Mubarak haavoittui luutnantti Khalid Islamboulin johtamien sotilaiden murhatessa presidentti Sadatin lokakuussa 1981. Sadatin kuoleman jälkeen Mubarakista tuli Egyptin neljäs presidentti.
Egyptin paluu Arabiliittoon
Kun Libya erotettiin Arabiliitosta Libyan sisällissodan alkaessa, Egypti oli järjestön historian ainoa valtio, jonka jäsenyys oli keskeytetty presidentti Sadatin Israelin kanssa solmiman rauhansopimuksen vuoksi. Kesäkuussa 1982 Mubarak tapasi Saudi-Arabian kuningas Fahdin, mikä merkitsi Egyptin ja Saudi-Arabian lähentymisen alkua. Koska Egypti on väkirikkain arabimaa ja Saudi-Arabia rikkain, Saudi-Arabia-Egypti-akseli oli voimakas voima arabimaailmassa. Myöhemmin vuonna 1982 Fezissä pidetyssä Arabiliiton huippukokouksessa Saudi-Arabia esitti Egyptin rauhansuunnitelman, jonka mukaan vastineeksi siitä, että Israel ratkaisee Israelin ja Palestiinan välisen konfliktin sallimalla Palestiinan valtion, koko arabimaailma tekisi rauhan Israelin kanssa.
Iranin islamilainen tasavalta oli vuodesta 1979 lähtien vaatinut itselleen asemaa islamilaisen maailman johtajana, ja erityisesti ajatollah Khomeini oli vaatinut Irakin, Saudi-Arabian, Kuwaitin ja muiden Persianlahden etelärannikolla sijaitsevien arabivaltioiden hallitusten syrjäyttämistä kutsuen näitä valtioita laittomiksi. Ajatollah Khomeinin väite olla islamilaisen maailman oikeutettu johtaja ja hänen yrityksensä viedä Iranin vallankumousta eteenpäin toimimalla sellaisten hallitusten kaatamiseksi, joita Khomeini piti epäislamilaisina, aiheuttivat syvää hälyä ja pelkoa kohteena olleissa hallituksissa, kuten Irakissa ja Saudi-Arabiassa. Iranin haasteen edessä muut arabivaltiot katsoivat Egyptin suuntaan liittolaisena. Saudi-Arabian kuningas Fahdille ja muille Persianlahden arabivaltioiden johtajille Israelin ja Palestiinan välinen konflikti häipyi taka-alalle, ja päähuomio oli Iranin pyrkimysten vastustaminen islamilaisen maailman johtajaksi, mikä tarkoitti, että Egyptiä ei voitu jättää huomiotta.
Irakin ja Iranin välisen sodan aikana 1980-1988 Egypti tuki Irakia sekä sotilaallisesti että taloudellisesti, ja miljoona egyptiläistä työskenteli Irakissa rintamalla palvelevien irakilaismiesten sijasta. Joulukuussa 1983 Mubarak toivotti PLO:n Jasser Arafatin tervetulleeksi huippukokoukseen Kairossa, mikä merkitsi lähentymistä PLO:n kanssa, ja siitä lähtien Egyptistä tuli PLO:n tärkein liittolainen. Vuonna 1985 Achille Lauron kaappaus aiheutti suuren kriisin suhteisiin, kun Yhdysvaltain ilmavoimat pakottivat EgyptAirin koneen, joka kuljetti Achille Lauron kaappaajia Tunisiaan, laskeutumaan Italiaan; muuten kone olisi ammuttu alas. Mubarak totesi lehdistötilaisuudessa 12. lokakuuta 1985: ”Olen hyvin haavoittunut. Nyt vallitsee viileys ja kireys tämän tapauksen seurauksena.” Muut arabivaltiot olivat hyljeksineet Egyptiä sen vuoksi, että se oli allekirjoittanut Camp Davidin sopimuksen vuonna 1979, mutta Egyptin painoarvo arabimaailmassa oli johtanut siihen, että Egypti oli vuoteen 1989 mennessä saanut takaisin ”keskeisen paikkansa arabimaailmassa”. Vuonna 1989 Egypti otettiin uudelleen Arabiliiton täysivaltaiseksi jäseneksi ja liiton päämaja siirrettiin alkuperäiselle paikalleen Kairoon.
