Mubarak blev såret under mordet på præsident Sadat i oktober 1981 af soldater under ledelse af løjtnant Khalid Islambouli. Efter Sadats død blev Mubarak den fjerde præsident i Egypten.
Egyptens tilbagevenden til Den Arabiske Liga
Idet øjeblik Libyen blev suspenderet fra Den Arabiske Liga i begyndelsen af den libyske borgerkrig, var Egypten den eneste stat i organisationens historie, der havde fået suspenderet sit medlemskab på grund af præsident Sadats fredsaftale med Israel. I juni 1982 mødtes Mubarak med kong Fahd af Saudi-Arabien, hvilket markerede begyndelsen til en egyptisk-saudisk tilnærmelse. Da Egypten er det mest folkerige arabiske land og Saudi-Arabien det rigeste, var den saudisk-egyptiske akse en magtfuld kraft i den arabiske verden. På et topmøde i Den Arabiske Liga senere i 1982 i Fez fremlagde Saudi-Arabien en egyptisk fredsplan, hvor hele den arabiske verden til gengæld for, at Israel løste den israelsk-palæstinensiske konflikt ved at tillade en palæstinensisk stat, ville slutte fred med Israel.
Den Islamiske Republik Iran havde fra 1979 og fremefter gjort krav på at være leder af den islamiske verden, og især Ayatollah Khomeini havde opfordret til at vælte regeringerne i Irak, Saudi-Arabien, Kuwait og andre arabiske stater langs den Persiske Golfs sydlige kyster, idet han kaldte disse stater illegitime. Ayatollah Khomeinis krav om at være den islamiske verdens retmæssige leder og hans forsøg på at eksportere den iranske revolution ved at arbejde for at vælte regeringer, som Khomeini anså for at være uislamiske, skabte dyb bekymring og frygt i de regeringer, der var mål for denne revolution, såsom Irak og Saudi-Arabien. I lyset af den iranske udfordring så de andre arabiske stater på Egypten som en allieret. For kong Fahd af Saudi-Arabien og de andre ledere af de arabiske Golfstater trådte den israelsk-palæstinensiske konflikt i baggrunden, og den vigtigste bekymring var at modstå Irans krav om at være leder af den islamiske verden, hvilket betød, at Egypten ikke kunne ignoreres.
Under krigen mellem Iran og Irak fra 1980 til 1988 støttede Egypten Irak militært og økonomisk med en million egyptere, der arbejdede i Irak for at erstatte de irakiske mænd, der tjente i frontlinjen. I december 1983 bød Mubarak Yasser Arafat fra PLO velkommen til et topmøde i Kairo, hvilket markerede en tilnærmelse til PLO, og fra det tidspunkt blev Egypten PLO’s vigtigste allierede. I 1985 forårsagede Achille Lauro-kapringen en større krise i forbindelserne, da det amerikanske luftvåben tvang et EgyptAir-fly med Achille Lauro-kaprerne på vej til Tunesien til at lande i Italien; ellers ville flyet være blevet skudt ned. Mubarak udtalte på en pressekonference den 12. oktober 1985: “Jeg er meget såret. Nu er der kølighed og anspændthed som følge af denne hændelse.” Egypten var blevet udstødt af de andre arabiske stater for at have underskrevet Camp David-aftalerne i 1979, men Egyptens vægt i den arabiske verden havde ført til, at Egypten i 1989 havde genvundet sin “centrale plads i den arabiske verden”. I 1989 blev Egypten igen optaget som fuldgyldigt medlem af Den Arabiske Liga, og Ligaens hovedkvarter blev flyttet til sin oprindelige placering i Kairo.
Regeringsstil
Igennem 1980’erne øgede Mubarak produktionen af boliger, tøj, møbler og medicin til overkommelige priser. Da han blev præsident, var Mubarak en af de få egyptiske embedsmænd, der nægtede at besøge Israel og lovede at indtage en mindre entusiastisk holdning til normaliseringen af forbindelserne med den israelske regering. Under Mubarak skrev israelske journalister ofte om den “kolde fred” med Egypten, idet de konstaterede, at de israelsk-egyptiske forbindelser i bedste fald var frosne. Mubarak var hurtig til at benægte, at hans politik ville resultere i vanskeligheder for de egyptisk-israelske forbindelser i fremtiden.
