Fold change (FC) er et mål, der beskriver graden af mængdeændring mellem den endelige og den oprindelige værdi. For et datasæt med en oprindelig værdi på 20 og en endelig værdi på 80 er den tilsvarende foldændring f.eks. 3, eller i daglig tale, en tredobbelt stigning. Fold change beregnes ganske enkelt som forholdet mellem ændringerne mellem den endelige værdi og den oprindelige værdi og den oprindelige værdi i forhold til den oprindelige værdi. Hvis den oprindelige værdi er X og den endelige værdi er Y, er foldændringen således (Y – X)/X eller tilsvarende Y/X – 1. Som et andet eksempel vil en ændring fra 60 til 30 være en foldændring på -0,5, mens en ændring fra 30 til 60 vil være en foldændring på 1 (en ændring på 2 gange den oprindelige værdi).
Der kan imidlertid opstå forvirring og tvetydighed som følge af denne anvendelse. For eksempel, selv om 2 fold er 200% eller 2x, forstås en 2-dobbelt forøgelse, som nævnt ovenfor, af nogle som en forøgelse på 300% som i “90 er 2 gange større end 30”. Alligevel definerer flere ordbøger, herunder Oxford English Dictionary og Merriam-Webster Dictionary samt Collins’ Dictionary of Mathematics, “-fold” som “gange”, som i “3-fold” = “4 gange”. Sandsynligvis på grund af denne definition bruger mange forskere både “fold” og “foldændring” som synonymt med “gange”, som i “2-fold større” = “2 gange større”. Blandt nogle eksperter på dette område er der fortsat brug af foldændring som i “40 er 1-fold større end 20”. Man kunne derfor argumentere for, at brugen af fold change som i “X er 3 gange større end 15” helt bør undgås, da nogle vil fortolke dette som om, at X er 45, mens andre vil forstå det som om, at A er 60.
Fold change-metoden anvendes ofte i analysen af genekspressionsdata inden for transkriptomik, proteomik og metabolomik til måling af ændringer under forskellige forhold. Den indlysende fordel ved fold change-analyse er, at den giver mening for biologer. En ulempe ved og alvorlig risiko ved at bruge fold change-metoden i denne sammenhæng er, at den er biased og kan gå glip af differentielt udtrykte gener med store forskelle (Y-X), men små forhold (X/Y), hvilket fører til en høj miss rate ved høje intensiteter.
Sådan bestiller du:
*Hvis din organisation kræver underskrivelse af en fortrolighedsaftale, bedes du kontakte os via e-mail
