Muitos deuses e deusas egípcios começaram em um só lugar, e ao longo de sua história tiveram sua própria cidade onde eram adorados, e muitas grandes cidades e vilas são conhecidas como as cidades natais de seus deuses ou deusas. No entanto, nenhuma cidade local onde Isis era adorada foi encontrada; durante toda a sua história inicial não existem templos conhecidos para ela. A adoração de Ísis não começou até tão tarde como a 30ª dinastia; até essa época Ísis era adorada em templos de outros deuses ou deusas. No entanto, mesmo na 30ª dinastia Isis foi adorada junto com Horus e Osíris. Os templos a Ísis tornaram-se comuns no tempo dos romanos. Havia um templo construído para ela em Filae.
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Nessa época, templos para Ísis começaram a se espalhar para fora do Egito. Em muitos lugares seus seguidores assumiram o culto à deusa semita Astarte, por causa da semelhança de nomes. Na era helenística, ela também se tornou a deusa que protegia os marinheiros.
Em todas as partes do mundo greco-romano, Ísis tornou-se uma das figuras mais importantes das “religiões misteriosas”, e muitos escritores clássicos às vezes escreviam sobre os seus templos, e seguidores. Templos para Ísis foram construídos no Iraque, Grécia, Roma, mesmo ao norte da Inglaterra, onde os restos de um templo foram encontrados na Muralha de Adriano. Em Filae, ela foi adorada até o século 6, após a ascensão do cristianismo. A queda dos seus templos é normalmente dita para marcar o fim do antigo Egito.