El cambio de pliegues (FC) es una medida que describe el grado de cambio de cantidad entre el valor final y el original. Por ejemplo, para un conjunto de datos con un valor original de 20 y un valor final de 80, el cambio de pliegues correspondiente es 3, o en términos comunes, un aumento de tres veces. El cambio de pliegue se calcula simplemente como la relación de los cambios entre el valor final y el valor original sobre el valor inicial. Así, si el valor original es X y el valor final es Y, el cambio de pliegue es (Y – X)/X o, de forma equivalente, Y/X – 1. Como otro ejemplo, un cambio de 60 a 30 sería un cambio de pliegue de -0,5, mientras que un cambio de 30 a 60 sería un cambio de pliegue de 1 (un cambio de 2 veces el original).
Sin embargo, de este uso pueden surgir confusiones y ambigüedades. Por ejemplo, aunque 2 veces es 200%, o 2x, un aumento de 2 veces, es, como se señaló anteriormente, entendido por algunos como un aumento de 300% como en «90 es 2 veces mayor que 30». Sin embargo, varios diccionarios, incluidos el Oxford English Dictionary y el Merriam-Webster Dictionary, así como el Collins’s Dictionary of Mathematics, definen «-fold» como «times», como en «3-fold» = «4 times». Probablemente debido a esta definición, muchos investigadores utilizan tanto «fold» como «fold change» como sinónimos de «times», como en «2-fold larger» = «2 times larger». Entre algunos expertos en este campo persiste el uso del cambio de pliegue como en «40 es 1 veces mayor que 20». Por lo tanto, se podría argumentar que el uso del cambio de pliegues, como en «X es 3 veces mayor que 15» debería evitarse por completo, ya que algunos interpretarán que esto significa que X es 45 mientras que otros entenderán que esto significa que A es 60.
El método del cambio de pliegues se utiliza a menudo en el análisis de los datos de expresión génica en transcriptómica, proteómica y metabolómica, para medir los cambios en diferentes condiciones. La ventaja obvia del análisis del cambio de pliegue es que tiene sentido para los biólogos. Una desventaja y un grave riesgo de utilizar el método de cambio de pliegue en este entorno es que está sesgado y puede pasar por alto genes expresados diferencialmente con grandes diferencias (Y-X) pero con ratios pequeños (X/Y), lo que lleva a una alta tasa de fallos a altas intensidades.
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