Hallitustyyli
Mubarak lisäsi 1980-luvulla kohtuuhintaisten asuntojen, vaatteiden, huonekalujen ja lääkkeiden tuotantoa. Presidentiksi tullessaan Mubarak oli yksi niistä harvoista egyptiläisistä virkamiehistä, jotka kieltäytyivät vierailemasta Israelissa ja vannoivat suhtautuvansa vähemmän innokkaasti suhteiden normalisointiin Israelin hallituksen kanssa. Mubarakin aikana israelilaiset toimittajat kirjoittivat usein ”kylmästä rauhasta” Egyptin kanssa ja totesivat, että Israelin ja Egyptin suhteet olivat parhaimmillaankin jäätävät. Mubarak kiisti nopeasti, että hänen politiikkansa johtaisi vaikeuksiin Egyptin ja Israelin välisissä suhteissa tulevaisuudessa.
Israelilainen historioitsija majuri Efraim Karsh kirjoitti vuonna 2006, että Egyptissä ”…lukemattomissa artikkeleissa, tieteellisissä kirjoituksissa, kirjoissa, pilapiirroksissa, julkisissa lausunnoissa sekä radio- ja televisio-ohjelmissa juutalaiset maalataan mustimmilla mahdollisilla termeillä”. Karsh syytti Mubarakia henkilökohtaisesti antisemitismistä ja kirjoitti, että hän ”ilmeisesti jakoi propagandansa lähtökohdat”.
Egyptin voimakas riippuvuus Yhdysvaltain avusta ja sen toiveet siitä, että Yhdysvallat painostaisi Israelia palestiinalaisratkaisun aikaansaamiseksi, jatkuivat Mubarakin aikana. Hän paransi hiljaa suhteita entiseen Neuvostoliittoon. Vuonna 1987 Mubarak voitti vaalit toiselle kuusivuotiskaudelle.
Vallan alkuvuosina Mubarak laajensi Egyptin valtion turvallisuustutkintapalvelua (Mabahith Amn ad-Dawla) ja keskitettyjä turvallisuusjoukkoja (mellakantorjunta- ja eristysjoukot). Tarek Osmanin mukaan kokemus siitä, että hänen edeltäjänsä murhattiin ”suoraan hänen silmiensä edessä”, ja hänen pitkä sotilasuransa – joka oli pidempi kuin Nasserin tai Sadatin ura – saattoivat saada hänet keskittymään ja paneutumaan turvallisuuteen enemmän kuin jälkimmäiset valtionpäämiehet. Mubarak ei hakenut neuvoja ja luottamusta johtavilta ministereiltä, johtavilta neuvonantajilta tai johtavilta intellektuelleilta vaan turvallisuuspäälliköiltään – ”sisäministereiltä, armeijan komentajilta ja erittäin vaikutusvaltaisten tiedustelupalvelujen johtajilta”. Koko 1980-, 1990- ja 2000-luvun ajan Amnesty International luonnehti Egyptin turvallisuuspalvelun tekemiä ihmisoikeusloukkauksia ”järjestelmällisiksi”. Vuonna 2007 Amnesty International raportoi, että Egyptin poliisi käytti rutiininomaisesti ”pahoinpitelyjä, sähköshokkeja, pitkäkestoista ranteista ja nilkoista vääntyneisiin asentoihin ripustamista, tappouhkauksia ja seksuaalista hyväksikäyttöä”. Valtio pysyi Mubarakin aikana suurena työllistäen 8 miljoonaa ihmistä 75 miljoonan asukkaan väestöstä.
Islamilaisen fundamentalismin vastaisten kantojensa ja Israelia kohtaan harjoittamansa diplomatian vuoksi Mubarak joutui toistuvien salamurhayritysten kohteeksi. BBC:n mukaan Mubarak selvisi kuudesta murhayrityksestä. Kesäkuussa 1995 tehtiin väitetty salamurhayritys, johon liittyi myrkkykaasuja ja Egyptin islamilainen jihad, kun Mubarak oli Etiopiassa Afrikan yhtenäisyysjärjestön konferenssissa. Hänen kerrottiin myös loukkaantuneen veitsellä uhanneen hyökkääjän toimesta Port Saidissa syyskuussa 1999.
