Zuhlsdorf est né à Minneapolis, Minnesota, en 1959. Dans sa jeunesse, il a étudié à l’université du Minnesota. Anciennement luthérien, il dit que sa conversion au catholicisme a été déclenchée après avoir entendu un morceau de polyphonie sacrée à la radio. Il a été ordonné prêtre à Rome par le pape Jean-Paul II le 26 mai 1991.
Après son ordination, le père Zuhlsdorf a fréquenté l’Institut patristique Augustinianum, qui lui a conféré une licence de théologie sacrée.
Plus tard, Zuhlsdorf est devenu un chroniqueur hebdomadaire pour le journal traditionaliste The Wanderer, et est apparu sur EWTN et la chaîne Fox News Channel. Depuis 2011, il écrit une colonne hebdomadaire pour le Catholic Herald au Royaume-Uni. Il est surtout connu pour son blog Fr. Z’s Blog (anciennement nommé : What Does the Prayer Really Say ?), dans lequel il commente la tradition catholique et l’actualité de l’Église, plaide pour une célébration respectueuse des deux formes autorisées de la liturgie de la messe de rite romain, la forme post-Vatican II et la forme tridentine de 1962, et pour la croissance du sacrement de pénitence. « The Staggers », le blog du magazine britannique New Statesman, a listé le site de Zuhlsdorf comme l’un des dix meilleurs blogs chrétiens au monde.
En septembre 2017, après que Zuhlsdorf a écrit un post intitulé « Should a seminary headline a homosexualist activist as a speaker ? » à propos d’une conférence à venir du père James Martin, SJ au Theological College, un séminaire situé à l’Université catholique d’Amérique mais indépendant de celle-ci. Le père Martin a fait l’objet de critiques en ligne. Deux jours après la publication de l’article, le Theological College a retiré l’invitation du père Martin. L’Université catholique d’Amérique a publié une déclaration dénonçant la décision d’annulation.
En janvier 2021, Zuhlsdorf a été impliqué dans un différend public concernant son exécution d’un exorcisme diffusé en direct contre les participants au dépouillement des votes du Collège électoral des États-Unis en 2021. Il a déclaré avoir reçu l’autorisation de son ordinaire local, Mgr Donald J. Hying, l’évêque du diocèse de Madison, pour célébrer l’exorcisme en rapport avec l’élection. Cependant, Hying a contesté cette déclaration, disant qu’il avait accordé la permission à Zuhlsdorf de prier l’exorcisme contre la pandémie COVID-19, et non pour une activité politique.
Zuhlsdorf est président de la Société de la messe tridentine de Madison, Wisconsin.
Le 16 janvier 2021, le diocèse de Madison a annoncé que Zuhlsdorf avait pris une décision mutuelle avec Hying de quitter son poste de ministère là-bas, et de déménager dans un nouveau lieu non nommé. Il reste en règle sur le plan canonique et a l’intention de continuer à écrire son blog. Selon le droit canonique, il devra obtenir des facultés d’un autre évêque avant de commencer à exercer son ministère dans sa juridiction.
