Laboratorieinformation
Et LIMS er et værktøj til at administrere “laboratorieinformation”. Hovedformålet med et LIMS-system er at registrere alle former for videnskabelige data, der produceres eller anvendes af et laboratorium. De fleste laboratorier har brug for at administrere tre kategorier af data: lagerbeholdning, prøver og testresultater. Nogle laboratorier, der arbejder med dyr eller planter, har særlige behov for datastyring.
Inventarstyring
En dårlig styring af laboratorieforsyninger kan være en dyr fejltagelse. Hvis der ikke er nok forsyninger til rådighed, kan det forsinke eksperimenterne. Bestilling af mere end de nødvendige forsyninger fører til spild af udgifter, da forsyninger med begrænset holdbarhed skal kasseres. Bestilling af de forkerte forsyninger kan føre til problemer med reproducerbarheden.
Inventarstyring er derfor en vigtig del af et LIMS-system. Det bør give laboratoriemedlemmerne en liste over standardforsyninger, holde styr på de tilgængelige mængder af forsyninger i laboratoriet sammen med udløbsdatoen. Endelig bør det lette bestillingen af forsyninger og holde styr på indkøbsprocessen.
Sporing af prøver
En anden vigtig funktion for laboratorieinformationssystemer (LIS) er at holde styr på prøver. Prøvesporing betyder, at man kender indholdet og placeringen af alle reagensglas og andre beholdere i laboratoriet. Dette kan være en skræmmende opgave, da selv et mellemstort laboratorium kan behandle tusindvis af prøver om måneden.
Et robust prøvesporingssystem er afhængig af to komponenter: definitionen af prøvetyper og en solid løsning til mærkning af prøver.
Definition af forskellige typer prøver gør det muligt at specificere, hvilke data der skal knyttes til prøverne for at beskrive prøven korrekt. Det må forventes, at forskellige laboratorier vil definere prøvetyper på grundlag af den type eksperimenter, de udfører.
Et robust prøveetiketteringssystem gør det muligt nemt at udskrive etiketter, der kan fastgøres til enhver form for prøve, der anvendes i laboratoriet. Etiketterne skal som minimum indeholde et prøvenavn trykt i klar skrift og en 1D- eller 2D-stregkode (også kendt som DataMatrix), der koder en unik identifikator. Laboratoriepersonalet skal kunne scanne stregkoden og hente den detaljerede prøvebeskrivelse fra laboratorieinformationssystemet.
Mange laboratorier arbejder med forsøgsdyr. Andre arbejder med planter. Selv om disse “objekter” generelt ikke betragtes som “prøver”, kan de blive det, når LIMS’et er fleksibelt nok til at muliggøre definitionen af en bred vifte af prøvetyper. Laboratoriedyr kræver imidlertid specifikke identifikationsløsninger.
Lagringssteder
For at kunne administrere prøverne er man nødt til at tilknytte prøverne til steder, så laboratoriepersonalet ved, hvor de kan finde dem. Et laboratorieinformationssystem skal give laboratoriecheferne mulighed for at definere opbevaringssteder. Dette bør som minimum omfatte laboratoriefrysere, da de har en tendens til at have komplekse strukturer med flere lag fra rum, reoler, skuffer, kasser og hele vejen til celler, der gør det muligt at opbevare et enkelt rør.
Det er vigtigt, at lagerstyringssystemet er fleksibelt nok til at give brugerne mulighed for at definere andre lagerpladser. Ethvert sted, der kan opbevare en prøve permanent eller midlertidigt, bør indgå i opbevaringsmodellen. Dette omfatter køleskabe, kølerum, inkubatorer, hylder i kabinetter og endda bænke.
Testresultater
Endeligt er en af de vigtigste funktioner i et laboratorieinformationssystem at knytte testresultater til prøverne. Når resultatet af en test er et simpelt datapunkt som f.eks. en koncentration, er det muligt at registrere testresultatet direkte i prøvejournalen. Det er imidlertid stadig mere almindeligt, at testresultater i første omgang kommer i form af store datasæt, der er indsamlet for en enkelt prøve eller et parti af prøver. Et mikroskopiforsøg, der giver en række billeder eller en film, er et eksempel på et datasæt, der er knyttet til en enkelt prøve. Resultater fra et sekventeringsforsøg vil sandsynligvis omfatte rådata fra flere prøver. I disse situationer skal LIMS’et sikre dataintegriteten gennem relationer mellem prøver, rå datasæt og behandlede data.
