Kampanjat ja valloitukset
Kun Aleksanteri oli lähestymässä pohjoisen sotaretkensä loppua, hän sai uutisen, jonka mukaan kreikkalainen kaupunkivaltio Theeba oli pakottanut sinne linnoittautuneet makedonialaiset joukot ulos. Koska Aleksanteri pelkäsi kapinaa muiden kaupunkivaltioiden keskuudessa, hän tarttui toimeen ja marssitti massiivisen armeijansa – joka koostui 3 000 ratsuväestä ja 30 000 jalkaväestä – etelään aina Kreikan niemimaan kärkeen asti. Samaan aikaan Aleksanterin kenraali Parmenion oli jo matkalla Vähä-Aasiaan.
Aleksanteri joukkoineen saapui Theebaan niin nopeasti, ettei kaupunkivaltio ehtinyt koota liittolaisia puolustukseensa. Kolme päivää saapumisensa jälkeen Aleksanteri johti Theban verilöylyä. Aleksanteri toivoi, että Theban tuho toimisi varoituksena kapinaa harkitseville kaupunkivaltioille. Hänen pelottelutaktiikkansa osoittautui tehokkaaksi; muut Kreikan kaupunkivaltiot, Ateena mukaan lukien, päättivät joko sitoutua Makedonian valtakunnan liittoon tai pysyä puolueettomina.
Vuonna 334 Aleksanteri lähti aasialaiselle sotaretkelleen ja saapui Troijaan samana keväänä. Sen jälkeen Aleksanteri kohtasi Persian kuninkaan Dareios III:n armeijan lähellä Granciusjokea; Dareioksen joukot kukistettiin nopeasti. Syksyyn mennessä Aleksanteri ja hänen armeijansa olivat päässeet Vähä-Aasian etelärannikon yli Gordiumiin, jossa he lepäsivät talven yli. Kesällä 333 Aleksanterin ja Dareioksen joukot kohtasivat jälleen kerran Issuksessa. Vaikka Aleksanterin armeija oli alakynnessä, hän käytti sotastrategista taitoaan luodakseen kokoonpanoja, jotka voittivat persialaiset jälleen ja saivat Dareioksen pakenemaan. Marraskuussa 333 Aleksanteri julisti itsensä Persian kuninkaaksi vangittuaan Dareioksen ja tehtyään hänestä pakolaisen.
Seuraavaksi Aleksanterin asialistalla oli kampanja Egyptin valloittamiseksi. Piiritettyään Gazan matkalla Egyptiin Aleksanteri saavutti valloituksensa helposti; Egypti kaatui ilman vastarintaa. Vuonna 331 hän perusti Aleksandrian kaupungin, joka oli suunniteltu kreikkalaisen kulttuurin ja kaupan keskukseksi. Myöhemmin samana vuonna Aleksanteri kukisti persialaiset Gaugamelan taistelussa. Persian armeijan romahdettua Aleksanterista tuli ”Babylonin kuningas, Aasian kuningas, maailman neljän neljänneksen kuningas.”
Aleksanterin seuraava valloitusalue oli Itä-Iran, jonne hän loi makedonialaisia siirtokuntia ja valtasi vuonna 327 Ariamazesin linnoituksen. Vangittuaan prinssi Oxyartesin Aleksanteri meni naimisiin prinssin tyttären Rhoxanan kanssa.
Vuonna 328 Aleksanteri kukisti kuningas Poroksen armeijan Pohjois-Intiassa. Koska Aleksanteri oli vaikuttunut Poroksesta, hän palautti hänet kuninkaaksi ja voitti hänen uskollisuutensa ja anteeksiantonsa. Aleksanteri eteni itään Gangesille, mutta suuntasi takaisin, kun hänen armeijansa eivät suostuneet etenemään pidemmälle. Paluumatkalla Industa pitkin Aleksanteri haavoittui mallisotureiden toimesta.
Vuonna 325 Aleksanterin toipumisen jälkeen hän suuntasi armeijansa kanssa pohjoiseen pitkin karua Persianlahtea, jossa monet joutuivat sairauden, haavoittumisen ja kuoleman uhriksi. Helmikuussa 324 Aleksanteri saavutti vihdoin Suusan kaupungin. Halutessaan epätoivoisesti säilyttää johtoasemansa ja värvätä lisää sotilaita hän yritti yhdistää persialaisia aatelisia makedonialaisiin luodakseen hallitsevan luokan. Tätä varten hän määräsi Susassa, että suuri joukko makedonialaisia nai persialaisia prinsessoja. Kun Aleksanteri oli onnistunut värväämään armeijaansa kymmeniätuhansia persialaisia sotilaita, hän erotti monia nykyisistä makedonialaisista sotilaistaan. Tämä suututti sotilaat, jotka puhuivat kriittisesti Aleksanterin uusista joukoista ja tuomitsivat hänet persialaisten tapojen ja tottumusten omaksumisesta. Aleksanteri lepytti makedonialaisia sotilaita tappamalla 13 persialaista sotilasjohtajaa. Susan kiitosjuhla, jonka tarkoituksena oli ollut lujittaa persialaisten ja makedonialaisten välistä yhteyttä, muotoutui päinvastaiseksi.