Po pracy jako profesor nadzwyczajny, a później profesor zwyczajny na Uniwersytecie Stanowym Nowego Jorku w Buffalo, dołączył do National Institutes of Health w 1984 roku.
Kontrowersje wokół ESTEdit
Podczas pracy w NIH, Venter nauczył się identyfikować mRNA i zaczął dowiadywać się więcej o tych wyrażanych w ludzkim mózgu. Krótkie fragmenty sekwencji cDNA, którymi był zainteresowany, nazywane są znacznikami sekwencji wyrażonych, czyli EST. Biuro Transferu Technologii NIH i Venter postanowili przejąć EST-y odkryte przez innych, próbując opatentować geny zidentyfikowane na podstawie badań nad ekspresją mRNA w ludzkim mózgu. Kiedy Venter ujawnił tę strategię podczas przesłuchania w Kongresie, wybuchła burza kontrowersji. NIH zaprzestało później tych starań i porzuciło złożone wnioski patentowe po oburzeniu opinii publicznej.
Human Genome ProjectEdit
Venter był pasjonatem mocy genomiki w celu radykalnego przekształcenia opieki zdrowotnej. Venter wierzył, że sekwencjonowanie typu shotgun jest najszybszym i najbardziej efektywnym sposobem na uzyskanie użytecznych danych o ludzkim genomie. Metoda ta została jednak odrzucona przez Human Genome Project, ponieważ niektórzy genetycy uważali, że nie będzie ona wystarczająco dokładna dla genomu tak skomplikowanego jak ludzki, że będzie trudniejsza logistycznie i że będzie znacznie więcej kosztować.
Venter postrzegał powolne tempo postępu w projekcie Human Genome jako okazję do kontynuowania swojego zainteresowania patentowaniem genów, więc szukał funduszy z sektora prywatnego, aby założyć Celera Genomics. Firma planowała czerpać zyski ze swojej pracy poprzez tworzenie danych genomowych, które użytkownicy mogliby odpłatnie subskrybować. Cel ten w konsekwencji wywarł presję na publiczny program genomowy i pobudził kilka grup do podwojenia wysiłków w celu uzyskania pełnej sekwencji. Wysiłki Ventera przyniosły mu sławę, ponieważ on i jego zespół z Celera Corporation podzielili się zasługami za sekwencjonowanie pierwszego projektu ludzkiego genomu z publicznie finansowanym Human Genome Project.
W 2000 roku Venter i Francis Collins z National Institutes of Health i U.S. Public Genome Project wspólnie ogłosili, że zmapowali ludzki genom, na trzy lata przed spodziewanym zakończeniem Public Genome Program. Ogłoszenie to zostało dokonane wraz z prezydentem USA Billem Clintonem i premierem Wielkiej Brytanii Tonym Blairem. Venter i Collins otrzymali tym samym nagrodę za „Biografię Roku” od A&E Network.15 lutego 2001 r. konsorcjum Human Genome Project opublikowało pierwszy ludzki genom w czasopiśmie Nature, a dzień później Celera opublikowała go w Science. Pomimo pewnych twierdzeń, że sekwencjonowanie typu shotgun było pod pewnymi względami mniej dokładne niż metoda klon po klonie wybrana przez Human Genome Project, technika ta stała się powszechnie akceptowana przez społeczność naukową.
Venter został zwolniony przez firmę Celera na początku 2002 roku. Według jego biografii, Venter został zwolniony z powodu konfliktu z głównym inwestorem, Tonym White’em, a konkretnie z powodu zakazu uczestniczenia w ceremonii w Białym Domu z okazji osiągnięcia sekwencjonowania ludzkiego genomu.
Global Ocean Sampling ExpeditionEdit
Global Ocean Sampling Expedition (GOS) jest projektem genomowym eksploracji oceanu, którego celem jest ocena różnorodności genetycznej w społecznościach mikrobiomu morskiego i zrozumienie ich roli w podstawowych procesach zachodzących w przyrodzie. Rozpoczęty jako pilotażowy projekt pobierania próbek z Morza Sargassowego w sierpniu 2003 roku, Venter ogłosił pełną Ekspedycję 4 marca 2004 roku. Projekt, w którym wykorzystano osobisty jacht Ventera, Sorcerer II, rozpoczął się w Halifax w Kanadzie, opłynął kulę ziemską i powrócił do USA w styczniu 2006 roku.