Lahden sota 1991
Egypti oli liittoutuneiden koalition jäsen Persianlahden sodan aikana vuonna 1991; egyptiläinen jalkaväki oli ensimmäisten joukossa laskeutumassa Saudi-Arabiassa Irakin joukkojen poistamiseksi Kuwaitista. Egyptin osallistuminen sotaan lujitti sen keskeistä asemaa arabimaailmassa ja toi Egyptin hallitukselle taloudellista hyötyä. Uutismedioissa julkaistiin raportteja jopa 20 miljardin Yhdysvaltain dollarin suuruisista velkojen anteeksiannoista. The Economist -lehden mukaan:
Ohjelma toimi kuin rasvattu: oppikirjaesimerkki, sanoo . Itse asiassa onni oli Hosni Mubarakin puolella; kun Yhdysvallat metsästi sotilasliittoa Irakin pakottamiseksi pois Kuwaitista, Egyptin presidentti liittyi siihen epäröimättä. Sodan jälkeen hänen palkkionsa oli se, että Yhdysvallat, Persianlahden arabivaltiot ja Eurooppa antoivat Egyptille anteeksi noin 20 miljardin dollarin velat.
Kanta Irakin hyökkäykseen vuonna 2003
Presidentti Mubarak vastusti vuoden 2003 hyökkäystä Irakiin ja väitti, että Israelin ja Palestiinan konflikti olisi pitänyt ratkaista ensin. Hän sanoi myös, että sota aiheuttaisi ”100 Bin Ladenia”. Presidenttinä hän ei kuitenkaan kannattanut Yhdysvaltain välitöntä vetäytymistä Irakista, koska hän uskoi sen todennäköisesti johtavan kaaokseen.
2005 vaalit
Presidentti Mubarak valittiin uudelleen kansanäänestyksen enemmistöäänillä peräkkäisille kausille neljästi vuosina 1987, 1993 ja 1999. Joka kerta Mubarak varmisti asemansa siten, että parlamentti nimitti hänet ja vahvisti sitten kansanäänestyksessä ilman vastustusta.
Syyskuun 2005 äänestys oli kansanäänestyksen sijasta usean ehdokkaan vaali, mutta vaalilaitokset ja turvallisuuskoneisto ovat edelleen presidentin valvonnassa. Mubarak ilmoitti ehdokkuudestaan 28. heinäkuuta 2005. Vaalit oli määrä pitää 7. syyskuuta 2005; vaaleja tarkkailleiden kansalaisjärjestöjen mukaan vaaleja varjostivat massiiviset vilpilliset toimet. Poliittisena vainona laajalti pidetyssä toimessa toisinajattelija ja El-Ghad-puolueen (”Huomisen puolue”) ehdokas Ayman Nour tuomittiin 24. joulukuuta 2005 väärennöksestä ja viideksi vuodeksi pakkotyöhön.
Valtion korruptio Mubarakin presidenttikaudella
Valtiossa ollessaan poliittinen korruptio lisääntyi dramaattisesti Mubarakin hallinnon sisäministeriössä. Poliittisia vaikuttajia ja nuoria aktivisteja vangittiin ilman oikeudenkäyntiä. Laittomia, paperittomia, piilotettuja pidätyskeskuksia perustettiin, ja yliopistojen, moskeijoiden ja sanomalehtien työntekijöitä hylättiin heidän poliittisten näkemystensä vuoksi.
Vuonna 2005 Freedom House, kansalaisjärjestö, joka tekee demokratiatutkimusta, raportoi, että Egyptin hallitus laajensi Mubarakin aikana byrokraattisia säädöksiä, rekisteröintivelvoitteita ja muuta valvontaa, jotka usein ruokkivat korruptiota. Freedom House totesi, että ”korruptio pysyi merkittävänä ongelmana Mubarakin aikana, joka lupasi tehdä paljon, mutta ei itse asiassa koskaan tehnyt mitään merkittävää puuttuakseen siihen tehokkaasti”.
Vuonna 2010 Transparency Internationalin Corruption Perceptions Index -raportti arvioi Egyptin CPI-arvosanaksi 3,1, joka perustui liikemiesten ja maayhteisön analyytikoiden käsityksiin korruption asteesta: 10 tarkoittaa erittäin puhdasta korruptiota ja 0 erittäin korruptoitunutta. Egypti sijoittui 98. sijalle raportissa mukana olleista 178 maasta.
