Mubarak został ranny podczas zamachu na prezydenta Sadata w październiku 1981 roku przez żołnierzy dowodzonych przez porucznika Khalida Islambouliego. Po śmierci Sadata, Mubarak został czwartym prezydentem Egiptu.
Powrót Egiptu do Ligi Arabskiej
Do czasu zawieszenia Libii w Lidze Arabskiej na początku libijskiej wojny domowej, Egipt był jedynym państwem w historii organizacji, które miało zawieszone członkostwo, z powodu traktatu pokojowego prezydenta Sadata z Izraelem. W czerwcu 1982 r. Mubarak spotkał się z królem Arabii Saudyjskiej Fahdem, co zapoczątkowało zbliżenie egipsko-saudyjskie. Ponieważ Egipt jest najludniejszym krajem arabskim, a Arabia Saudyjska najbogatszym, oś saudyjsko-egipska stanowiła potężną siłę w świecie arabskim. Na szczycie Ligi Arabskiej, który odbył się później w 1982 roku w Fezie, Arabia Saudyjska przedstawiła egipski plan pokojowy, w którym w zamian za rozwiązanie przez Izrael konfliktu izraelsko-palestyńskiego poprzez dopuszczenie do powstania państwa palestyńskiego, cały świat arabski zawarłby pokój z Izraelem.
Islamska Republika Iranu od 1979 roku rościła sobie prawo do bycia przywódcą świata islamskiego, a w szczególności ajatollah Chomeini wzywał do obalenia rządów Iraku, Arabii Saudyjskiej, Kuwejtu i innych państw arabskich wzdłuż południowych wybrzeży Zatoki Perskiej, nazywając te państwa nielegalnymi. Roszczenia ajatollaha Chomeiniego do bycia prawowitym przywódcą świata islamskiego i jego próby eksportu rewolucji irańskiej poprzez pracę nad obaleniem rządów, które Chomeini uważał za nieislamskie, spowodowały głęboki niepokój i strach w rządach, które były celem ataku, takich jak Irak i Arabia Saudyjska. W obliczu irańskiego wyzwania, inne państwa arabskie spoglądały w stronę Egiptu jako sojusznika. Dla króla Fahd Arabii Saudyjskiej i innych przywódców państw arabskich Zatoki Perskiej, konflikt izraelsko-palestyński zanikał w tle, a głównym problemem było opieranie się irańskim pretensjom do bycia liderem świata islamskiego, co oznaczało, że Egipt nie mógł być ignorowany.
Podczas wojny irańsko-irackiej od 1980 do 1988 roku, Egipt wspierał Irak militarnie i gospodarczo z milionem Egipcjan pracujących w Iraku, aby zająć miejsce irackich mężczyzn służących na linii frontu. W grudniu 1983 r. Mubarak przyjął Yassera Arafata z OWP na szczycie w Kairze, co oznaczało zbliżenie z OWP i od tego czasu Egipt stał się głównym sojusznikiem OWP. W 1985 r. porwanie Achille Lauro spowodowało poważny kryzys w stosunkach z Egiptem, kiedy to siły powietrzne USA zmusiły samolot EgyptAir, wiozący porywaczy Achille Lauro do Tunezji, do lądowania we Włoszech; w przeciwnym razie samolot zostałby zestrzelony. Mubarak oświadczył na konferencji prasowej 12 października 1985 roku: „Jestem bardzo zraniony. Teraz w wyniku tego incydentu panuje chłód i napięcie”. Egipt został wykluczony przez inne państwa arabskie za podpisanie porozumień z Camp David w 1979 roku, ale waga Egiptu w świecie arabskim doprowadziła do tego, że Egipt odzyskał swoje „centralne miejsce w świecie arabskim” do 1989 roku. W 1989 roku Egipt został ponownie przyjęty jako pełnoprawny członek do Ligi Arabskiej, a siedziba Ligi została przeniesiona do pierwotnej lokalizacji w Kairze.
