Informazioni di laboratorio
Un LIMS è uno strumento per gestire le “informazioni di laboratorio”. Lo scopo principale di un sistema LIMS è quello di catturare tutti i tipi di dati scientifici prodotti o utilizzati da un laboratorio. La maggior parte dei laboratori ha bisogno di gestire tre categorie di dati: inventario, campioni e risultati dei test. Alcuni laboratori che lavorano con animali o piante hanno esigenze specifiche di gestione dei dati.
Gestione dell’inventario
Una cattiva gestione delle forniture di laboratorio può essere un errore costoso. Non avere abbastanza scorte a portata di mano può ritardare gli esperimenti. Ordinare più forniture del necessario porta a spese dispendiose in quanto le forniture con durata di conservazione limitata devono essere scartate. Ordinare le forniture sbagliate può portare a problemi di riproducibilità.
La gestione dell’inventario è quindi una componente chiave di un sistema LIMS. Dovrebbe fornire ai membri del laboratorio un elenco di forniture standard, tenere traccia delle quantità disponibili di forniture nel laboratorio insieme alla data di scadenza. Infine, dovrebbe facilitare l’ordinazione delle forniture e tenere traccia del processo di approvvigionamento delle forniture.
Tracciamento dei campioni
Un’altra importante funzione dei sistemi informativi di laboratorio (LIS) è tenere traccia dei campioni. Tracciare i campioni significa conoscere il contenuto e la posizione di ogni provetta e altri contenitori nel laboratorio. Questo può essere un compito arduo, dato che anche un laboratorio di medie dimensioni può elaborare migliaia di campioni al mese.
Un robusto sistema di tracciamento dei campioni si basa su due componenti: la definizione dei tipi di campioni e una solida soluzione di etichettatura dei campioni.
Definire diversi tipi di campioni permette di specificare quali dati devono essere associati ai campioni per descrivere correttamente il campione. Ci si deve aspettare che diversi laboratori definiscano tipi di campioni in base al tipo di esperimenti che eseguono.
Un robusto sistema di etichettatura dei campioni permette di stampare facilmente etichette che possono essere applicate a qualsiasi tipo di campione in uso nel laboratorio. Come minimo, le etichette dovrebbero includere un nome del campione stampato in chiaro e un codice a barre 1D o 2D (noto anche come DataMatrix) che codifica un identificatore unico. Il personale di laboratorio dovrebbe essere in grado di scansionare il codice a barre e recuperare la descrizione dettagliata del campione dal sistema informativo del laboratorio.
Molti laboratori lavorano con animali da laboratorio. Altri lavorano con le piante. Mentre questi “oggetti” non sono generalmente considerati come “campioni”, potrebbero esserlo quando il LIMS è abbastanza flessibile da consentire la definizione di una vasta gamma di tipi di campioni. Tuttavia, gli animali da laboratorio richiedono soluzioni di identificazione specifiche.
Posizioni di stoccaggio
Per gestire i campioni, è necessario associare i campioni alle posizioni in modo che il personale di laboratorio sappia dove trovarli. Un sistema informativo di laboratorio deve permettere ai responsabili di laboratorio di definire i luoghi di stoccaggio. Come minimo, questo dovrebbe includere i congelatori di laboratorio, dato che tendono ad avere strutture complesse che coinvolgono più strati, da compartimenti, rack, cassetti, scatole, fino alle celle che permettono lo stoccaggio di una singola provetta.
In definitiva, il sistema di gestione dello stoccaggio dovrebbe essere abbastanza flessibile da permettere agli utenti di definire altri luoghi di stoccaggio. Qualsiasi luogo che può contenere un campione su base permanente o temporanea dovrebbe essere incluso nel modello di stoccaggio. Questo include frigoriferi, celle frigorifere, incubatori, scaffali in armadi e persino banchi.
Risultati dei test
Infine, una delle funzioni principali di un sistema informativo di laboratorio è di associare i risultati dei test ai campioni. Quando il risultato di un test è un semplice punto di dati come una concentrazione, è possibile registrare il risultato del test direttamente nel record del campione. Tuttavia, è sempre più comune che i risultati dei test arrivino inizialmente sotto forma di grandi serie di dati raccolti su un singolo campione o su un lotto di campioni. Un esperimento di microscopia che produce una serie di immagini o un filmato è un esempio di dataset associato a un singolo campione. I risultati di un esperimento di sequenziamento probabilmente includono dati grezzi da più campioni. In queste situazioni, il LIMS deve garantire l’integrità dei dati attraverso le relazioni tra campioni, set di dati grezzi e dati elaborati.
