En ting er sikkert: Columbus var en meget dygtig sømand, navigatør og skibskaptajn. Han stolede på sine instinkter og beregninger og drog vestpå uden kort for at finde den nye verden. Han viste loyalitet over for sine mæcener, kongen og dronningen af Spanien, og de belønnede ham ved at give ham penge til at sende ham til den nye verden i alt fire gange. Der er dog ingen tvivl om, at han traf dårlige beslutninger og påvirkede de indfødte amerikanere negativt.
.
Atahualpa, den sidste konge af Inkariget, blev arresteret af kolonister.
“Ud over kontroversen om slaveri og voldeligt styre havde “udforskningstiden”, som Columbus ledede, den yderligere konsekvens, at den bragte nye sygdomme til den nye verden, som med tiden ville ødelægge de indfødte befolkninger på mange øer og samfund i den nye verden. I bredere forstand har historikere brugt udtrykket “columbiansk udveksling” til at beskrive den udveksling af planter, dyr og varer mellem øst og vest, som hans rejser satte i gang. Selv om virkningerne var udbredte og ikke alle kan afvises som negative, har kritikere af Columbus hævdet, at de værste aspekter af denne udveksling var lige så slemme som biologisk krigsførelse.” (A+E Networks, Columbus Controversy, 2009)
Eventually, his methods and actions caught up with Columbus. En række bosættere lobbyede mod ham ved den spanske domstol og beskyldte Columbus for dårlig ledelse. I 1500 sendte kongen og dronningen en kongelig administrator, som tilbageholdt Columbus og hans brødre og fik dem sendt hjem.
Og selv om Columbus genvandt sin frihed og foretog en fjerde og sidste rejse til den nye verden, havde han mistet sit guvernørembede og en stor del af sin prestige.