Synthetic GenomicsEdit
W czerwcu 2005 roku Venter był współzałożycielem Synthetic Genomics, firmy zajmującej się wykorzystaniem zmodyfikowanych mikroorganizmów do produkcji czystych paliw i biochemikaliów. W lipcu 2009 r. firma ExxonMobil ogłosiła wartą 600 milionów dolarów współpracę z Synthetic Genomics w zakresie badań i rozwoju biopaliw nowej generacji. Venter kontynuuje prace nad stworzeniem zmodyfikowanych mikroalg okrzemkowych do produkcji biopaliw.
Venter dąży do opatentowania pierwszego częściowo syntetycznego gatunku, który prawdopodobnie zostanie nazwany Mycoplasma laboratorium. Istnieją spekulacje, że ta linia badań może prowadzić do produkcji bakterii, które zostały zaprojektowane do wykonywania określonych reakcji, na przykład do produkcji paliw, wytwarzania leków, zwalczania globalnego ocieplenia i tak dalej.
W maju 2010 roku zespół naukowców kierowany przez Ventera stał się pierwszym, który z powodzeniem stworzył coś, co zostało opisane jako „syntetyczne życie”. Dokonano tego poprzez zsyntetyzowanie bardzo długiej cząsteczki DNA zawierającej cały genom bakterii i wprowadzenie jej do innej komórki, co było analogiczne do osiągnięcia grupy Eckarda Wimmera, który zsyntetyzował i podwiązał genom wirusa RNA, a następnie „uruchomił” go w lizacie komórkowym. Jednokomórkowy organizm zawiera cztery „znaki wodne” wpisane w jego DNA, które identyfikują go jako syntetyczny i pomagają śledzić jego potomków. Znaki wodne zawierają
- Tablicę kodów dla całego alfabetu z interpunkcją
- Nazwiska 46 naukowców, którzy przyczynili się do jego powstania
- Trzy cytaty
- Tajny adres e-mail komórki.
W dniu 25 marca 2016 roku Venter poinformował o stworzeniu Syn 3.0, syntetycznego genomu posiadającego najmniejszą liczbę genów spośród wszystkich swobodnie żyjących organizmów (473 geny). Ich celem było pozbawienie wszystkich nieistotnych genów, pozostawiając tylko minimalny zestaw niezbędny do podtrzymania życia.Oczekuje się, że ta rozebrana, szybko rozmnażająca się komórka będzie cennym narzędziem dla naukowców w tej dziedzinie.
W sierpniu 2018 roku Venter przeszedł na emeryturę jako prezes zarządu, mówiąc, że chce skupić się na swojej pracy w Instytucie J. Craiga Ventera. Pozostanie jako doradca naukowy zarządu.
J. Craig Venter InstituteEdit
Venter jest obecnie dyrektorem naczelnym J. Craig Venter Institute, organizacji non-profit, która prowadzi badania w zakresie biologii syntetycznej. Venter założył organizację w 2006 roku. Posiada ona obiekty w La Jolla oraz w Rockville w stanie Maryland i zatrudnia ponad 200 osób.
Indywidualny genom ludzkiEdit
W dniu 4 września 2007 roku zespół kierowany przez Sama Levy’ego opublikował jeden z pierwszych genomów indywidualnej sekwencji DNA człowieka Ventera. Niektóre z sekwencji w genomie Ventera są związane z mokrą woskowiną uszną, zwiększonym ryzykiem zachowań antyspołecznych, chorobą Alzheimera i chorobami układu krążenia. Publikacja ta była szczególnie interesująca, ponieważ podjęto w niej próbę rozdzielenia dwóch haplotypów (dwóch kopii każdego chromosomu), choć udało się to tylko w ograniczony sposób. Opublikowany genom miał tylko 3 miliardy zasad, a nie pełne 6 miliardów, które składałyby się na w pełni diploidalną sekwencję. Minęło kolejnych 10 lat zanim zaczęły pojawiać się pierwsze haplotypowo rozwiązane ludzkie genomy.