Styl rządzenia
Przez lata 80-te, Mubarak zwiększył produkcję przystępnych cenowo mieszkań, odzieży, mebli i leków. Do czasu, gdy został prezydentem, Mubarak był jednym z kilku egipskich urzędników, którzy odmówili wizyty w Izraelu i przyrzekli przyjąć mniej entuzjastyczne podejście do normalizacji stosunków z rządem izraelskim. Pod rządami Mubaraka izraelscy dziennikarze często pisali o „zimnym pokoju” z Egiptem, obserwując, że stosunki izraelsko-egipskie były w najlepszym wypadku mroźne. Mubarak szybko zaprzeczał, że jego polityka spowoduje trudności w stosunkach egipsko-izraelskich w przyszłości.
Izraelski historyk major Efraim Karsh napisał w 2006 roku, że w Egipcie „…w wielu artykułach, pismach naukowych, książkach, karykaturach, oświadczeniach publicznych oraz programach radiowych i telewizyjnych, Żydzi są malowani w najczarniejszych kategoriach, jakie można sobie wyobrazić”. Karsh oskarżył Mubaraka o bycie osobiście antysemitą, pisząc, że „najwyraźniej podzielał przesłanki” jego propagandy.
Ciężka zależność Egiptu od pomocy USA i jego nadzieje na amerykańską presję na Izrael w sprawie palestyńskiej ugody trwały pod Mubarakiem. On po cichu poprawił stosunki z byłym Związkiem Radzieckim. W 1987 roku Mubarak wygrał wybory na drugą sześcioletnią kadencję.
W pierwszych latach sprawowania władzy Mubarak rozbudował egipską Państwową Służbę Śledczą Bezpieczeństwa (Mabahith Amn ad-Dawla) i Centralne Siły Bezpieczeństwa (siły do walki z zamieszkami i powstrzymywania). Według Tareka Osmana, doświadczenie, jakim był widok zamordowanego „na jego oczach” poprzednika oraz jego długa kariera wojskowa – dłuższa niż Nassera czy Sadata – mogły zaszczepić w nim większe skupienie i zaabsorbowanie bezpieczeństwem, niż miało to miejsce w przypadku tych ostatnich głów państwa. Mubarak szukał rady i zaufania nie u czołowych ministrów, starszych doradców czy czołowych intelektualistów, ale u swoich szefów bezpieczeństwa – „ministrów spraw wewnętrznych, dowódców armii i szefów ultra wpływowych służb wywiadowczych”. Przez całe lata 80-te, 90-te i 2000-te łamanie praw człowieka przez służby bezpieczeństwa w Egipcie było określane przez Amnesty International jako „systematyczne”. W 2007 roku Amnesty International donosiła, że egipska policja rutynowo angażowała się w „bicie, elektrowstrząsy, długotrwałe zawieszanie za nadgarstki i kostki w wykrzywionych pozycjach, grożenie śmiercią i wykorzystywanie seksualne”. Państwo pozostało duże pod rządami Mubaraka zatrudniającego 8 milionów ludzi z populacji 75 milionów.
Z powodu jego pozycji przeciwko fundamentalizmowi islamskiemu i jego dyplomacji wobec Izraela, Mubarak był celem wielokrotnych prób zamachów. Według BBC, Mubarak przeżył sześć prób zamachu na swoje życie. W czerwcu 1995 r. miał miejsce domniemany zamach z użyciem gazów trujących i Egipskiego Dżihadu Islamskiego, gdy Mubarak przebywał w Etiopii na konferencji Organizacji Jedności Afrykańskiej. We wrześniu 1999 roku w Port Saidzie został ranny przez napastnika z nożem.
