I de fleste grupper, når det er lykkedes en han at nærme sig en hun og bestige hende, fører han sin venstre pedipalpe ind i den venstre åbning af hendes kønsorganer og den højre pedipalpe ind i den højre åbning. Hos nogle primitive edderkopper (f.eks. haplogyner, mygalomorfer) og nogle få andre indsætter hannen begge pedipalper samtidig i hunnens genitalspalte.
Hunnens genitalstruktur, eller epigynum, er en hærdet plade på undersiden af bagkroppen foran gonoporen. Efter at sædcellerne er overført til epigynum, bevæger de sig ind i beholdere (spermathecae), der forbindes med ovidukterne. Æggene befrugtes, når de passerer gennem ovidukterne og ud gennem gonoporen.
Den kraft, der forårsager indsprøjtningen af sæd fra hannens pedipalpe til hunnens receptakel, er ikke fastslået med sikkerhed, men kan involvere et øget blodtryk, der udvider det bløde karvæv (hematodocha) mellem pedipalpernes hårde plader. Dette får en pæreformet struktur, der indeholder en kanal, til at vride sig og hænge fast i hunnens epigynum og injicere sædcellerne, som om de blev presset ud af en pæreformet sprøjte.
Parring kan tage kun få sekunder hos nogle arter, men timer hos andre. Nogle hanner genoplader deres pedipalper og parrer sig igen med den samme hun. Efter parringen smører hannerne hos nogle arter et sekret ud over epigynum, kaldet en epigynal prop, som forhindrer hunnen i at parre sig en anden gang. Hanedderkopper dør normalt kort efter eller endda under parringsprocessen. Hunnen af en europæisk kuglevæverart bider sig fast i hannens mave og holder fast under parringen. Selv om nogle hunner spiser hannen efter parringen, er denne praksis ikke almindelig. Hannen af den sorte enke (slægten Latrodectus) dør f.eks. normalt dage efter parringen, selv om han lejlighedsvis er så svag efter parringen, at han bliver fanget og spist af hunnen. Hannerne af Nephilengys malabarensis-edderkopper i Sydøstasien og det sydvestlige Stillehavsområde menes at undgå seksuel kannibalisme ved hjælp af fjernkopulation, hvor hannens kopulationsorgan løsnes under parringen og forbliver i hunnen, hvilket muliggør en længerevarende sædoverførsel. Hunnerne hos nogle arter parrer sig kun én gang, mens andre parrer sig flere gange med den samme han eller parrer sig med flere forskellige hanner. De langlivede hunner af mygalomorfe edderkopper skal parre sig gentagne gange, fordi de smider deres skind en eller to gange om året, herunder foringen af spermatekerne.