A New York-i Buffalói Állami Egyetem docenseként, majd rendes professzoraként dolgozott, majd 1984-ben csatlakozott a Nemzeti Egészségügyi Intézetekhez.
EST vitaSzerkesztés
A NIH alkalmazottjaként Venter megtanulta, hogyan kell azonosítani az mRNS-t, és elkezdett többet megtudni az emberi agyban kifejeződő mRNS-ekről. Az őt érdeklő rövid cDNS-szekvenciafragmentumokat expresszált szekvenciacímkéknek, vagy EST-eknek nevezik. Az NIH Technológia Transzfer Irodája és Venter úgy döntöttek, hogy a mások által felfedezett EST-ket felhasználva megpróbálják szabadalmaztatni az emberi agyban történő mRNS-kifejeződés tanulmányozása alapján azonosított géneket. Amikor Venter egy kongresszusi meghallgatáson nyilvánosságra hozta ezt a stratégiát, tűzvihar tört ki. Az NIH később a közvélemény felháborodását követően leállította a törekvést, és lemondott az általa benyújtott szabadalmi kérelmekről.
Human Genome ProjectEdit
Venter a Humán Genom Projekt lassú előrehaladásában lehetőséget látott arra, hogy folytassa a gének szabadalmaztatása iránti érdeklődését, ezért a magánszektorból keresett finanszírozást a Celera Genomics megalapításához. A vállalat úgy tervezte, hogy a munkájából hasznot húz azáltal, hogy genomikai adatokat hoz létre, amelyekre a felhasználók díj ellenében előfizethetnek. A cél következésképpen nyomást gyakorolt a nyilvános genomprogramra, és több csoportot arra ösztönzött, hogy megduplázzák erőfeszítéseiket a teljes szekvencia előállítása érdekében. Venter erőfeszítései hírnevet szereztek neki, mivel ő és csapata a Celera Corporationnél megosztotta az első emberi genom tervezetének szekvenálásáért járó elismerést a közfinanszírozású Humán Genomprojekttel.
2000-ben Venter és Francis Collins, a National Institutes of Health és az amerikai nyilvános genomprojekt munkatársa közösen bejelentette az emberi genom feltérképezését, teljes három évvel a nyilvános genomprogram várható befejezése előtt. A bejelentést Bill Clinton amerikai elnökkel és Tony Blair brit miniszterelnökkel együtt tették meg. Venter és Collins így megosztva kapta meg az A&E Network “Az év életrajza” díját. 2001. február 15-én a Human Genome Project konzorcium közzétette az első emberi genomot a Nature folyóiratban, amelyet egy nappal később a Celera publikációja követett a Science-ben. Annak ellenére, hogy egyes állítások szerint a shotgun szekvenálás bizonyos szempontból kevésbé pontos, mint a Human Genome Project által választott klónonkénti módszer, a technika széles körben elfogadottá vált a tudományos közösségben.
Ventert 2002 elején kirúgta a Celera. Életrajza szerint Ventert a fő befektetővel, Tony White-tal való konfliktus miatt rúgták ki, konkrétan azért, mert eltiltották attól, hogy részt vegyen az emberi genom szekvenálásának eredményét ünneplő Fehér Házi ünnepségen.
Global Ocean Sampling ExpeditionEdit
A Global Ocean Sampling Expedition (GOS) egy óceánkutató genomprojekt, amelynek célja a tengeri mikrobiális közösségek genetikai diverzitásának felmérése és a természet alapvető folyamataiban betöltött szerepük megértése. A 2003 augusztusában a Sargasso-tengeri kísérleti mintavételi projektként indult Venter 2004. március 4-én jelentette be a teljes expedíciót. A projekt, amely Venter személyes jachtját, a Sorcerer II-t használta, a kanadai Halifaxból indult, megkerülte a Földet, és 2006 januárjában tért vissza az Egyesült Államokba.
Synthetic GenomicsEdit
2005 júniusában Venter társalapítója volt a Synthetic Genomics nevű cégnek, amely módosított mikroorganizmusok felhasználásával tiszta üzemanyagokat és biokémiai anyagokat állít elő. 2009 júliusában az ExxonMobil 600 millió dolláros együttműködést jelentett be a Synthetic Genomics-szal a következő generációs bioüzemanyagok kutatására és fejlesztésére. Venter továbbra is dolgozik a bioüzemanyagok előállítására alkalmas mesterséges diatomos mikroalgák létrehozásán.
Venter az első részben szintetikus faj szabadalmaztatására törekszik, amely valószínűleg a Mycoplasma laboratorium nevet kapja. Feltételezések szerint ez a kutatási irányvonal olyan baktériumok előállításához vezethet, amelyeket úgy alakítottak ki, hogy meghatározott reakciókat hajtsanak végre, például üzemanyagokat állítsanak elő, gyógyszereket készítsenek, küzdjenek a globális felmelegedés ellen és így tovább.
2010 májusában egy Venter által vezetett tudóscsoport elsőként hozta létre sikeresen az úgynevezett “szintetikus életet”. Ez úgy történt, hogy szintetizáltak egy nagyon hosszú DNS-molekulát, amely egy teljes baktérium genomját tartalmazta, és ezt bevitték egy másik sejtbe, hasonlóan Eckard Wimmer csoportjának teljesítményéhez, akik szintetizáltak és ligáltak egy RNS-vírus genomot, és “bebootolták” azt sejtlizátumba. Az egysejtű organizmus négy “vízjelet” tartalmaz a DNS-ébe írva, amelyek azonosítják, hogy szintetikus, és segítenek nyomon követni leszármazottait. A vízjelek a következőket tartalmazzák:
- A teljes ábécé kódtáblázata írásjelekkel
- A 46 közreműködő tudós neve
- Három idézet
- A sejt titkos e-mail címe.