Wojna w Zatoce Perskiej w 1991 roku
Egipt był członkiem koalicji sojuszniczej podczas wojny w Zatoce Perskiej w 1991 roku; egipska piechota morska była jednymi z pierwszych, którzy wylądowali w Arabii Saudyjskiej, aby usunąć siły irackie z Kuwejtu. Udział Egiptu w wojnie umocnił jego centralną rolę w świecie arabskim i przyniósł korzyści finansowe dla egipskiego rządu. W mediach pojawiły się doniesienia o umorzeniu długów na sumy sięgające 20 miliardów dolarów. Według The Economist:
Program zadziałał jak urok: podręcznikowy przypadek, mówi . W rzeczywistości szczęście było po stronie Hosniego Mubaraka; kiedy USA polowały na sojusz wojskowy w celu wyparcia Iraku z Kuwejtu, prezydent Egiptu dołączył bez wahania. Po wojnie w nagrodę Ameryka, kraje arabskie Zatoki Perskiej i Europa umorzyły Egiptowi około 20 mld dolarów długu.
Stanowisko w sprawie inwazji na Irak w 2003 roku
Prezydent Mubarak wypowiedział się przeciwko inwazji na Irak w 2003 r., argumentując, że najpierw należało rozwiązać konflikt izraelsko-palestyński. Powiedział również, że wojna spowodowałaby „100 Bin Ladenów”. Jednak jako prezydent nie poparł natychmiastowego wycofania się USA z Iraku, ponieważ uważał, że prawdopodobnie doprowadziłoby to do chaosu.
2005 wybory
Prezydent Mubarak został ponownie wybrany większością głosów w referendum na kolejne kadencje czterokrotnie w 1987, 1993 i 1999 roku. Za każdym razem Mubarak zapewniał sobie stanowisko poprzez nominację przez parlament, a następnie potwierdzenie bez sprzeciwu w referendum.
We wrześniu 2005 r. odbyły się wybory z udziałem wielu kandydatów, a nie referendum, ale instytucje wyborcze i aparat bezpieczeństwa pozostają pod kontrolą prezydenta. W dniu 28 lipca 2005 r. Mubarak ogłosił swoją kandydaturę. Wybory zostały zaplanowane na 7 września 2005 r.; według organizacji obywatelskich, które obserwowały wybory, były one naznaczone masowymi fałszerstwami. W ruchu powszechnie postrzeganym jako prześladowania polityczne, Ayman Nour, dysydent i kandydat partii El-Ghad („Partia Jutra”) został skazany za fałszerstwo i skazany na pięć lat ciężkich robót w dniu 24 grudnia 2005 r.
Korupcja w państwie podczas prezydentury Mubaraka
Podczas sprawowania urzędu, korupcja polityczna w Ministerstwie Spraw Wewnętrznych administracji Mubaraka gwałtownie wzrosła. Politycy i młodzi aktywiści byli więzieni bez procesu. Powstały nielegalne, nieudokumentowane, ukryte ośrodki przetrzymywania, a uniwersytety, meczety i pracownicy gazet byli odrzucani z powodu swoich poglądów politycznych.
W 2005 roku Freedom House, organizacja pozarządowa, która prowadzi badania nad demokracją, poinformowała, że rząd egipski pod rządami Mubaraka rozszerzył przepisy biurokratyczne, wymogi rejestracyjne i inne kontrole, które często są pożywką dla korupcji. Freedom House stwierdził, że „korupcja pozostała znaczącym problemem pod rządami Mubaraka, który obiecał zrobić wiele, ale w rzeczywistości nigdy nie zrobił nic znaczącego, aby skutecznie rozwiązać ten problem”.
W 2010 roku, Transparency International’s Corruption Perceptions Index raport ocenił Egipt z wynikiem CPI z 3,1, w oparciu o postrzeganie stopnia korupcji z ludzi biznesu i analityków krajowych, z 10 jest bardzo czysty i 0 jest bardzo skorumpowany. Egipt zajął 98. miejsce spośród 178 krajów uwzględnionych w raporcie.
