntetisk genom, der har de færreste gener af alle frit levende organismer (473 gener). Deres mål var at fjerne alle ikke-væsentlige gener og kun efterlade det minimale sæt, der er nødvendigt for at opretholde livet.
Denne afpudsede, hurtigt reproducerende celle forventes at blive et værdifuldt redskab for forskere på området.
I august 2018 trak Venter sig tilbage som bestyrelsesformand og sagde, at han ønskede at fokusere på sit arbejde på J. Craig Venter Institute. Han vil forblive som videnskabelig rådgiver for bestyrelsen.
J. Craig Venter InstituteRediger
Venter er i øjeblikket administrerende direktør for J. Craig Venter Institute, en nonprofitorganisation, der udfører forskning i syntetisk biologi. Venter grundlagde organisationen i 2006. Det har faciliteter i La Jolla og i Rockville, Maryland, og beskæftiger over 200 medarbejdere.
Individuelt menneskeligt genomRediger
Den 4. september 2007 offentliggjorde et hold under ledelse af Sam Levy et af de første genomer af et individuelt menneske-Venters egen DNA-sekvens. Nogle af sekvenserne i Venters genom er forbundet med vådt ørevoks, øget risiko for antisocial adfærd, Alzheimers sygdom og hjerte-kar-sygdomme. Denne publikation var især interessant, fordi den forsøgte at adskille de to haplotyper (de to kopier af hvert kromosom), selv om det kun lykkedes i begrænset omfang. Genomet som offentliggjort havde kun 3 milliarder baser, i stedet for de fulde 6 milliarder, som en fuldt diploid sekvens ville omfatte. Der gik yderligere 10 år, før de første haplotypeopløste menneskelige genomer begyndte at dukke op.
The Human Reference Genome Browser er et webprogram til navigation og analyse af Venters nyligt offentliggjorte genom. HuRef-databasen består af ca. 32 millioner DNA-reads sekventeret ved hjælp af mikrofluidisk Sanger-sekventering, samlet i 4 528 scaffolds og 4,1 millioner DNA-variationer identificeret ved genomanalyse. Disse varianter omfatter enkelt-nucleotid-polymorfismer (SNP’er), blok-substitutioner, korte og store indels og strukturelle variationer som insertioner, deletioner, inversioner og ændringer i antallet af kopier.
Browseren gør det muligt for forskere at navigere i HuRef-genomsamlingen og sekvensvariationer og at sammenligne den med NCBI human build 36-samlingen i forbindelse med NCBI- og Ensembl-annotationer. Browseren giver en sammenlignende visning mellem NCBI- og HuRef-konsensussekvenser, sekvensmultialignering af HuRef-sammensætningen, Ensembl- og dbSNP-annotationer, HuRef-varianter og de underliggende variantbeviser og den funktionelle analyse. Grænsefladen repræsenterer også de haplotypeblokke, hvorfra diploide genomsekvenser kan udledes, og forholdet mellem varianter og genannotationer. Visningen af varianter og genannotationer er knyttet til eksterne offentlige ressourcer, herunder dbSNP, Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) og Gene Ontology (GO).
Brugerne kan søge i HuRef-genomet ved hjælp af HUGO-gennavne, Ensembl- og dbSNP-identifikatorer, HuRef-contig- eller scaffold-placeringer eller NCBI-kromosomplaceringer. Brugerne kan derefter nemt og hurtigt gennemse enhver genomisk region via de enkle og intuitive panorerings- og zoomkontroller; desuden kan data, der er relevante for specifikke loci, eksporteres med henblik på yderligere analyse.
Human Longevity, Inc.Edit
Den 4. marts 2014 annoncerede Venter og medstifterne Peter Diamandis og Robert Hariri dannelsen af Human Longevity, Inc. et selskab, der fokuserer på at forlænge den sunde, “højtydende” menneskelige levetid. På tidspunktet for annonceringen havde virksomheden allerede rejst 70 millioner dollars i venturefinansiering, som forventedes at vare 18 måneder. Venter fungerede som bestyrelsesformand og administrerende direktør (CEO) indtil maj 2018, hvor han trak sig tilbage. Virksomheden sagde, at den planlægger at sekventere 40.000 genomer om året med et indledende fokus på kræftgenomer og kræftpatienters genomer.
Human Longevity indgav i 2018 en retssag mod Venter og anklagede ham for at stjæle forretningshemmeligheder. Der blev fremsat beskyldninger om, at Venter havde forladt virksomheden med sin computer, der indeholdt værdifulde oplysninger, som kunne bruges til at starte en konkurrerende virksomhed.Retssagen blev i sidste ende afvist af en californisk dommer med den begrundelse, at Human Longevity ikke var i stand til at fremlægge en sag, der opfyldte den juridiske tærskel, der kræves for, at en virksomhed eller en person kan sagsøge, når dens forretningshemmeligheder er blevet stjålet.
Human Longevitys mission er at forlænge menneskers sunde levetid ved hjælp af big data-diagnostik med høj opløsning fra genomik, metabolomik, mikrobiomik og proteomik samt ved hjælp af stamcelleterapi.