Yksi asia on varma: Kolumbus oli erittäin taitava merimies, suunnistaja ja laivan kapteeni. Vaistoihinsa ja laskelmiinsa luottaen hän lähti ilman karttaa länteen löytääkseen uuden maailman. Hän osoitti uskollisuutta suojelijoilleen, Espanjan kuninkaalle ja kuningattarelle, ja he palkitsivat hänet antamalla rahaa lähettää hänet Uuteen maailmaan yhteensä neljä kertaa. Ei ole kuitenkaan epäilystäkään siitä, että hän teki huonoja päätöksiä ja vaikutti alkuperäisamerikkalaisiin kielteisesti.
.
Atahualpa, Inkavaltakunnan viimeinen kuningas, joutui siirtokuntalaisten pidättämäksi.
”Orjuuttamiseen ja väkivaltaiseen hallintaan liittyvien ristiriitojen lisäksi Kolumbuksen johtamalla ”löytöretkeilyn aikakaudella” oli lisäseuraamuksena se, että se toi Uuteen maailmaan myös uusia tauteja, jotka ajan mittaan hävittivät alkuperäisasukkaiden väestöä monilla Uuden maailman saarilla ja yhteisöillä. Laajemmassa merkityksessä historioitsijat ovat käyttäneet ilmaisua ”Kolumbuksen vaihto” kuvaamaan kasvien, eläinten ja tavaroiden vaihtoa idän ja lännen välillä, jonka Kolumbuksen matkat käynnistivät. Vaikka vaikutukset olivat laajalle levinneitä, eikä niitä kaikkia voida pitää kielteisinä, Kolumbuksen arvostelijat ovat väittäneet, että tämän vaihdon pahimmat puolet vastasivat biologista sodankäyntiä.” (A+E Networks, Columbus Controversy, 2009)
Lopulta hänen menetelmänsä ja toimintansa saivat Kolumbuksen kiinni. Useat uudisasukkaat lobasivat häntä vastaan espanjalaisessa hovissa ja syyttivät Kolumbusta huonosta hallinnosta. Vuonna 1500 kuningas ja kuningatar lähettivät paikalle kuninkaallisen hallintovirkamiehen, joka pidätti Kolumbuksen ja hänen veljensä ja lähetti heidät kotiin.
Vaikka Kolumbus sai vapautensa takaisin ja teki neljännen ja viimeisen matkansa Uuteen maailmaan, hän oli menettänyt kuvernöörin viran ja suuren osan arvostuksestaan.