Zamożność i zarzuty korupcji osobistej
W lutym 2011 roku ABC News poinformowało, że eksperci uważają, iż osobiste bogactwo Mubaraka i jego rodziny wynosi od 40 do 70 miliardów dolarów z kontraktów wojskowych zawartych w czasie, gdy był on oficerem sił powietrznych. The Guardian doniósł, że Mubarak i jego rodzina mogą być warci nawet 70 miliardów dolarów pochodzących z korupcji, łapówek i legalnej działalności biznesowej. Pieniądze miały być rozłożone na różnych kontach bankowych, w tym w Szwajcarii i Wielkiej Brytanii, i zainwestowane w nieruchomości zagraniczne. Gazeta podała, że niektóre z informacji o bogactwie rodziny mogą być sprzed dziesięciu lat. According to Newsweek, these allegations are poorly substantiated and lack credibility.
On 12 February 2011, the government of Switzerland announced it was freezing the Swiss bank accounts of Mubarak and his family. W dniu 20 lutego 2011 r. egipski prokurator generalny nakazał zamrożenie aktywów Mubaraka oraz jego żony Suzanne, synów Alaa i Gamala Mubaraka, a także jego synowych Heidi Rasekh i Khadiga Gamal. Prokurator generalny nakazał również egipskiemu ministrowi spraw zagranicznych, aby poinformował o tym inne kraje, w których Mubarak i jego rodzina mogą posiadać aktywa. Nakaz ten pojawił się dwa dni po tym, jak egipskie gazety poinformowały, że Mubarak złożył swoje oświadczenie finansowe. Egipskie przepisy nakazują urzędnikom państwowym złożenie oświadczenia majątkowego, w którym wyszczególnione są ich aktywa i źródła dochodu podczas wykonywania pracy państwowej. W dniu 21 lutego 2011 r. egipska Rada Wojskowa, której tymczasowo powierzono władzę prezydencką w wyniku rewolucji z 25 stycznia 2011 r., oświadczyła, że nie ma nic przeciwko procesowi Mubaraka pod zarzutem korupcji.
W dniu 23 lutego 2011 r. egipska gazeta Eldostor poinformowała, że „kompetentne źródło” opisało nakaz prokuratora generalnego dotyczący zamrożenia aktywów Mubaraka oraz groźby wszczęcia postępowania sądowego jako nic innego, jak sygnał dla Mubaraka do opuszczenia Egiptu po tym, jak podjęto szereg prób zachęcenia go do dobrowolnego wyjazdu. W lutym 2011 roku Voice of America poinformował, że najwyższy prokurator Egiptu zarządził zakaz podróżowania i zamrożenie aktywów Mubaraka i jego rodziny, rozważając dalsze działania. 21 maja 2014 r. sąd w Kairze skazał Mubaraka i jego synów za zdefraudowanie równowartości 17,6 mln USD z funduszy państwowych, które były przeznaczone na renowację i utrzymanie pałaców prezydenckich, ale zamiast tego zostały przekierowane na modernizację prywatnych domów rodzinnych. Sąd nakazał zwrot 17,6 mln USD, ukarał trio grzywną w wysokości 2,9 mln USD i skazał Mubaraka na trzy lata więzienia, a każdego z jego synów na cztery lata.
Sukcesja prezydencka
W 2009 roku ambasador USA Margaret Scobey powiedziała, że „pomimo nieustannych dyskusji szeptanych, nikt w Egipcie nie ma pewności, kto ostatecznie zastąpi Mubaraka ani w jakich okolicznościach.” Powiedziała, że syn prezydenta Gamal Mubarak jest najbardziej prawdopodobnym następcą; niektórzy uważali, że szef wywiadu Omar Suleiman może starać się o urząd, lub sekretarz generalny Ligi Arabskiej Amr Moussa może kandydować. Prezydent Mubarak i jego syn zaprzeczyli temu; powiedzieli, że „wprowadzony w 2005 roku system wyborczy z wieloma kandydatami uczynił proces polityczny bardziej przejrzystym”. Dziennikarz „Nigerian Tribune” Abiodun Awolaja opisał ewentualną sukcesję Gamala Mubaraka jako „dziedziczną pseudomonarchię”.
