Wielu egipskich bogów i bogiń zaczęło się w jednym miejscu i przez całą swoją historię mieli swoje własne miasto, gdzie byli czczeni, a wiele dużych miast i miasteczek jest znanych jako rodzinne miasta ich boga lub bogini. Jednak nie znaleziono żadnych lokalnych miast, w których czczono Izydę; przez całą jej wczesną historię nie ma żadnych znanych świątyń dla niej. Czczenie Izydy nie zaczęło się aż do 30. dynastii; do tego czasu Izyda była czczona w świątyniach innych bogów lub bogiń. Jednak nawet za czasów 30 dynastii Izyda była czczona razem z Horusem i Ozyrysem. Świątynie Izydy stały się powszechne w czasach rzymskich. Zbudowano jej świątynię w Philae.
W tym czasie świątynie Izydy zaczęły się rozprzestrzeniać poza Egipt. W wielu miejscach jej wyznawcy przejęli kult do semickiej bogini Astarte, ze względu na podobieństwo imion. W epoce hellenistycznej stała się również boginią chroniącą żeglarzy.
We wszystkich częściach świata grecko-rzymskiego Izyda stała się jedną z najważniejszych postaci „religii tajemnych”, a wielu pisarzy klasycznych pisało czasem o jej świątyniach i wyznawcach. Świątynie Izydy były budowane w Iraku, Grecji, Rzymie, nawet tak daleko na północ jak Anglia, gdzie pozostałości świątyni zostały znalezione przy Murze Hadriana. W Philae czczono ją aż do VI wieku, po powstaniu chrześcijaństwa. Upadek jej świątyń jest zwykle uważany za koniec starożytnego Egiptu.
