En la mayoría de los grupos, después de que un macho se haya acercado con éxito a una hembra y la haya montado, inserta su pedipalpo izquierdo en la abertura izquierda de su estructura genital y el pedipalpo derecho en la abertura derecha. En algunas arañas primitivas (por ejemplo, haplogines, megalomorfos) y en otras pocas, el macho inserta ambos pedipalpos simultáneamente en la hendidura genital de la hembra.
La estructura genital de la hembra, o epigino, es una placa endurecida en la parte inferior del abdomen, delante del gonoporo. Una vez que los espermatozoides se transfieren al epigino, pasan a receptáculos (espermatecas) que se conectan con los oviductos. Los óvulos son fecundados al pasar por los oviductos y salir por el gonoporo.
La fuerza que provoca la inyección de esperma desde el pedipalpo del macho al receptáculo de la hembra no se ha establecido con certeza, pero puede implicar un aumento de la presión sanguínea que expande el tejido vascular blando (hematodocha) entre las placas duras de los pedipalpos. Esto hace que una estructura bulbosa que contiene un conducto se retuerza y se enganche en el epigino de la hembra e inyecte los espermatozoides como si fueran exprimidos de una jeringa de bulbo.
El apareamiento puede requerir sólo segundos en algunas especies pero horas en otras. Algunos machos recargan sus pedipalpos y se aparean de nuevo con la misma hembra. Después del apareamiento, los machos de algunas especies untan una secreción sobre el epigino, llamada tapón epigínico, que impide a la hembra aparearse por segunda vez. Los machos suelen morir poco después, o incluso durante, el proceso de apareamiento. La hembra de una especie europea de araña del orbe muerde el abdomen del macho y lo retiene durante el apareamiento. Aunque algunas hembras se comen al macho después del apareamiento, esta práctica no es habitual. El macho de la viuda negra (género Latrodectus), por ejemplo, suele morir días después del apareamiento, aunque ocasionalmente está tan débil después del apareamiento que es capturado y comido por la hembra. Se cree que los machos de las arañas Nephilengys malabarensis del sudeste asiático y de la región del Pacífico sudoccidental escapan al canibalismo sexual mediante la cópula a distancia, en la que el órgano copulador del macho se desprende durante el apareamiento y permanece en la hembra, lo que permite una transferencia de esperma prolongada. Las hembras de algunas especies se aparean una sola vez, mientras que otras se aparean varias veces con el mismo macho o se aparean con varios machos diferentes. Las hembras longevas de las arañas megalomorfas deben aparearse repetidamente porque mudan su piel una o dos veces al año, incluyendo el revestimiento de las espermatecas.
