Das Chautauqua County Jail ist eine Abteilung des Sheriff’s Office und steht unter der direkten Verantwortung von Sheriff James B. Quattrone. Der Sheriff wird von den registrierten Wählern des Bezirks gewählt und ist gemäß der Verfassung des Staates New York für den Betrieb eines Gefängnisses, die Sicherheit des Bezirksgerichts und alle zivilen Angelegenheiten verantwortlich. Die Verwahrung und Betreuung der Gefangenen ist eine gewaltige Aufgabe und eine der wichtigsten Funktionen des Sheriffs. Um diese Aufgabe zu bewältigen, ernennt der Sheriff einen Gefängnisdirektor, der der oberste Verwaltungsbeamte des Gefängnisses ist.
Der Gefängnisdirektor beaufsichtigt den täglichen Betrieb der Einrichtung und wird dabei von einem dreiköpfigen Managementteam und sechs Schichtleitern unterstützt. Im Chautauqua County Jail sind sowohl Untersuchungshäftlinge untergebracht, die auf eine gerichtliche Entscheidung warten, als auch verurteilte Insassen, die für eine bestimmte Zeit zu einer Haftstrafe verurteilt wurden. Das Gefängnis nimmt auch Personen auf, die gegen die Bewährungsauflagen des Staates NYS verstoßen haben, sowie Personen, denen zivilrechtliche Straftaten vorgeworfen werden, z. B. die Nichtzahlung von Unterhaltszahlungen. Das Sheriffs Office nimmt Insassen des United States Marshals Office, der Einwanderungsbehörde und der Border Patrol auf und erhält dafür Einnahmen, die zur Deckung der Betriebskosten der Einrichtung beitragen.