Venter 2016. március 25-én jelentette a Syn 3.0, egy szintetikus genom létrehozását, amely a legkevesebb génnel rendelkezik a szabadon élő szervezetek közül (473 gén). Céljuk az volt, hogy minden nem lényeges gént eltávolítsanak, és csak az élet fenntartásához szükséges minimális készletet hagyják meg.
Ez a lecsupaszított, gyorsan szaporodó sejt várhatóan értékes eszköz lesz a kutatók számára.
2018 augusztusában Venter visszavonult az igazgatótanács elnöki posztjáról, mondván, hogy a J. Craig Venter Intézetben végzett munkájára kíván összpontosítani. Az igazgatótanács tudományos tanácsadója marad.
J. Craig Venter InstituteSzerkesztés
Venter jelenleg a J. Craig Venter Institute vezérigazgatója, amely nonprofit szervezet a szintetikus biológia területén végez kutatásokat. Venter 2006-ban alapította a szervezetet. A szervezetnek La Jollában és a marylandi Rockville-ben vannak létesítményei, és több mint 200 embert foglalkoztat.
Egyéni emberi genomSzerkesztés
2007. szeptember 4-én egy Sam Levy által vezetett csapat közzétette az egyik első egyéni emberi genomot – Venter saját DNS-szekvenciáját. Venter genomjának néhány szekvenciája összefüggésbe hozható a nedves fülzsírral, az antiszociális viselkedés, az Alzheimer-kór és a szív- és érrendszeri betegségek fokozott kockázatával. Ez a publikáció azért volt különösen érdekes, mert megkísérelte a két haplotípus (az egyes kromoszómák két példánya) elkülönítését, bár ezt csak korlátozottan érte el. A közzétett genom csak 3 milliárd bázist tartalmazott, nem pedig a teljes 6 milliárdot, amely egy teljesen diploid szekvenciát alkotna. További 10 év telt el, mire megjelentek az első haplotípus-felbontású emberi genomok.
A Human Reference Genome Browser egy webes alkalmazás Venter nemrég közzétett genomjának navigálására és elemzésére. A HuRef adatbázis körülbelül 32 millió, mikrofluidikus Sanger-szekvenálással szekvenált DNS-olvasatból áll, amelyeket 4528 állványzatba állítottak össze, és 4,1 millió, genomelemzéssel azonosított DNS-variációt tartalmaz. Ezek a variánsok közé tartoznak az egynukleotid-polimorfizmusok (SNP-k), blokkhelyettesítések, rövid és nagy indelek, valamint szerkezeti variációk, például inszerciók, deléciók, inverziók és másolatszám-változások.
A böngésző segítségével a tudósok navigálhatnak a HuRef genom összeállításában és szekvencia-variációkban, és összehasonlíthatják azt az NCBI human build 36 összeállításával az NCBI és az Ensembl annotációival összefüggésben. A böngésző összehasonlító nézetet biztosít az NCBI és a HuRef konszenzusos szekvenciák, a HuRef-összeállítás szekvencia-multialignációja, az Ensembl és a dbSNP annotációk, a HuRef variánsok, valamint a mögöttes variánsbizonyítékok és a funkcionális elemzés között. Az interfész ábrázolja továbbá azokat a haplotípus-blokkokat, amelyekből a diploid genom szekvenciájára lehet következtetni, valamint a variánsok és a génannotációk kapcsolatát. A variánsok és a gén annotációk megjelenítése külső nyilvános forrásokhoz kapcsolódik, beleértve a dbSNP, Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) és Gene Ontology (GO) forrásokat.
A felhasználók a HuRef genomban HUGO génnevek, Ensembl és dbSNP azonosítók, HuRef contig vagy scaffold helyek, vagy NCBI kromoszóma helyek segítségével kereshetnek. A felhasználók ezután könnyen és gyorsan böngészhetnek bármely genomi régióban az egyszerű és intuitív pan és zoom vezérlők segítségével; továbbá az egyes lókuszokra vonatkozó adatok további elemzés céljából exportálhatók.
Human Longevity, Inc.Edit
2014. március 4-én Venter és társalapítói, Peter Diamandis és Robert Hariri bejelentették a Human Longevity, Inc. megalapítását, amely az egészséges, “nagy teljesítményű” emberi élettartam meghosszabbítására összpontosít. A bejelentés idején a vállalat már 70 millió dolláros kockázati finanszírozást gyűjtött össze, amely várhatóan 18 hónapig tartott. Venter 2018 májusáig, nyugdíjba vonulásáig volt a vállalat elnöke és vezérigazgatója (CEO). A vállalat közölte, hogy évi 40 000 genom szekvenálását tervezi, kezdetben a rákos genomokra és a rákos betegek genomjaira összpontosítva.
A Human Longevity 2018-ban pert indított Venter ellen, üzleti titkok ellopásával vádolva őt. Az állítások szerint Venter távozott a cég számítógépével, amely olyan értékes információkat tartalmazott, amelyeket fel lehetett használni egy konkurens vállalkozás beindításához. a pert végül egy kaliforniai bíró elutasította azon az alapon, hogy a Human Longevity nem tudott olyan ügyet bemutatni, amely megfelelt volna a jogi küszöbnek, amely ahhoz szükséges, hogy egy cég, vagy magánszemély perelhessen, ha ellopták az üzleti titkait.
A Human Longevity küldetése az egészséges emberi élettartam meghosszabbítása a genomika, metabolomika, mikrobiomika és proteomika nagy felbontású big data diagnosztikájának felhasználásával, valamint az őssejtterápia alkalmazásával.
