Fold Change (FC) ist ein Maß, das den Grad der Mengenänderung zwischen End- und Ausgangswert beschreibt. Bei einem Datensatz mit einem Ausgangswert von 20 und einem Endwert von 80 beträgt die entsprechende Fold Change beispielsweise 3, also eine dreifache Zunahme. Die fache Veränderung wird einfach als das Verhältnis der Veränderungen zwischen dem Endwert und dem Originalwert im Vergleich zum Anfangswert berechnet. Wenn also der ursprüngliche Wert X und der Endwert Y ist, ist die fache Veränderung (Y – X)/X oder gleichwertig Y/X – 1. Ein anderes Beispiel: Eine Veränderung von 60 auf 30 wäre eine fache Veränderung von -0,5, während eine Veränderung von 30 auf 60 eine fache Veränderung von 1 wäre (eine Veränderung um das Zweifache des ursprünglichen Wertes).
Allerdings kann diese Verwendung zu Verwirrung und Mehrdeutigkeit führen. Obwohl beispielsweise das Zweifache 200 % oder das Zweifache ist, wird eine zweifache Steigerung, wie oben erwähnt, von einigen so verstanden, dass sie eine Steigerung von 300 % bedeutet, wie in „90 ist 2 mal größer als 30.“ Mehrere Wörterbücher, darunter das Oxford English Dictionary und das Merriam-Webster Dictionary sowie das Collins’s Dictionary of Mathematics, definieren „-fold“ jedoch als „mal“, wie in „3-fold“ = „4 mal“. Wahrscheinlich aufgrund dieser Definition verwenden viele Forscher sowohl „fold“ als auch „fold change“ als Synonym für „times“, wie z. B. „2-fold larger“ = „2 mal größer“. Einige Experten auf diesem Gebiet verwenden nach wie vor die Bezeichnung „fache Veränderung“, wie z. B. „40 ist 1 Mal größer als 20“. Daher könnte man argumentieren, dass die Verwendung von Fold Change wie in „X ist 3-fach größer als 15“ gänzlich vermieden werden sollte, da einige dies so interpretieren werden, dass X 45 ist, während andere dies so verstehen werden, dass A 60 ist.
Die Fold Change-Methode wird häufig bei der Analyse von Genexpressionsdaten in der Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik verwendet, um die Veränderungen unter verschiedenen Bedingungen zu messen. Der offensichtliche Vorteil der Fold-Change-Analyse ist, dass sie für Biologen sinnvoll ist. Ein Nachteil und ein ernsthaftes Risiko bei der Verwendung der Fold-Change-Methode in diesem Zusammenhang ist, dass sie voreingenommen ist und differenziell exprimierte Gene mit großen Unterschieden (Y-X), aber kleinen Verhältnissen (X/Y) übersehen kann, was zu einer hohen Fehlerquote bei hohen Intensitäten führt.
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