Fold change (FC) è una misura che descrive il grado di cambiamento della quantità tra il valore finale e quello originale. Per esempio, per un set di dati con un valore originale di 20 e un valore finale di 80, il fold change corrispondente è 3, o in termini comuni, un aumento di tre volte. Il fold change è calcolato semplicemente come il rapporto dei cambiamenti tra il valore finale e il valore originale rispetto al valore iniziale. Così, se il valore originale è X e il valore finale è Y, il fold change è (Y – X)/X o equivalentemente Y/X – 1. Come altro esempio, un cambiamento da 60 a 30 sarebbe un fold change di -0,5, mentre un cambiamento da 30 a 60 sarebbe un fold change di 1 (un cambiamento di 2 volte l’originale).
Tuttavia, confusione e ambiguità possono nascere da questo uso. Per esempio, anche se 2 volte è il 200%, o 2x, un aumento di 2 volte, è, come notato sopra, inteso da alcuni per significare un aumento del 300% come in “90 è 2 volte maggiore di 30.” Eppure, diversi dizionari, tra cui l’Oxford English Dictionary e il Merriam-Webster Dictionary, così come il Collins’s Dictionary of Mathematics, definiscono “-fold” per significare “volte”, come in “3-fold” = “4 volte”. Probabilmente a causa di questa definizione, molti ricercatori usano sia “fold” che “fold change” come sinonimo di “volte”, come in “2-fold larger” = “2 volte più grande”. Tra alcuni esperti in questo campo persiste l’uso di fold change come “40 è 1 volta maggiore di 20”. Pertanto, si potrebbe sostenere che l’uso di fold change, come in “X è 3 volte maggiore di 15” dovrebbe essere evitato del tutto, poiché alcuni lo interpreteranno per significare che X è 45 mentre altri capiranno che A è 60.
Il metodo fold change è spesso usato nell’analisi dei dati di espressione genica nella trascrittomica, proteomica e metabolomica, per misurare i cambiamenti in diverse condizioni. L’ovvio vantaggio dell’analisi del fold change è che ha senso per i biologi. Uno svantaggio e un grave rischio dell’uso del metodo del fold change in questo contesto è che è distorto e può mancare ai geni differenzialmente espressi con grandi differenze (Y-X) ma piccoli rapporti (X/Y), portando ad un alto tasso di mancanza ad alte intensità.
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