Uuden maailman apinoiden lisääntymisominaisuuksia tarkastellaan evoluution kannalta. Molekyylifylogeniat osoittavat selvästi, että ne ovat monofyleettisiä. Ne osoittavat kuitenkin myös, että kynsiset Uuden maailman apinat eivät ole kaikkien muiden platyrrhiinien sisaruksia. Sen sijaan ensimmäinen divergenssi erotti titit, sakit ja uakarit kaikista muista. Joissakin tuloksena syntyneissä kladistisissa luokitteluissa kynsiset Uuden maailman apinat kuuluvat hämmentävästi Cebidae-heimoon. Klassinen luokkiin perustuva luokittelu voi kuitenkin säilyttää jaon Cebidae- ja Callitrichidae-heimojen välillä (jotka ovat erikoistuneita evolutiivisia kääpiöitä). Myös molekyylipuissa Callimico sijoittuu johdonmukaisesti callitrichidien joukkoon, sillä se on läheisempää sukua marmoseteille kuin tamarineille. Munasarjojen kiertoa ja tiinehtymistä tarkastellaan erityisesti verrattuna sisäryhmään (vanhan maailman apinat, apinat ja ihmiset). Uuden maailman apinoilla on myös invasiivinen istukka- ja kuukautiskierto (vaikkakin callitrichideilla heikosti havaittavissa). Uuden maailman apinat ovat kädellisten joukossa epätavallisia, koska munasarjakierron pituus on usein lyhentynyt. Cebideillä on yksisikiöisiä synnytyksiä, mutta marmoseteilla ja tamarineilla on havaittavissa sekundaarista evoluutiota monisikiöisistä synnytyksistä ja erittäin epätavallisesta yhteisestä istukkakierrosta, joka johtaa kimeerismiin. Myös raskauden alkuvaiheen viivästymisvaiheessa on havaittavissa sekundaarista laajenemista callitrichidien, kuten Callimicon, keskuudessa. Monisikiöraskaudet ovat ilmeisesti tukahdutettu toissijaisesti Callimicon evoluution aikana marmosettien kanssa yhteisestä esi-isästä.
