Zuhlsdorf blev født i Minneapolis, Minnesota, i 1959. Som ung mand studerede han på University of Minnesota. Han var tidligere lutheraner, men siger, at hans omvendelse til katolicismen blev sat i gang efter at have hørt et stykke hellig polyfoni i radioen. Han blev præsteviet i Rom af pave Johannes Paul II den 26. maj 1991.
Efter præstevielsen deltog Zuhlsdorf i Patristic Institute Augustinianum, som uddelte en licentiat i hellig teologi.
Senere blev Zuhlsdorf en ugentlig klummeskribent for den traditionalistiske avis The Wanderer, og han har optrådt på EWTN og Fox News Channel. Siden 2011 har han skrevet en ugentlig klumme for Catholic Herald i Storbritannien. Han er bedst kendt for sin blog Fr. Z’s Blog (tidligere kaldet: What Does the Prayer Really Say?), hvor han kommenterer katolsk tradition og aktuelle kirkelige begivenheder, går ind for ærbødig fejring af de to autoriserede former for den romerske liturgi af messen, den post-Vatikan II-form og den tridentinske form fra 1962, og for vækst i bodssakramentet. “The Staggers”, bloggen fra det britiske magasin New Statesman, listede Zuhlsdorfs websted som en af de ti bedste kristne blogs i verden.
I september 2017, efter at Zuhlsdorf skrev et indlæg med titlen “Should a seminary headline a homosexualist activist as a speaker?” om et kommende foredrag af pater James Martin, SJ på Theological College, et seminarium beliggende ved, men uafhængigt af Catholic University of America. Martin blev genstand for kritik på nettet. To dage efter at indlægget blev offentliggjort, trak Theological College Martins invitation tilbage. Catholic University of America udsendte en erklæring, hvori de fordømte beslutningen om at aflyse.
I januar 2021 blev Zuhlsdorf involveret i en offentlig strid om hans udførelse af en live-streamet eksorcisme mod deltagere i optællingen af stemmer i USA’s Electoral College i 2021. Han sagde, at han havde fået tilladelse fra sin lokale ordinære, biskop Donald J. Hying, biskop i bispedømmet Madison, til at udføre eksorcismen, da den vedrørte valget. Hying bestred imidlertid denne udtalelse og sagde, at han havde givet Zuhlsdorf tilladelse til at bede eksorcismen mod COVID-19-pandemien og ikke til politisk aktivitet.
Zuhlsdorf er formand for Tridentine Mass Society of Madison, Wisconsin.
Den 16. januar 2021 meddelte bispedømmet Madison, at Zuhlsdorf havde truffet en fælles beslutning med Hying om at forlade sin stilling som præst der og flytte til et unavngivet nyt sted. Han forbliver i god kanonisk status og har til hensigt at fortsætte med at skrive sin blog. I henhold til kanonisk ret vil han skulle indhente fakulteter fra en anden biskop, før han kan begynde at præstere i hans jurisdiktion.
