Una cosa es segura, Colón era un marinero, navegante y capitán de barco muy hábil. Confiando en sus instintos y cálculos, se dirigió al oeste sin un mapa para encontrar el nuevo mundo. Mostró lealtad a sus patrones, los Reyes de España, y éstos le recompensaron proporcionándole el dinero para enviarle al Nuevo Mundo un total de cuatro veces. Sin embargo, no cabe duda de que tomó malas decisiones e influyó negativamente en los nativos americanos.
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Atahualpa, el último rey del Imperio Inca, fue arrestado por los colonos.
«Además de la controversia sobre la esclavización y el gobierno violento, la «Era de la Exploración» que dirigió Colón tuvo la consecuencia adicional de llevar al Nuevo Mundo nuevas enfermedades que, con el tiempo, devastarían las poblaciones nativas de muchas islas y comunidades del Nuevo Mundo. En un sentido más amplio, los historiadores han utilizado la expresión «intercambio colombino» para describir el intercambio de plantas, animales y bienes entre Oriente y Occidente que suscitaron sus viajes. Aunque los efectos fueron generalizados y no pueden descartarse todos como negativos, los críticos de Colón han afirmado que los peores aspectos de este intercambio se sumaron a la guerra biológica». (A+E Networks, Columbus Controversy, 2009)
Con el tiempo, sus métodos y acciones alcanzaron a Colón. Varios colonos presionaron contra él en la corte española, acusando a Colón de mala gestión. En 1500, los reyes enviaron a un administrador real, que detuvo a Colón y a sus hermanos y los hizo volver a casa.
Aunque Colón recuperó su libertad y realizó un cuarto y último viaje al Nuevo Mundo, había perdido su gobernación y gran parte de su prestigio.
