Monet geofysikaaliset tutkimukset viittaavat siihen, että Kuussa on ydin (ks. katsaus artikkelissa Hood ja Zuber, 2000), jonka osoittavat magneettiset induktiosignaaleista (Hood et al., 1999) tai remanenttisesta magneettisuudesta (Hood, 1995; katsaus artikkeleissa Cisowski et al., 1983; Fuller ja Stanley, 1987). Mare-basalttinäytteiden geokemialliset analyysit viittaavat erittäin siderofiilisten alkuaineiden köyhtymiseen (esim. Righter, 2002) suhteessa köyhtymistasoon, joka on odotettavissa missä tahansa kuun ytimen muodostusskenaariossa (Canup ja Asphaug, 2001). Törmäyssimulaatiot (ks. Cameron, 2000) viittaavat siihen, että pieni osa proto-Maan ja proto-Kuun raudasta joutui kiertoradalle jättiläistörmäyksen jälkeen. Nämä massaosuusarviot ovat tyypillisesti 1 % tai vähemmän, ja ne nousevat 3 %:iin vain muutamissa ääritapauksissa, koska rautaa voi tulla lisää myöhemmässä vaiheessa tapahtuvan akkredition aikana.
Viime aikoihin ainoat menetelmät Kuun ytimen suoraksi tutkimiseksi olivat magneettiset luotaukset ja geodesia. Magneettinen luotaus (Hood et al., 1999) perustuu indusoituneeseen magneettiseen dipolimomenttiin, joka syntyy, kun Kuu liikkuu Maan geomagneettisen pyrstön läpi. Ytimen säde on 340 ± 90 km, kun oletetaan, että ytimessä kulkevat sähkövirrat voidaan approksimoida ytimen pinnalle lokalisoituneella virran ”levyllä”. Toinen lähestymistapa, inertiamomenttisuhteen mittaaminen (0,3932 ± 0,0002, Konopliv et al., 1998), osoittaa, että tiheys Kuun keskustaa kohti on suurempi kuin Kuun vaipan sisällä. Lisäksi Kuun kiertoa koskevat analyysit (Bois et al., 1996; Williams et al., 2001) ovat osoittaneet, että Kuun kiertoon vaikuttaa dissipaatiolähde, joka on tulkittu nestemäisen ytimen allekirjoitukseksi.
Kuun ytimeen viittasivat myös sisärakennemallit, jotka saatiin tiheyden, inertiamomentin, Love-luvun (k2) ja jopa induktiosignaalin käänteislaskelmilla, joko seismisen datan antamilla tai sitä vailla olevilla ylimääräisillä rajoituksilla. Bills ja Rubincam (1995) käyttivät vain keskimääräistä tiheyttä ja inertiakerrointa ja arvioivat ytimen säteeksi 400 km ja 600 km, kun tiheydet olivat 8000 ja 6000 kg m-3. Khan et al. (2004) käyttivät näitä rajoituksia sekä Love-lukua ja suorittivat Monte Carlo -inversion olettaen, että kyseessä on 5-kuorinen malli. Inversion tuloksena saatiin ydin, jonka säde on noin 350 km ja tiheys 7200 kg m- 3. Koska näiden kerrosten koon ja tiheyden välillä on useita kompromisseja, seismologiasta saatuja riippumattomia rajoitteita voidaan lisätä hyväksyttävien mallien avaruuden rajaamiseksi. A priori-seismisiin malleihin perustuvia sisäisen rakenteen inversioita tekivät ensin Bills ja Ferrari (1977) käyttäen alustavaa seismistä mallia ja myöhemmin Kuskov ja Kronrod (1998) sekä Kuskov et al. (2002) käyttäen Nakamuran (1983) seismistä mallia. Kuskov ja kollegat ehdottivat joko puhdasta γ-Fe-ydintä, jonka tiheys on 8100 kg m- 3 ja säde 350 km, tai ydintä, jossa on pienempiä tiheyksiä ja suurempia säteitä, mukaan luettuna suurin troiliittinen FeS-ydin, jonka säde on 530 km ja tiheys 4700 kg m- 3 . Khan et al. (2006) teki toisen tutkimuksen käyttäen seismisiä tietoja, inertiakerrointa ja keskimääräistä tiheyttä, ja hän ennusti ytimen, jonka tiheys on noin 5500 kg m- 3.
Kuuverkon geometria, erityisesti sen antipodaalisten asemien puuttuminen, tarkoittaa, että järjestelmä on rekisteröinyt vain vähän, jos ollenkaan, syvälle Kuuhun eteneviä säteilyreittejä (> 1200 km:n syvyydelle ulottuvia sädepolkuja (kuvio 6; vrt. törmäys kaukana olevalle puolelle, ks. esim. Nakamura et al. 1974b). Siksi kappaleen ydintä ei voida geometrisesti määrittää suorilla aalloilla (esim. Knapmeyer, 2011). Vaihtoehtoinen lähestymistapa ytimen rakenteen tutkimiseen on tutkia planeetan normaalimoodeja (esim. Lognonné ja Clévédé, 2002). Muutama kirjoittaja on etsinyt vapaita värähtelyjä Apollo-aineistosta, sillä matalan kulmakertoimen normaalimoodit ovat herkkiä ytimen rakenteelle. Loudinin ja Alexanderin (1978) epäonnistuneen yrityksen jälkeen Khan ja Mosegaard (2001) väittivät havaitsevansa vapaita värähtelyjä meteoriitin iskujen synnyttämistä litteämoodisista LP-Apollo-signaaleista. Lognonné (2005) ja Gagnepain-Beyneix et al. (2006) ovat kuitenkin osoittaneet, että näiden tapahtumien signaali-kohinasuhde oli todennäköisesti liian pieni johtaakseen havaittaviin LP-signaaleihin. Nakamura (2005) on ehdottanut noin 30 mahdollista syvän kuunjäristyksen lähdealuetta Kuun takapuolella: yhtään tapahtumaa ei kuitenkaan havaittu 40°:n etäisyydellä maanalaisen keskipisteen antipodista, mikä viittaa siihen, että tämä alue on joko aseisminen tai se vaimentaa tai poikkeuttaa voimakkaasti seismistä energiaa (Nakamura, 2005; Nakamura ym, 1982).
Kahdessa viimeaikaisessa tutkimuksessa on itsenäisesti analysoitu uudelleen Apollo-seismogrammit käyttäen nykyaikaisia aaltomuodon menetelmiä etsiäkseen kuun ytimestä heijastunutta ja muunnettua seismistä energiaa pinoamismenetelmiä käyttäen. Näiden kahden analyysin onnistumista voidaan ymmärtää kuvan 8(a) avulla, jossa esitetään yksittäisten syvän Kuun järistyksen P- ja S-aaltojen amplitudit, joiden päälle on asetettu ytimen vaiheille tyypilliset amplitudit (yksinkertaisille isotrooppisille lähteille). Tämä havainnollistaa ScS-vaiheiden suhteellisen pientä amplitudia suhteessa laitteen havaintokynnykseen ja viittaa siihen, että signaalia voidaan vahvistaa pinoamalla. Nämä pinoamiset muodostavat perustan Weber et al. (2011) ja Garcia et al. (2011) kahdessa erillisessä tutkimuksessa suoritetuille etsinnöille.