Informații de laborator
Un LIMS este un instrument de gestionare a „informațiilor de laborator”. Scopul principal al unui sistem LIMS este de a capta toate tipurile de date științifice produse sau utilizate de un laborator. Majoritatea laboratoarelor trebuie să gestioneze trei categorii de date: inventar, probe și rezultatele testelor. Unele laboratoare care lucrează cu animale sau plante au nevoi specifice de gestionare a datelor.
Gestionarea inventarului
Gestionarea deficitară a consumabilelor de laborator poate fi o greșeală costisitoare. A nu avea suficiente consumabile la îndemână poate întârzia experimentele. Comandarea mai multor consumabile decât cele necesare duce la cheltuieli inutile, deoarece consumabilele cu durată de valabilitate limitată trebuie aruncate. Comandarea unor consumabile greșite poate duce la probleme de reproductibilitate.
Gestionarea inventarului este, prin urmare, o componentă cheie a unui sistem LIMS. Acesta ar trebui să furnizeze membrilor laboratorului o listă de consumabile standard, să țină evidența cantităților de consumabile disponibile în laborator împreună cu data de expirare. În cele din urmă, ar trebui să faciliteze comandarea consumabilelor și să țină evidența procesului de achiziție a acestora.
Dezvăluirea eșantioanelor
O altă funcție importantă a sistemelor informatice de laborator (LIS) este de a ține evidența eșantioanelor. Urmărirea eșantioanelor înseamnă cunoașterea conținutului și a locației fiecărei eprubete și a altor recipiente din laborator. Aceasta poate fi o sarcină descurajantă, deoarece chiar și un laborator de dimensiuni medii poate procesa mii de probe pe lună.
Un sistem robust de urmărire a probelor se bazează pe două componente: definirea tipurilor de probe și o soluție solidă de etichetare a probelor.
Definirea diferitelor tipuri de probe face posibilă specificarea datelor care trebuie să fie asociate cu probele pentru a descrie corect proba. Ar trebui să fie de așteptat ca diferite laboratoare să definească tipuri de probe în funcție de tipul de experimente pe care le efectuează.
Un sistem robust de etichetare a eșantioanelor face posibilă imprimarea cu ușurință a unor etichete care pot fi aplicate pe orice tip de eșantion utilizat în laborator. Cel puțin, etichetele ar trebui să includă o denumire a probei tipărită în clar și un cod de bare 1D sau 2D (cunoscut și sub numele de DataMatrix) care codifică un identificator unic. Personalul de laborator ar trebui să poată scana codul de bare și să poată prelua descrierea detaliată a eșantionului din sistemul informatic al laboratorului.
Multe laboratoare lucrează cu animale de laborator. Altele lucrează cu plante. Deși aceste „obiecte” nu sunt în general considerate ca fiind „probe”, ele ar putea fi considerate atunci când LIMS este suficient de flexibil pentru a permite definirea unei game largi de tipuri de probe. Cu toate acestea, animalele de laborator necesită soluții de identificare specifice.
Locuri de depozitare
Pentru a gestiona eșantioanele, trebuie să se asocieze eșantioanele cu locații, astfel încât personalul de laborator să știe unde să le găsească. Un sistem informatic de laborator trebuie să permită managerilor de laborator să definească locațiile de depozitare. Cel puțin, acest lucru ar trebui să includă congelatoarele de laborator, deoarece acestea tind să aibă structuri complexe care implică mai multe straturi, de la compartimente, rafturi, sertare, cutii și până la celule care permit stocarea unui singur tub.
În mod ideal, sistemul de gestionare a depozitării ar trebui să fie suficient de flexibil pentru a permite utilizatorilor să definească alte locații de depozitare. Orice loc care poate păstra o probă în mod permanent sau temporar ar trebui să fie inclus în modelul de stocare. Aceasta include frigidere, camere frigorifice, incubatoare, rafturi în dulapuri și chiar bănci.
Rezultatele testelor
În cele din urmă, una dintre principalele funcții ale unui sistem informatic de laborator este de a asocia rezultatele testelor cu probele. Atunci când rezultatul unui test este un simplu punct de date, cum ar fi o concentrație, este posibil să se înregistreze direct rezultatul testului în fișa eșantionului. Cu toate acestea, este din ce în ce mai frecvent ca rezultatele testelor să vină inițial sub forma unor seturi mari de date colectate pe un singur eșantion sau pe un lot de eșantioane. Un experiment de microscopie care produce o serie de imagini sau un film este un exemplu de set de date asociat cu un singur eșantion. Rezultatele unui experiment de secvențiere sunt susceptibile de a include date brute de la mai multe probe. În aceste situații, LIMS trebuie să asigure integritatea datelor prin intermediul relațiilor dintre eșantioane, seturi de date brute și date prelucrate.
