Información de laboratorio
Un LIMS es una herramienta para gestionar la «información de laboratorio». El objetivo principal de un sistema LIMS es capturar todo tipo de datos científicos producidos o utilizados por un laboratorio. La mayoría de los laboratorios necesitan gestionar tres categorías de datos: inventario, muestras y resultados de pruebas. Algunos laboratorios que trabajan con animales o plantas tienen necesidades específicas de gestión de datos.
Gestión del inventario
Una mala gestión de los suministros del laboratorio puede ser un error costoso. No tener suficientes suministros a mano puede retrasar los experimentos. Pedir más suministros de los necesarios conlleva gastos de despilfarro, ya que hay que desechar suministros con una vida útil limitada. Pedir los suministros equivocados puede dar lugar a problemas de reproducibilidad.
La gestión del inventario es, por tanto, un componente clave de un sistema LIMS. Debe proporcionar a los miembros del laboratorio una lista de suministros estándar, mantener un seguimiento de las cantidades disponibles de suministros en el laboratorio junto con la fecha de caducidad. Por último, debe facilitar el pedido de suministros y hacer un seguimiento del proceso de adquisición de los mismos.
Seguimiento de muestras
Otra función importante de los sistemas de información de laboratorio (LIS) es el seguimiento de las muestras. El seguimiento de las muestras implica conocer el contenido y la ubicación de cada tubo de ensayo y otros recipientes del laboratorio. Esto puede ser una tarea abrumadora, ya que incluso un laboratorio de tamaño medio puede procesar miles de muestras al mes.
Un sistema sólido de seguimiento de muestras se basa en dos componentes: la definición de los tipos de muestras y una solución sólida de etiquetado de muestras.
La definición de los diferentes tipos de muestras permite especificar qué datos deben asociarse a las muestras para describirlas adecuadamente. Cabe esperar que los distintos laboratorios definan los tipos de muestras en función del tipo de experimentos que realicen.
Un sistema robusto de etiquetado de muestras permite imprimir fácilmente etiquetas que pueden ser adheridas a cualquier tipo de muestra en uso en el laboratorio. Como mínimo, las etiquetas deben incluir un nombre de la muestra impreso en claro y un código de barras 1D o 2D (también conocido como DataMatrix) que codifique un identificador único. El personal del laboratorio debe poder escanear el código de barras y recuperar la descripción detallada de la muestra desde el sistema de información del laboratorio.
Muchos laboratorios trabajan con animales de laboratorio. Otros trabajan con plantas. Aunque estos «objetos» generalmente no se consideran «muestras», podrían serlo cuando el LIMS es lo suficientemente flexible como para permitir la definición de una amplia gama de tipos de muestras. Sin embargo, los animales de laboratorio requieren soluciones de identificación específicas.
Lugares de almacenamiento
Para gestionar las muestras, es necesario asociarlas con lugares para que el personal del laboratorio sepa dónde encontrarlas. Un sistema de información de laboratorio debe permitir a los directores de laboratorio definir las ubicaciones de almacenamiento. Como mínimo, esto debería incluir los congeladores del laboratorio, ya que suelen tener estructuras complejas que implican múltiples capas, desde compartimentos, estantes, cajones, cajas y todo el camino hasta las celdas que permiten el almacenamiento de un solo tubo.
En realidad, el sistema de gestión del almacenamiento debería ser lo suficientemente flexible como para permitir a los usuarios definir otros lugares de almacenamiento. Cualquier lugar que pueda albergar una muestra de forma permanente o temporal debe incluirse en el modelo de almacenamiento. Esto incluye refrigeradores, cámaras frigoríficas, incubadoras, estantes en armarios e incluso bancos.
Resultados de las pruebas
Por último, una de las principales funciones de un sistema de información de laboratorio es asociar los resultados de las pruebas con las muestras. Cuando el resultado de una prueba es un simple punto de datos como una concentración, es posible registrar el resultado de la prueba en el registro de la muestra directamente. Sin embargo, cada vez es más frecuente que los resultados de las pruebas se presenten inicialmente en forma de grandes conjuntos de datos recogidos en una sola muestra o en un lote de muestras. Un experimento de microscopía que produce una serie de imágenes o una película es un ejemplo de conjunto de datos asociado a una sola muestra. Los resultados de un experimento de secuenciación probablemente incluyan datos brutos de múltiples muestras. En estas situaciones, el LIMS necesita asegurar la integridad de los datos a través de las relaciones entre las muestras, los conjuntos de datos crudos y los datos procesados.