The Human Reference Genome Browser jest aplikacją internetową służącą do nawigacji i analizy niedawno opublikowanego genomu Ventera. Baza danych HuRef składa się z około 32 milionów odczytów DNA sekwencjonowanych przy użyciu mikroprzepływowego sekwencjonowania Sangera, połączonych w 4 528 rusztowań i 4,1 miliona wariantów DNA zidentyfikowanych przez analizę genomu. Warianty te obejmują polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNPs), substytucje blokowe, krótkie i duże indeksy oraz zmiany strukturalne, takie jak insercje, delecje, inwersje i zmiany liczby kopii.
Przeglądarka umożliwia naukowcom poruszanie się po złożeniu genomu HuRef i wariantach sekwencji, a także porównywanie go z ludzkim złożeniem budowy 36 NCBI w kontekście adnotacji NCBI i Ensembl. Przeglądarka zapewnia widok porównawczy pomiędzy sekwencjami konsensusu NCBI i HuRef, wielopoziomowe wyrównanie sekwencji zespołu HuRef, adnotacje Ensembl i dbSNP, warianty HuRef, a także bazowe dowody wariantów i analizę funkcjonalną. Interfejs przedstawia również bloki haplotypów, z których można wnioskować o sekwencji genomu diploidalnego oraz relację wariantów do anotacji genów. Wyświetlanie wariantów i adnotacje genów są powiązane z zewnętrznymi zasobami publicznymi, w tym dbSNP, Ensembl, Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) i Gene Ontology (GO).
Użytkownicy mogą przeszukiwać genom HuRef przy użyciu nazw genów HUGO, identyfikatorów Ensembl i dbSNP, lokalizacji kontigów lub rusztowań HuRef lub lokalizacji chromosomów NCBI. Użytkownicy mogą następnie łatwo i szybko przeglądać dowolny region genomu za pomocą prostych i intuicyjnych kontrolek przesuwania i powiększania; co więcej, dane istotne dla konkretnych loci mogą być eksportowane do dalszej analizy.
Human Longevity, Inc.Edit
4 marca 2014 roku Venter i współzałożyciele Peter Diamandis i Robert Hariri ogłosili utworzenie Human Longevity, Inc, firmy skupionej na przedłużeniu zdrowej, „wysokowydajnej” ludzkiej długości życia. W momencie ogłoszenia firma zebrała już 70 milionów dolarów w ramach finansowania venture, które miało trwać 18 miesięcy. Venter pełnił funkcję prezesa i dyrektora naczelnego (CEO) do maja 2018 roku, kiedy to przeszedł na emeryturę. Firma powiedziała, że planuje sekwencjonować 40 000 genomów rocznie, z początkowym naciskiem na genomy nowotworowe i genomy pacjentów z rakiem.
Human Longevity złożył pozew w 2018 roku przeciwko Venterowi, oskarżając go o kradzież tajemnic handlowych. Przedstawiono zarzuty stwierdzające, że Venter odszedł z komputerem firmowym, który zawierał cenne informacje, które mogły zostać wykorzystane do rozpoczęcia konkurencyjnej działalności.Pozew został ostatecznie odrzucony przez sędziego z Kalifornii na podstawie tego, że Human Longevity nie byli w stanie przedstawić sprawy, która spełniała próg prawny wymagany dla firmy, lub osoby fizycznej, aby pozwać, gdy jej tajemnice handlowe zostały skradzione.
Misją Human Longevity jest przedłużenie zdrowego ludzkiego życia poprzez wykorzystanie wysokiej rozdzielczości diagnostyki big data z genomiki, metabolomiki, mikrobiomiki i proteomiki oraz wykorzystanie terapii komórkami macierzystymi.
.