Den israelske historiker major Efraim Karsh skrev i 2006, at i Egypten “… talrige artikler, videnskabelige skrifter, bøger, karikaturtegninger, offentlige udtalelser og radio- og tv-programmer, bliver jøderne malet i de sorteste termer, man kan forestille sig”. Karsh beskyldte Mubarak for at være personligt antisemitisk og skrev, at han “tydeligvis delte præmisserne” for sin propaganda.
Egypten fortsatte under Mubarak sin store afhængighed af amerikansk bistand og sit håb om amerikansk pres på Israel for at opnå en palæstinensisk løsning. Han forbedrede stille og roligt forbindelserne med det tidligere Sovjetunionen. I 1987 vandt Mubarak et valg til en anden seksårig periode.
I sine første år ved magten udvidede Mubarak den egyptiske statslige efterforskningstjeneste (Mabahith Amn ad-Dawla) og de centrale sikkerhedsstyrker (antioprørs- og inddæmningsstyrker). Ifølge Tarek Osman kan oplevelsen af at se sin forgænger blive myrdet “lige foran ham” og hans lange militærkarriere – som var længere end Nasser og Sadats – have givet ham mere fokus og optagethed af sikkerhed, end det syntes at være tilfældet med de sidstnævnte statsoverhoveder. Mubarak søgte råd og tillid ikke hos ledende ministre, ledende rådgivere eller førende intellektuelle, men hos sine sikkerhedschefer – “indenrigsministre, hærchefer og cheferne for de yderst indflydelsesrige efterretningstjenester”. Gennem hele 1980’erne, 1990’erne og 2000’erne blev sikkerhedstjenesternes krænkelser af menneskerettighederne i Egypten beskrevet som “systematiske” af Amnesty International. I 2007 rapporterede Amnesty International, at det egyptiske politi rutinemæssigt udøvede “prygl, elektriske stød, langvarig suspension i håndled og ankler i forvredne stillinger, dødstrusler og seksuelt misbrug”. Staten forblev stor under Mubarak, der beskæftigede 8 millioner mennesker ud af en befolkning på 75 millioner.
På grund af sine holdninger mod islamisk fundamentalisme og sit diplomati over for Israel var Mubarak mål for gentagne mordforsøg. Ifølge BBC overlevede Mubarak seks attentatforsøg. I juni 1995 var der angiveligt et attentatforsøg med skadelige gasser og egyptisk islamisk Jihad, mens Mubarak var i Etiopien til en konference i Organisationen for Afrikansk Enhed. Han blev angiveligt også såret af en knivbevæbnet gerningsmand i Port Said i september 1999.
Golfkrigen i 1991
Egypten var medlem af den allierede koalition under Golfkrigen i 1991; egyptisk infanteri var nogle af de første, der gik i land i Saudi-Arabien for at fjerne irakiske styrker fra Kuwait. Egyptens deltagelse i krigen befæstede landets centrale rolle i den arabiske verden og gav den egyptiske regering økonomiske fordele. Der blev i nyhedsmedierne offentliggjort rapporter om gældseftergivelse på op til 20 milliarder USD. Ifølge The Economist:
Programmet virkede som en charme: et skolebogstilfælde, siger The. Faktisk var heldet på Hosni Mubaraks side; da USA var på jagt efter en militær alliance for at tvinge Irak ud af Kuwait, gik Egyptens præsident uden tøven med. Efter krigen var hans belønning, at USA, de arabiske stater i Den Persiske Golf og Europa eftergav Egypten en gæld på omkring 20 mia. dollars.
Standpunkt om invasionen af Irak i 2003
President Mubarak udtalte sig imod invasionen af Irak i 2003 og argumenterede, at den israelsk-palæstinensiske konflikt skulle have været løst først. Han sagde også, at krigen ville medføre “100 Bin Laden’er”. Som præsident støttede han dog ikke en øjeblikkelig amerikansk tilbagetrækning fra Irak, fordi han mente, at det sandsynligvis ville føre til kaos.
2005-valg
Præsident Mubarak blev genvalgt ved flertalsafstemninger i en folkeafstemning for flere på hinanden følgende perioder fire gange i 1987, 1993 og 1999. Hver gang sikrede Mubarak sig sin stilling ved at lade sig opstille af parlamentet og derefter blive bekræftet uden opposition ved en folkeafstemning.