Narodowa Demokratyczna Partia Egiptu nadal twierdziła, że Hosni Mubarak będzie jedynym kandydatem tej partii w wyborach prezydenckich w 2011 roku. Mubarak powiedział w dniu 1 lutego 2011 r., że nie ma zamiaru startować w wyborach prezydenckich w 2011 roku. Gdy deklaracja ta nie przyniosła załagodzenia protestów, wiceprezydent Mubaraka oświadczył, że Gamal Mubarak nie będzie kandydował w wyborach prezydenckich. Z eskalacji demonstracji i upadku Mubaraka, Hamdy El-Sayed, były wpływowy postać w Partii Narodowo-Demokratycznej, powiedział Gamal Mubarak zamierza uzurpować prezydenturę, wspierany przez ówczesnego ministra spraw wewnętrznych, Habib El-Adly.
Konflikt izraelsko-palestyński
Podczas jego prezydentury, Mubarak podtrzymał USA-rozbite Camp David Accords traktat podpisany między Egiptem a Izraelem w 1978 roku. Mubarak, na okazje również gospodarzem spotkań odnoszących się do konfliktu izraelsko-palestyńskiego i podjął szereg prób, aby służyć jako pośrednik między nimi. Mubarak obawiał się, że rabin Menachem M. Schneerson nie ufa mu w tej kwestii i rozważał spotkanie z nim w Nowym Jorku.
W październiku 2000 roku Mubarak był gospodarzem nadzwyczajnego spotkania na szczycie w Sharm el-Sheikh, aby omówić konflikt izraelsko-palestyński. W spotkaniu uczestniczyli: Prezydent USA Bill Clinton, Przewodniczący P.L.O. Yasser Arafat, Premier Izraela Ehud Barak, Król Jordanii Abdullah, Sekretarz Generalny NATO Javier Solana, oraz Sekretarz Generalny ONZ Kofi Annan.
Mubarak był zaangażowany w Ligę Arabską, wspierając arabskie wysiłki w celu osiągnięcia trwałego pokoju w regionie. Na szczycie w Bejrucie 28 marca 2002 r. liga przyjęła Arabską Inicjatywę Pokojową, inspirowany przez Saudów plan zakończenia konfliktu arabsko-izraelskiego.
W 2006 roku Mubarak potępił izraelski atak wojskowy w Libanie, ale także pośrednio skrytykował Hezbollah za szkodzenie interesom arabskim.
W czerwcu 2007 roku Mubarak odbył spotkanie na szczycie w Szarm el-Szejk z królem Jordanii Abdullahem II, prezydentem Mahmudem Abbasem i premierem Ehudem Olmertem. 19 czerwca 2008 r. weszła w życie wynegocjowana przez Egipt przerwa w działaniach wojennych między Izraelem a Hamasem. Według The New York Times, żadna ze stron nie przestrzegała w pełni warunków zawieszenia broni.
Umowa wymagała od Hamasu zakończenia ataków rakietowych na Izrael i egzekwowania zawieszenia broni w całej Gazie. W zamian Hamas oczekiwał zakończenia blokady, wznowienia handlu w Gazie oraz przywrócenia transportu ciężarówkami do poziomu z 2005 roku. Izrael uzależniał złagodzenie blokady od zmniejszenia ostrzału rakietowego i stopniowo otwierał linie zaopatrzenia, zezwalając na wjazd do Gazy około 90 ciężarówek dziennie. Hamas skrytykował Izrael za ciągłą blokadę, podczas gdy Izrael oskarżył Hamas o ciągły przemyt broni tunelami do Egiptu i wskazał na ciągłe ataki rakietowe.
W 2009 roku rząd Mubaraka zakazał konferencji antywojennej w Kairze, która skrytykowała jego brak działań przeciwko Izraelowi.
.