Rikkaus ja syytökset henkilökohtaisesta korruptiosta
Helmikuussa 2011 ABC News kertoi, että asiantuntijat uskoivat Mubarakin ja hänen perheensä henkilökohtaisen varallisuuden olevan 40-70 miljardia Yhdysvaltain dollaria, jotka olivat peräisin sotilaallisista sopimuksista, jotka oli tehty Mubarakin ollessa ilmavoimien upseeri. The Guardian kertoi, että Mubarakin ja hänen perheensä varallisuus saattaa olla jopa 70 miljardia dollaria, joka on kerätty korruptiosta, lahjuksista ja laillisesta liiketoiminnasta. Rahojen kerrottiin olevan hajautettu eri pankkitileille, joista osa on Sveitsissä ja Yhdistyneessä kuningaskunnassa, ja ne on sijoitettu ulkomaiseen omaisuuteen. Lehden mukaan osa perheen varallisuutta koskevista tiedoista saattaa olla kymmenen vuotta vanhoja. Newsweekin mukaan nämä väitteet ovat heikosti perusteltuja ja epäuskottavia.
12. helmikuuta 2011 Sveitsin hallitus ilmoitti jäädyttävänsä Mubarakin ja hänen perheensä sveitsiläiset pankkitilit. Egyptin pääsyyttäjä määräsi 20. helmikuuta 2011 jäädyttämään Mubarakin ja hänen vaimonsa Suzannen, hänen poikiensa Alaa ja Gamal Mubarakin sekä hänen miniöidensä Heidi Rasekhin ja Khadiga Gamalin varat. Pääsyyttäjä määräsi myös Egyptin ulkoministerin ilmoittamaan tästä muille maille, joissa Mubarakilla ja hänen perheellään saattaa olla varoja. Määräys annettiin kaksi päivää sen jälkeen, kun egyptiläiset sanomalehdet olivat kertoneet Mubarakin jättäneen tilinpäätöksensä. Egyptin säädösten mukaan valtion virkamiehet toimittavat tilinpäätöstiedotteen, jossa luetellaan heidän omaisuutensa ja tulolähteensä hallitustyötä tehdessään. Egyptin sotilasneuvosto, jolle annettiin väliaikaisesti presidentin valta 25. tammikuuta 2011 tapahtuneen vallankumouksen jälkeen, ilmoitti 21. helmikuuta 2011, ettei sillä ole mitään sitä vastaan, että Mubarakia vastaan nostetaan oikeudenkäynti korruptiosyytösten perusteella.
Egyptiläinen sanomalehti Eldostor kertoi 23. helmikuuta 2011, että ”asiantunteva lähde” kuvaili valtakunnansyyttäjän määräystä jäädyttää Mubarakin omaisuus ja uhkailua oikeudellisilla toimilla pelkäksi viestiksi, jonka tarkoituksena oli saada presidentti Mubarak lähtemään Egyptistä sen jälkeen, kun Mubarakia yritettiin rohkaista lähtemään maasta vapaaehtoisesti. Voice of America kertoi helmikuussa 2011, että Egyptin ylin syyttäjä oli määrännyt Mubarakin ja hänen perheensä matkustuskieltoon ja varojen jäädyttämiseen harkitessaan jatkotoimia. Kairon tuomioistuin tuomitsi 21. toukokuuta 2014 Mubarakin ja hänen poikansa 17,6 miljoonan Yhdysvaltain dollarin suuruisen summan kavaltamisesta valtion varoista, jotka oli tarkoitettu presidentin palatsien kunnostamiseen ja ylläpitoon, mutta jotka sen sijaan ohjattiin yksityisten perheiden asuntojen kunnostamiseen. Tuomioistuin määräsi 17,6 miljoonan Yhdysvaltain dollarin takaisinmaksun, määräsi kolmikolle 2,9 miljoonan Yhdysvaltain dollarin sakot ja tuomitsi Mubarakin kolmeksi vuodeksi vankeuteen ja kunkin hänen poikansa neljäksi vuodeksi.
Presidentin seuraaminen
Yhdysvaltojen suurlähettiläs Margaret Scobey sanoi vuonna 2009, että ”jatkuvista kuiskutelluista keskusteluista huolimatta kenelläkään Egyptissä ei ole varmuutta siitä, kuka Mubarakia lopulta seuraa, eikä myöskään siitä, millaisissa olosuhteissa”. Hänen mukaansa presidentin poika Gamal Mubarak oli todennäköisin seuraaja; jotkut arvelivat, että tiedustelupäällikkö Omar Suleiman voisi pyrkiä virkaan tai Arabiliiton pääsihteeri Amr Moussa voisi asettua ehdolle. Presidentti Mubarak ja hänen poikansa kiistivät tämän; heidän mukaansa ”vuonna 2005 käyttöön otettu moniehdokasvaalijärjestelmä on tehnyt poliittisesta prosessista avoimemman”. Nigerian Tribunen toimittaja Abiodun Awolaja kuvaili Gamal Mubarakin mahdollista seuraajuutta ”perinnölliseksi pseudomonarkiaksi.”