Valget i september 2005 var et valg med flere kandidater og ikke en folkeafstemning, men valginstitutionerne og sikkerhedsapparatet er fortsat under præsidentens kontrol. Den 28. juli 2005 meddelte Mubarak sit kandidatur. Valget var planlagt til den 7. september 2005; ifølge de civile organisationer, der observerede valget, var det behæftet med omfattende manipulationsaktiviteter. I et skridt, der i vid udstrækning blev opfattet som politisk forfølgelse, blev Ayman Nour, en dissident og kandidat for El-Ghad-partiet (“morgendagens parti”), dømt for falskneri og idømt fem års hårdt arbejde den 24. december 2005.
Statslig korruption under Mubaraks præsidentperiode
Mens han var ved magten, steg den politiske korruption i Mubarak-regeringens indenrigsministerium dramatisk. Politiske personligheder og unge aktivister blev fængslet uden rettergang. Der blev oprettet ulovlige, udokumenterede, skjulte tilbageholdelsesfaciliteter, og universiteter, moskeer og avismedarbejdere blev afvist på grund af deres politiske holdninger.
I 2005 rapporterede Freedom House, en ikke-statslig organisation, der forsker i demokrati, at den egyptiske regering under Mubarak udvidede bureaukratiske regler, registreringskrav og anden kontrol, der ofte giver næring til korruption. Freedom House sagde, at “korruption forblev et betydeligt problem under Mubarak, som lovede at gøre meget, men i virkeligheden aldrig gjorde noget væsentligt for at tackle det effektivt”.
I 2010 vurderede Transparency Internationals Corruption Perceptions Index-rapport Egypten med en CPI-score på 3,1, baseret på opfattelser af graden af korruption fra forretningsfolk og landeanalytikere, hvor 10 er meget ren og 0 er meget korrupt. Egypten lå på en 98. plads ud af de 178 lande, der indgik i rapporten.
Rigdom og beskyldninger om personlig korruption
I februar 2011 rapporterede ABC News, at eksperter mente, at Mubarak og hans families personlige rigdom var på mellem 40 og 70 milliarder USD fra militærkontrakter indgået i hans tid som officer i luftvåbnet. The Guardian rapporterede, at Mubarak og hans familie kunne være op til 70 milliarder amerikanske dollars værd, der stammer fra korruption, bestikkelse og legitime forretningsaktiviteter. Pengene skulle være fordelt på forskellige bankkonti, herunder nogle i Schweiz og Storbritannien, og investeret i udenlandske ejendomme. Avisen sagde, at nogle af oplysningerne om familiens rigdom kan være ti år gamle. Ifølge Newsweek er disse påstande dårligt underbyggede og mangler troværdighed.
Den 12. februar 2011 meddelte den schweiziske regering, at den indefrøs Mubaraks og hans families schweiziske bankkonti. Den 20. februar 2011 beordrede den egyptiske generalanklager, at Mubaraks og hans hustru Suzannes, hans sønner Alaa og Gamal Mubaraks samt hans svigerdøtre Heidi Rasekh og Khadiga Gamal’s aktiver blev indefrosset. Den offentlige anklager beordrede også den egyptiske udenrigsminister til at videreformidle dette til andre lande, hvor Mubarak og hans familie kunne have aktiver. Denne ordre kom to dage efter, at egyptiske aviser rapporterede, at Mubarak havde indgivet sin regnskabserklæring. Egyptiske regler kræver, at regeringsembedsmænd skal indsende en økonomisk redegørelse med en liste over deres aktiver og indkomstkilder, mens de udfører regeringsarbejde. Den 21. februar 2011 sagde det egyptiske militærråd, som midlertidigt fik overdraget præsidentens beføjelser efter revolutionen den 25. januar 2011, at det ikke havde nogen indvendinger mod en retssag mod Mubarak for korruption.
Den 23. februar 2011 rapporterede den egyptiske avis Eldostor, at en “kyndig kilde” beskrev generalanklagerens ordre om at indefryse Mubaraks aktiver og truslerne om en retssag som intet andet end et signal til Mubarak om at forlade Egypten, efter at der var gjort en række forsøg på at tilskynde ham til at forlade landet frivilligt. I februar 2011 rapporterede Voice of America, at Egyptens øverste anklager havde beordret et rejseforbud og en indefrysning af aktiver for Mubarak og hans familie, mens han overvejede yderligere tiltag. Den 21. maj 2014 dømte en domstol i Kairo Mubarak og hans sønner for at have underslæbt statsmidler svarende til 17,6 mio. USD, som var afsat til renovering og vedligeholdelse af præsidentpaladser, men som i stedet blev omdirigeret til at opgradere private familieboliger. Retten beordrede tilbagebetaling af 17,6 mio. USD, idømte trioen en bøde på 2,9 mio. USD og idømte Mubarak tre års fængsel og hver af hans sønner fire års fængsel.
