Lynn Margulis, (ur. 5 marca 1938, Chicago, Illinois, USA – zm. 22 listopada 2011, Amherst, Massachusetts), amerykańska biolog, której seryjna endosymbiotyczna teoria rozwoju komórek eukariotycznych zrewolucjonizowała współczesną koncepcję powstania życia na Ziemi.
Margulis wychowała się w Chicago. Intelektualnie przedwcześnie dojrzała, ukończyła z tytułem licencjata University of Chicago w 1957 roku. Wkrótce potem wyszła za mąż za amerykańskiego astronoma Carla Sagana, z którym miała dwoje dzieci; jedno z nich, Dorion, stało się jej częstym współpracownikiem. Małżeństwo rozwiodło się w 1964 roku. Margulis uzyskała tytuł magistra zoologii i genetyki na Uniwersytecie Wisconsin w Madison w 1960 roku oraz tytuł doktora genetyki na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley w 1965 roku. W 1966 roku dołączyła do wydziału biologii Boston University i uczyła tam do 1988 roku, kiedy to została mianowana wybitnym profesorem uniwersyteckim na wydziale botaniki University of Massachusetts w Amherst. Zachowała ten tytuł, gdy jej afiliacja na uniwersytecie zmieniła się na wydział biologii w 1993 r., a następnie na wydział nauk geologicznych w 1997 r.
Przez większość swojej kariery Margulis była uważana za radykalną przez rówieśników, którzy realizowali tradycyjne darwinowskie podejście do biologii oparte na zasadzie „przetrwania najlepiej przystosowanych”. Jej pomysły, które skupiały się na symbiozie – żywym układzie dwóch różnych organizmów w stowarzyszeniu, które może być korzystne lub niekorzystne – były często witane ze sceptycyzmem, a nawet wrogością. Do jej najważniejszych prac należało opracowanie szeregowej teorii endosymbiotycznej (SET) pochodzenia komórek, która zakłada, że komórki eukariotyczne (komórki z jądrami) powstały w wyniku symbiotycznego połączenia się bezjądrowych bakterii, które wcześniej istniały niezależnie. W tej teorii mitochondria i chloroplasty, dwie główne organelle komórek eukariotycznych, są potomkami niegdyś wolno żyjących gatunków bakterii. Koncepcję tę wyjaśniła w swojej pierwszej książce, Origin of Eukaryotic Cells (1970). W tamtym czasie jej teoria była uważana za daleko idącą, ale od tego czasu została powszechnie zaakceptowana. Rozwinęła ją w swoim klasyku z 1981 r., Symbioza w ewolucji komórek, proponując, że kolejna symbiotyczna fuzja komórek z bakteriami – tym razem spirochetami, rodzajem bakterii, które szybko falują – rozwinęła się w wewnętrzny system transportowy jądra komórki. Margulis postulowała dalej, że eukariotyczne rzęski były również pierwotnie spirochetami i że cytoplazma wyewoluowała z symbiotycznej relacji między eubakteriami i archaebakteriami (patrz archaea).
Jej książka z 1982 r. Five Kingdoms, napisana z amerykańską biolog Karlene V. Schwartz, artykułuje system pięciu królestw klasyfikujący życie na Ziemi – zwierzęta, rośliny, bakterie (prokariota), grzyby i protoktowce. Królestwo protistów, które obejmuje większość organizmów jednokomórkowych (i wielokomórkowych glonów) w innych systemach, zostało odrzucone jako zbyt ogólne. Wiele organizmów zwykle zaliczanych do protistów umieszcza się w jednym z pozostałych czterech królestw; protokty tworzą pozostałe organizmy, które wszystkie są wodne i obejmują glony i pleśnie. Margulis zredagował fragmenty kompendium Handbook of Protoctista (1990).
Innym obszarem zainteresowania Margulis była jej długa współpraca z brytyjskim naukowcem Jamesem Lovelockiem nad kontrowersyjną hipotezą Gai. Proponuje ona, że Ziemia może być postrzegana jako pojedynczy samoregulujący się organizm – to znaczy złożona jednostka, której elementy żywe i nieorganiczne są wzajemnie zależne i której formy życia aktywnie modyfikują środowisko, aby utrzymać gościnne warunki.
Oprócz publikacji naukowych Margulis napisała wiele książek interpretujących naukowe koncepcje i wątpliwości dla popularnej publiczności. Wśród nich były Mystery Dance: On the Evolution of Human Sexuality (1991), What Is Life? (1995), What Is Sex? (1997), a także Dazzle Gradually: Refleksje na temat natury w naturze (2007), wszystkie napisane wspólnie z synem. Napisała również książkę z opowiadaniami, Luminous Fish (2007). Jej późniejsze wysiłki zostały opublikowane pod Sciencewriters Books imprint Chelsea Green Publishing, który współzałożyła z Dorion w 2006.
Margulis został wybrany do National Academy of Sciences w 1983 roku i był jednym z trzech amerykańskich członków Rosyjskiej Akademii Nauk Przyrodniczych. Otrzymała nagrodę Williama Proctera od Sigma Xi, międzynarodowego stowarzyszenia badawczego, oraz amerykański National Medal of Science w 1999 roku. W 2008 roku otrzymała Medal Darwina-Wallace’a przyznawany przez Linnean Society of London. Była współautorką, wraz z Dorionem, artykułu Encyclopædia Britannica na temat życia.
.
