Laboratorní informace
LIBS je nástroj pro správu „laboratorních informací“. Hlavním účelem systému LIMS je zachycovat všechny druhy vědeckých údajů, které laboratoř vytváří nebo používá. Většina laboratoří potřebuje spravovat tři kategorie dat: inventář, vzorky a výsledky testů. Některé laboratoře, které pracují se zvířaty nebo rostlinami, mají specifické potřeby správy dat.
Řízení zásob
Špatné řízení laboratorních zásob může být nákladnou chybou. Nedostatek zásob po ruce může zpozdit experimenty. Objednání většího množství zásob, než je nezbytné, vede k zbytečným výdajům, protože zásoby s omezenou dobou trvanlivosti je třeba vyřadit. Objednání nesprávných zásob může vést k problémům s reprodukovatelností.
Řízení zásob je proto klíčovou součástí systému LIMS. Měl by poskytovat členům laboratoře seznam standardních zásob, sledovat dostupné množství zásob v laboratoři spolu s datem expirace. V neposlední řadě by měl usnadňovat objednávání zásob a sledovat proces jejich nákupu.
Sledování vzorků
Další důležitou funkcí laboratorních informačních systémů (LIS) je sledování vzorků. Sledování vzorků znamená znát obsah a umístění každé zkumavky a dalších nádob v laboratoři. To může být náročný úkol, protože i středně velká laboratoř může zpracovat tisíce vzorků měsíčně.
Silný systém sledování vzorků se opírá o dvě složky: definici typů vzorků a solidní řešení pro jejich označování.
Definice různých typů vzorků umožňuje určit, jaké údaje je třeba ke vzorkům přiřadit, aby byl vzorek správně popsán. Je třeba očekávat, že různé laboratoře budou definovat typy vzorků na základě typu experimentů, které provádějí.
Robustní systém označování vzorků umožňuje snadný tisk štítků, které lze připojit k jakémukoli druhu vzorku používanému v laboratoři. Štítky by měly obsahovat minimálně čitelně vytištěný název vzorku a 1D nebo 2D čárový kód (známý také jako DataMatrix), který kóduje jedinečný identifikátor. Pracovníci laboratoře by měli být schopni naskenovat čárový kód a získat podrobný popis vzorku z laboratorního informačního systému.
Mnoho laboratoří pracuje s laboratorními zvířaty. Jiné pracují s rostlinami. Ačkoli se tyto „objekty“ obecně nepovažují za „vzorky“, mohly by jimi být, pokud je systém LIMS dostatečně flexibilní, aby umožnil definovat širokou škálu typů vzorků. Laboratorní zvířata však vyžadují specifická řešení identifikace.
Místa uložení
Pro správu vzorků je třeba přiřadit vzorky k místům, aby pracovníci laboratoře věděli, kde je mají najít. Laboratorní informační systém musí umožnit vedoucím laboratoří definovat skladovací místa. Minimálně by to mělo zahrnovat laboratorní mrazničky, protože ty mají obvykle složitou strukturu zahrnující více vrstev od přihrádek, regálů, zásuvek, boxů až po buňky umožňující uložení jediné zkumavky.
V ideálním případě by měl být systém správy skladování dostatečně flexibilní, aby umožnil uživatelům definovat další skladovací místa. Jakékoli místo, které může trvale nebo dočasně uchovávat vzorek, by mělo být zahrnuto do modelu skladování. To zahrnuje chladničky, chladicí místnosti, inkubátory, police ve skříních a dokonce i lavičky.
Výsledky testů
Nakonec jednou z hlavních funkcí laboratorního informačního systému je přiřazení výsledků testů ke vzorkům. Pokud je výsledkem testu jednoduchý datový bod, například koncentrace, je možné zaznamenat výsledek testu přímo do záznamu o vzorku. Stále častěji se však stává, že výsledky testů zpočátku přicházejí ve formě velkých souborů dat shromážděných na jednom vzorku nebo na dávce vzorků. Příkladem souboru dat spojeného s jedním vzorkem je mikroskopický experiment vytvářející sérii snímků nebo film. Výsledky sekvenačního experimentu budou pravděpodobně obsahovat nezpracovaná data z více vzorků. V těchto situacích musí systém LIMS zajistit integritu dat prostřednictvím vztahů mezi vzorky, soubory nezpracovaných dat a zpracovanými daty.