Presidentsuccession
I 2009 sagde den amerikanske ambassadør Margaret Scobey, at “på trods af uophørlige hviskede diskussioner har ingen i Egypten nogen sikkerhed om, hvem der i sidste ende vil efterfølge Mubarak eller under hvilke omstændigheder”. Hun sagde, at præsidentens søn Gamal Mubarak var den mest sandsynlige efterfølger; nogle mente, at efterretningschef Omar Suleiman kunne søge embedet, eller at Den Arabiske Ligas generalsekretær Amr Moussa kunne stille op. Præsident Mubarak og hans søn afviste dette; de sagde, at “et valgsystem med flere kandidater, der blev indført i 2005, har gjort den politiske proces mere gennemsigtig”. Journalisten Abiodun Awolaja fra Nigerian Tribune beskrev en eventuel efterfølger for Gamal Mubarak som et “arveligt pseudomonarki.”
Det Nationale Demokratiske Parti i Egypten fortsatte med at erklære, at Hosni Mubarak skulle være partiets eneste kandidat ved præsidentvalget i 2011. Mubarak sagde den 1. februar 2011, at han ikke havde til hensigt at stille op til præsidentvalget i 2011. Da denne erklæring ikke fik protesterne til at falde til ro, erklærede Mubaraks vicepræsident, at Gamal Mubarak ikke ville stille op til præsidentvalget. Med optrapningen af demonstrationerne og Mubaraks fald sagde Hamdy El-Sayed, en tidligere indflydelsesrig person i Det Nationale Demokratiske Parti, at Gamal Mubarak havde til hensigt at tilrane sig præsidentposten, bistået af den daværende indenrigsminister Habib El-Adly.
Israelsk-palæstinensisk konflikt
Under sin præsidentperiode fastholdt Mubarak den af USA formidlede Camp David-aftale, der blev underskrevet mellem Egypten og Israel i 1978. Mubarak var ved lejlighed også vært for møder vedrørende den israelsk-palæstinensiske konflikt og gjorde en række forsøg på at fungere som mægler mellem de to parter. Mubarak var bekymret for, at rabbiner Menachem M. Schneerson ikke havde tillid til ham i dette spørgsmål, og han overvejede at mødes med ham i New York.
I oktober 2000 var Mubarak vært for et haste-topmøde i Sharm el-Sheikh for at drøfte den israelsk-palæstinensiske konflikt. Deltagerne var: USA’s præsident Bill Clinton, P.L.O.-formand Yasser Arafat, Israels premierminister Ehud Barak, kong Abdullah af Jordan, NATO’s generalsekretær Javier Solana og FN’s generalsekretær Kofi Annan.
Mubarak var involveret i Den Arabiske Liga og støttede de arabiske bestræbelser på at opnå en varig fred i regionen. På topmødet i Beirut den 28. marts 2002 vedtog ligaen det arabiske fredsinitiativ, en saudi-inspireret plan for at afslutte den arabisk-israelske konflikt.
I 2006 fordømte Mubarak det israelske militærangreb i Libanon, men kritiserede også indirekte Hizbollah for at skade arabiske interesser.
I juni 2007 holdt Mubarak et topmøde i Sharm el-Sheik med kong Abdullah II af Jordan, præsident Mahmoud Abbas og premierminister Ehud Olmert. Den 19. juni 2008 trådte den af Egypten mæglede pause i fjendtlighederne mellem Israel og Hamas i kraft. Ifølge New York Times respekterede ingen af parterne fuldt ud vilkårene i våbenhvilen.
Aftalen krævede, at Hamas skulle indstille raketangreb på Israel og håndhæve våbenhvilen i hele Gaza. Til gengæld forventede Hamas, at blokaden ville ophøre, at handelen i Gaza ville blive genoptaget, og at lastbiltransporterne ville blive genoprettet til 2005-niveauet. Israel knyttede en lempelse af blokaden til en reduktion af raketbeskydningen og genåbnede gradvist forsyningslinjerne og tillod omkring 90 daglige lastbiltransporter at komme ind i Gaza. Hamas kritiserede Israel for den fortsatte blokade, mens Israel beskyldte Hamas for fortsat våbensmugling via tunneler til Egypten og pegede på fortsatte raketangreb.
I 2009 forbød Mubaraks regering Kairos antikrigskonference, som havde kritiseret hans manglende handling mod Israel.
