Laborinformationen
Ein LIMS ist ein Werkzeug zur Verwaltung von „Laborinformationen“. Der Hauptzweck eines LIMS-Systems besteht darin, alle Arten von wissenschaftlichen Daten zu erfassen, die in einem Labor erzeugt oder verwendet werden. Die meisten Labors müssen drei Datenkategorien verwalten: Bestand, Proben und Testergebnisse. Einige Labors, die mit Tieren oder Pflanzen arbeiten, haben besondere Anforderungen an die Datenverwaltung.
Bestandsverwaltung
Eine schlechte Verwaltung des Laborbedarfs kann ein teurer Fehler sein. Wenn nicht genügend Vorräte vorhanden sind, können sich Experimente verzögern. Die Bestellung von mehr als dem benötigten Material führt zu verschwenderischen Ausgaben, da Material mit begrenzter Haltbarkeit weggeworfen werden muss. Die Bestellung des falschen Verbrauchsmaterials kann zu Problemen mit der Reproduzierbarkeit führen.
Das Bestandsmanagement ist daher ein wichtiger Bestandteil eines LIMS-Systems. Es sollte den Labormitarbeitern eine Liste der Standardverbrauchsmaterialien zur Verfügung stellen, die verfügbaren Mengen der Verbrauchsmaterialien im Labor zusammen mit dem Verfallsdatum im Auge behalten. Schließlich sollte es die Bestellung von Verbrauchsmaterialien erleichtern und den Beschaffungsprozess verfolgen.
Probenverfolgung
Eine weitere wichtige Funktion von Laborinformationssystemen (LIS) ist die Verfolgung von Proben. Probenverfolgung bedeutet, den Inhalt und den Standort jedes Reagenzglases und anderer Behälter im Labor zu kennen. Dies kann eine gewaltige Aufgabe sein, da selbst ein mittelgroßes Labor Tausende von Proben pro Monat verarbeiten kann.
Ein robustes System zur Probenverfolgung beruht auf zwei Komponenten: der Definition von Probentypen und einer soliden Lösung zur Probenkennzeichnung.
Die Definition verschiedener Probentypen ermöglicht es, zu spezifizieren, welche Daten den Proben zugeordnet werden müssen, um die Probe richtig zu beschreiben. Es sollte erwartet werden, dass verschiedene Laboratorien Probentypen auf der Grundlage der Art der von ihnen durchgeführten Experimente definieren werden.
Ein robustes Probenetikettierungssystem ermöglicht es, auf einfache Weise Etiketten zu drucken, die an jeder Art von Probe im Labor angebracht werden können. Die Etiketten sollten mindestens einen deutlich gedruckten Probennamen und einen 1D- oder 2D-Barcode (auch als DataMatrix bekannt) enthalten, der eine eindeutige Kennung codiert. Das Laborpersonal sollte in der Lage sein, den Barcode zu scannen und die detaillierte Probenbeschreibung aus dem Laborinformationssystem abzurufen.
Viele Labore arbeiten mit Versuchstieren. Andere arbeiten mit Pflanzen. Obwohl diese „Objekte“ im Allgemeinen nicht als „Proben“ betrachtet werden, könnten sie es sein, wenn das LIMS flexibel genug ist, um die Definition einer breiten Palette von Probentypen zu ermöglichen. Labortiere erfordern jedoch spezifische Identifizierungslösungen.
Lagerorte
Um Proben zu verwalten, muss man Proben mit Orten verknüpfen, damit das Laborpersonal weiß, wo sie zu finden sind. Ein Laborinformationssystem muss es den Laborleitern ermöglichen, Lagerorte zu definieren. Dies sollte zumindest die Gefrierschränke des Labors einschließen, da diese in der Regel komplexe Strukturen mit mehreren Schichten aufweisen, von Fächern, Regalen, Schubladen, Kisten bis hin zu Zellen, die die Lagerung eines einzelnen Röhrchens ermöglichen.
Im Grunde sollte das Lagerverwaltungssystem so flexibel sein, dass die Benutzer andere Lagerorte definieren können. Jeder Ort, an dem eine Probe dauerhaft oder vorübergehend gelagert werden kann, sollte in das Lagermodell einbezogen werden. Dazu gehören Kühlschränke, Kühlräume, Inkubatoren, Regale in Schränken und sogar Bänke.
Testergebnisse
Schließlich besteht eine der Hauptfunktionen eines Laborinformationssystems darin, Testergebnisse mit Proben zu verknüpfen. Wenn das Ergebnis eines Tests ein einfacher Datenpunkt wie eine Konzentration ist, kann das Testergebnis direkt im Probendatensatz erfasst werden. Es kommt jedoch immer häufiger vor, dass Testergebnisse zunächst in Form von großen Datensätzen vorliegen, die an einer einzigen Probe oder an einer Reihe von Proben gesammelt wurden. Ein Mikroskopieexperiment, das eine Reihe von Bildern oder einen Film produziert, ist ein Beispiel für einen Datensatz, der mit einer einzelnen Probe verbunden ist. Die Ergebnisse eines Sequenzierungsexperiments umfassen wahrscheinlich Rohdaten von mehreren Proben. In diesen Situationen muss das LIMS die Datenintegrität durch Beziehungen zwischen Proben, Rohdatensätzen und verarbeiteten Daten sicherstellen.
