A Condemned 2: Bloodshot 11 hónappal az első Condemned eseményei után játszódik. A rejtélyes jelenség, amely őrült erőszakot és tömeges pszichózist okoz Metro City hajléktalan lakossága körében, csak rosszabbodott, és hatalmas zavargások törtek ki városszerte. A főszereplő Ethan Thomas, aki a Serial Killer X nyomozás eseményei után felmondott az FBI sorozatgyilkosokkal foglalkozó egységénél, egy lefelé tartó spirálba került, és most hajléktalannak, erőszakosnak és alkoholistának találja magát. Még mindig paranormális látomásoktól szenved, és alkoholizmusa még egy ellenséges alteregó formájában is megnyilvánul, amely hallucinációi során gúnyolódik vele.
Farrell igazgató utasítására Ethant visszaveszik az SCU-hoz, hogy egykori mentora, Malcolm Vanhorn meggyilkolásának ügyében nyomozzon. Segítségére van régi társa, Rosa, parancsnoka pedig az ellenséges és ellenséges Dorland ügynök, az SCU taktikai parancsnoka. Ethan nyomozása során rájön, hogy nemezise, Serial Killer X még mindig életben van, akit nagybátyja, Malcolm Vanhorn ápolt, miután az eredeti Condemned végén fejbe lőtték. Serial Killer X megölte Malcolm Vanhornt, valamint Metro City polgármesterét, Rachel Marsot, és végül elrabolja Farrell igazgatót.
Ethan és Rosa azt is felfedezik, hogy a város minden bajának forrása egy titkos szervezet, az “Oro”, az első Condemnedben már utalt szekta, amelynek tagjai fájdalmas fémimplantátumokkal hangerőt fejlesztenek ki, amivel befolyásolni és irányítani tudják az emberiség többi részét. Rosa elmélete szerint ők a forrása az emberiség összes bűntettének, háborújának és gyűlöletének.
Serial Killer X, miután tudomást szerzett az Oro-ról, most a szónikus képességüket akarja hasznosítani, és jelenleg az Oro tagjait gyilkolja és boncolja, hogy megszerezze ezt a képességet. Az Oro sokkal hatalmasabb, mint korábban gondolták; tagjaik között a társadalom számos magas rangú tagja van, köztük Mars polgármester, Farrell igazgató és Dorland ügynök. Az Oro irányítja az SCU-t is, és Dorland és taktikai csapatai megpróbálják megölni Ethant, amikor rájön a titkukra. Ethan visszavág Rosa és Pierce LeRue SCU-ügynök, sőt még Serial Killer X segítségével is, aki megmenti Ethant az SCU-tól, “jövőbeli befektetésnek” nevezve.
Malcolm Vanhorn, aki egész életében az Oro ellen harcolt, egy videóra rögzített üzenetet hagy Ethan számára, amely feltárja a végső igazságot; Ethan szülei Oro-tagok voltak, akik disszidáltak a szervezettől, és ezért megölték őket. Ethan maga “a Remedy”, egy régóta megjósolt lény, aki “tökéletesen fejlett” hangszálakkal rendelkezik, amelyek képesek az Oro hangerejét az Oro által használt fémimplantátumok nélkül előállítani. Ethan képessége erősebb, mint az Oro-ké, képes elpusztítani a húst és a csontokat. A Remedy arra hivatott, hogy “az Oro hangjával szemben álló hang” legyen. Ennek eredményeként Dorland ügynök és az Oro holtan akarja látni Ethant. Farrell igazgató, aki az Oro egy szakadár frakciójának tagja, amely inkább toborozni akarja Ethant, mint elpusztítani, feláldozza az életét, hogy felszabadítsa Ethan szónikus képességeit, miután Dorland ügynök sarokba szorítja őket.
Ethan a Félszigetre megy, egy mesterséges szárazföldre, ahol az Oro-nak van egy titkos bázisa, ahonnan az egész várost figyelik és irányítják. Az újonnan szerzett szónikus erejét használva Ethan legyőzi az Oro tagjait, elpusztítja az Oro gépezetet, ami lehetővé teszi számukra, hogy irányítsák a várost, majd megküzd Dorlanddal egy szónikus párbajban az összeomló félszigeten belül. A legyőzött Dorland tájékoztatja Ethant, hogy az Oro indítékai a következők: “Ellenségeskedést kelteni, a harc rendíthetetlen vágyát. Hogy tudtukon kívül… a mi védelmezőinkké váljanak”. Ethan megkérdezi, hogy mitől védekeznek, de nem kap választ. Ethan ezután arra a következtetésre jut, hogy Dorland maga sem tudja, hogy nem több, mint egy bábu, és az egykori parancsnokot a halálba hajítja. Ethan Rosa és LeRue társaságában egy helikopterrel menekül el, visszautasítja LeRue itallal kapcsolatos ajánlatát, és elalszik. Eközben az Egyesült Államok elnöke nyilvánvalóan szívrohamot kap, miután megkapja az üzenetet: “A Remedy köztünk van!”, ami arra utal, hogy az elnök az Oro tagja volt.Végül, Serial Killer X látható, amint Oro fém implantátumot kap a szájába, ami hasonlóan néz ki, mint az Oro Dark Primary, az “utolsó főnök” Oro tagja, akivel Ethan az első Condemned végén harcolt és végzett.
