Symptomer på følgende sygdomme kan ligne symptomerne på PHTS. Sammenligninger kan være nyttige med henblik på at formulere en genetisk differentialdiagnose.
Hereditary breast and ovarian cancer syndrome (HBOC) ligner PHTS, idet patienterne har en høj livstidsrisiko for at udvikle brystkræft. Ovarie-, bugspytkirtel- og prostatakræft samt melanom er også blevet associeret. Patienter med HBOC har dog ikke øget risiko for de andre god- eller ondartede tumorer eller neurologiske problemer, der er forbundet med PHTS. HBOC nedarves autosomalt dominerende og skyldes mutationer i enten BRCA1- eller BRCA2-genet.
Lynch syndrom, tidligere kaldet hereditært nonpolyposis kolorektalcancersyndrom, medfører øget risiko for primært tyktarms-, livmoder-, æggestoks- og mavecancer. Det er omdiskuteret, om risikoen for brystkræft også er øget. Lynch syndromet nedarves autosomalt dominerende. Ligesom i HBOC har patienter med Lynch syndrom ikke øget risiko for skjoldbruskkirtelkræft eller de andre godartede tumorer og neuroudviklingsmæssige træk, der ses i PHTS. På nuværende tidspunkt er fem gener kendt for at forårsage Lynch syndrom; disse gener er en del af mismatch-reparationskomplekset.
Familiel adenomatøs polypose (FAP) og MUTYH-associeret polypose (MAP) er tilstande, der ligesom PTHS medfører øget risiko for polypose og kolorektal kræft. Patienter med FAP/MAP har dog en tendens til at udvikle adenomatøse polypper, mens patienter med PHTS for det meste har hyperplastiske eller hamartomatøse polypper. Desuden er de ekstrakoloniske træk ved PHTS ikke identificeret hos patienter med FAP/MAP med undtagelse af papillær skjoldbruskkirtelkræft, som er blevet associeret med FAP. FAP nedarves autosomalt dominerende og MAP autosomalt recessivt. FAP og MAP skyldes en mutation i APC.
Familiel juvenil polypose er karakteriseret ved små multiple vækster (polypper) i mave-tarmsystemet. Symptomerne kan omfatte gastrointestinal blødning, mavesmerter, diarré, rektal prolaps, sammenfald af en del af tarmen i sig selv og/eller gastrointestinal obstruktion. Nogle af de berørte personer kan opleve proteintab, underernæring og en følelse af generelt dårligt helbred (cachexia). Personer, der er ramt af familiær juvenil polyposis, kan have en øget risiko for tyktarmskræft. Andre symptomer kan omfatte klumpdannelse af fingre og tæer, manglende trivsel, lavt niveau af cirkulerende røde blodlegemer (anæmi). Familiær juvenil polyposis nedarves i et autosomalt dominerende mønster. Familiær juvenil polypose kan være forårsaget af mutationer i BMPR1A-genet eller mutationer i SMAD4-genet, også kendt som MADH4- eller DPC4-genet. En sjælden undergruppe af juvenil polyposis kaldet juvenil polyposis of infancy kan være forårsaget af deletion af et stykke af kromosom 10, der omfatter både BMPR1A og PTEN.
Peutz Jeghers syndrom er en sjælden, arvelig gastrointestinal lidelse, der er karakteriseret ved udvikling af polypper på tarmens slimhinde og mørke misfarvninger på hud og slimhinder. Symptomerne omfatter kvalme, opkastninger og mavesmerter, der opstår på grund af en form for tarmobstruktion (intussusception). Yderligere symptomer omfatter blødning fra endetarmen og mørke hudmisfarvninger omkring læberne, på indersiden af kinderne og på armene. Alvorlig rektal blødning kan forårsage anæmi og episoder med tilbagevendende, kraftige mavesmerter. Peutz-Jeghers syndromet nedarves autosomalt dominerende og opstår på grund af mutationer i et gen, der er placeret på kromosom 19. (For yderligere oplysninger om denne lidelse, vælg “Peutz-Jeghers” som søgeord i databasen over sjældne sygdomme.)