Egyptin kansallinen demokraattinen puolue ilmoitti edelleen, että Hosni Mubarak oli puolueen ainoa ehdokas vuoden 2011 presidentinvaaleissa. Mubarak ilmoitti 1. helmikuuta 2011, ettei hänellä ollut aikomusta asettua ehdolle vuoden 2011 presidentinvaaleissa. Kun tämä ilmoitus ei lievittänyt mielenosoituksia, Mubarakin varapresidentti ilmoitti, että Gamal Mubarak ei asetu ehdolle presidenttiehdokkaaksi. Mielenosoitusten kiihtyessä ja Mubarakin kaatuessa Kansallisen demokraattisen puolueen entinen vaikuttaja Hamdy El-Sayed sanoi, että Gamal Mubarak aikoi kaapata presidentin viran silloisen sisäministerin Habib El-Adlyn avustamana.
Israelin ja palestiinalaisten välinen konflikti
Presidenttikautensa aikana Mubarak piti kiinni Egyptin ja Israelin vuonna 1978 allekirjoittamasta, Yhdysvaltain välittämästä Camp Davidin rauhansopimuksesta. Mubarak isännöi toisinaan myös israelilais-palestiinalaiskonfliktiin liittyviä kokouksia ja yritti useaan otteeseen toimia välittäjänä osapuolten välillä. Mubarak oli huolissaan siitä, että rabbi Menachem M. Schneerson ei luottanut häneen tässä asiassa, ja harkitsi tapaamista New Yorkissa.
Lokakuussa 2000 Mubarak isännöi Sharm el-Sheikhissä hätähuippukokousta, jossa keskusteltiin Israelin ja Palestiinan konfliktista. Kokoukseen osallistuivat mm: Yhdysvaltain presidentti Bill Clinton, PLO:n puheenjohtaja Jasser Arafat, Israelin pääministeri Ehud Barak, Jordanian kuningas Abdullah, Naton pääsihteeri Javier Solana ja YK:n pääsihteeri Kofi Annan.
Mubarak oli mukana Arabiliitossa tukemassa arabien ponnisteluja kestävän rauhan saavuttamiseksi alueella. Beirutin huippukokouksessa 28. maaliskuuta 2002 liitto hyväksyi Arabiliiton rauhanaloitteen, Saudien innoittaman suunnitelman arabien ja Israelin välisen konfliktin lopettamiseksi.
Vuonna 2006 Mubarak tuomitsi Israelin sotilaallisen hyökkäyksen Libanoniin, mutta arvosteli epäsuorasti myös Hizbollahia arabien etujen vahingoittamisesta.
Kesäkuussa 2007 Mubarak piti huippukokouksen Sharm el-Sheikissä Jordanian kuninkaan Abdullah II:n, presidentti Mahmud Abbasin ja pääministeri Ehud Olmertin kanssa. Egyptin välityksellä solmittu tauko Israelin ja Hamasin välisissä vihollisuuksissa tuli voimaan 19. kesäkuuta 2008. New York Timesin mukaan kumpikaan osapuoli ei täysin noudattanut tulitauon ehtoja.
Sopimuksessa vaadittiin Hamasia lopettamaan rakettihyökkäykset Israeliin ja valvomaan tulitaukoa koko Gazassa. Vastineeksi Hamas odotti, että saarto päättyisi, kaupankäynti Gazassa jatkuisi ja kuorma-autokuljetukset palautuisivat vuoden 2005 tasolle. Israel sitoi saarron lieventämisen rakettitulituksen vähenemiseen ja avasi vähitellen uudelleen huoltolinjat ja salli noin 90 päivittäistä kuorma-autokuljetusta Gazaan. Hamas kritisoi Israelia saarron jatkamisesta, kun taas Israel syytti Hamasia jatkuneesta aseiden salakuljetuksesta Egyptiin johtavien tunneleiden kautta ja viittasi jatkuneisiin raketti-iskuihin.
Vuonna 2009 Mubarakin hallitus kielsi Kairon sodanvastaisen konferenssin, joka oli kritisoinut Mubarakin toimien puutetta Israelia vastaan.
