VaERS-tietokantaan kerätyt tiedot ovat peräisin monista eri lähteistä, kuten potilailta ja vanhemmilta, osavaltioiden terveysviranomaisilta, apteekeilta, terveydenhuollon tarjoajilta ja rokotteiden valmistajilta. Vaikka täydelliset tiedot parantavat huomattavasti rokoteturvallisuuden analysointia, jotta tietokantaan saadaan kerättyä mahdollisimman monta ilmoitusta, tietokantaan sisällytetään myös ilmoituksia, joiden tiedot eivät ole yhtä täydellisiä.
Tietokannan ylläpidon ensisijainen tarkoitus on toimia varhaisvaroitus- tai hälytysjärjestelmänä sellaisten haittatapahtumien varalta, joita ei ole havaittu markkinoille saattamista edeltävän testauksen aikana. Lisäksi vuoden 1986 kansallisessa lasten rokotevahinkoja koskevassa laissa (National Childhood Vaccine Injury Act of 1986, NCVIA) edellytetään, että terveydenhuollon tarjoajat ja rokotevalmistajat ilmoittavat DHHS:lle erityisistä haittatapahtumista, jotka ilmenevät laissa mainittujen rokotteiden antamisen jälkeen.
Vapaaehtoisten ilmoittajien taakkaa on vähennettävä tasapainoisesti, mutta samalla on saatava riittävästi tietoa, jotta voidaan tuottaa tarvittavia hälytysmerkkejä, joiden avulla voidaan käynnistää mahdollisten merkittävien tapahtumien ja kehityssuuntausten analysointi.
VaERS-tiedoista ei voida laskea ilmaantuvuusastetta (kuinka usein tapahtumia esiintyy), koska kaikkia tapahtumia ei ilmoiteta eikä annettujen annosten tarkkaa lukumäärää voida tietää.
VaERS-tiedot ovat peräisin passiivisesta seurantajärjestelmästä, ja ne edustavat vahvistamattomia ilmoituksia haittatapahtumista, jotka liittyvät ajallisesti yhteen tai useampaan rokotteeseen. Tällaisiin tietoihin liittyy rajoituksia, jotka johtuvat aliraportoinnista, useiden rokoteantigeenien samanaikaisesta antamisesta, raportoinnin harhaisuudesta ja rokottamattomien vertailuryhmien ilmaantuvuuslukujen puuttumisesta.
VaERS-tietoja raportoitaessa ja arvioitaessa on tärkeää huomioida, että minkään raportoidun tapahtuman osalta ei ole todettu syy-seuraussuhdetta. Tapahtuma on voinut liittyä taustalla olevaan sairauteen tai tilaan, samanaikaisesti käytettyihin lääkkeisiin tai se on saattanut tapahtua sattumalta pian rokotteen antamisen jälkeen.