Sotos syndrom er en sjælden genetisk lidelse, der er karakteriseret ved overdreven vækst, der forekommer før og efter fødslen (prænatalt og postnatalt). Ved fødslen har de berørte spædbørn en usædvanlig øget kropslængde, der er unormalt stor i forhold til vægten, som også kan være over gennemsnittet; desuden udviser de nyfødte typisk fremskreden knoglevækst, unormalt store hænder og/eller fødder og karakteristiske ansigtstræk. Den unormalt hurtige vækst fortsætter efter fødslen indtil ca. fire eller fem års alderen, hvorefter væksten kan aftage til en normal hastighed. En ramt persons endelige højde er ofte inden for normalområdet. De ramte spædbørn og børn kan udvise udviklingsmæssige abnormiteter, herunder forsinkelser i at nå udviklingsmålene (f.eks. sidde, kravle og gå), forsinkelser i tilegnelsen af færdigheder, der kræver koordinering af muskulær og mental aktivitet (psykomotorisk retardering), forsinkede sproglige færdigheder og let til alvorlig intellektuel funktionsnedsættelse. I lighed med PHTS kan de karakteristiske ansigtsanomalier omfatte et usædvanligt stort hoved (makrocefali), der kan virke aflangt (dolichocefali). Andre ansigtsanomalier omfatter en fremtrædende pande (frontal bossing); øjne med stor afstand mellem øjnene (ocular hypertelorisme); nedadskrånende øjenlågsfolder (palpebral fissurer); et stærkt hvælvet mundtag (gane); fremspring af underkæben (prognathisme); og/eller en spids hage. I modsætning til PHTS opstår de fleste tilfælde af Sotos syndrom tilfældigt uden nogen kendt årsag (sporadisk) I sjældne tilfælde, når der findes en positiv familiehistorie, kan lidelsen imidlertid nedarves som et autosomalt dominerende genetisk træk. Overlapningen af neurologiske udviklingshæmninger og makrocefali i både PHTS og Sotos syndrom indikerer behovet for genetisk testning for at undgå fejldiagnoser. (For yderligere oplysninger om denne lidelse, vælg “Sotos” som søgeord i databasen over sjældne sygdomme.)
Neurofibromatose 1 (NF1) kan efterligne PHTS, idet patienter med begge lidelser kan udvikle hudlæsioner og gastrointestinal ganglioneuromatose (en type hamartom) og have makrocefali og udviklingsforsinkelser. Langt de fleste patienter med NF1 har dog også flere café-au-lait-makler (lysebrune modermærker), fregner i armhule- og lyskeregionen og lisch nodules, godartede fregnerlignende læsioner over den farvede del af øjet. Derudover er den primære hudlæsion, der udvikler sig, et neurofibrom. NF1 nedarves på en autosomal dominant måde og skyldes mutation af neurofibromin-genet. (For yderligere oplysninger om denne lidelse, vælg “NF1” som søgeord i databasen over sjældne sygdomme.)
Multiple endokrin neoplasi 2B (MEN 2B) overlapper med PHTS, idet begge lidelser forårsager gastrointestinal ganglioneuromatose, slimhindeforandringer og en øget risiko for skjoldbruskkirtelkræft. Medullær skjoldbruskkirtelkræft er den mest almindelige type i MEN 2B, mens follikulær eller papillær skjoldbruskkirtelkræft dominerer hos patienter med PHTS, Desuden har patienter med MEN 2B ikke de andre systemiske manifestationer af PHTS og har tendens til at have en marfanoid kropsbygning (høj og tynd med lange arme og ben). Desuden er de PHTS-associerede læsioner, i modsætning til den MEN 2B-relaterede ganglioneuromatose, ganglioneuromatøse polypper.