Fold change (FC) är ett mått som beskriver graden av kvantitetsförändring mellan slutvärde och ursprungligt värde. För en datamängd med ett ursprungligt värde på 20 och ett slutvärde på 80 är till exempel motsvarande fold change 3, eller i vanliga termer, en trefaldig ökning. Fold change beräknas helt enkelt som förhållandet mellan förändringarna mellan det slutliga värdet och det ursprungliga värdet och det ursprungliga värdet i förhållande till det ursprungliga värdet. Om det ursprungliga värdet är X och det slutliga värdet är Y, är alltså vikningsförändringen (Y – X)/X eller motsvarande Y/X – 1. Som ett annat exempel kan nämnas att en förändring från 60 till 30 skulle vara en vikningsförändring på -0,5, medan en förändring från 30 till 60 skulle vara en vikningsförändring på 1 (en förändring som är två gånger större än det ursprungliga värdet).
Hur som helst kan förvirring och tvetydighet uppstå vid denna användning. Till exempel, även om 2 gånger är 200%, eller 2x, så uppfattas en 2-faldig ökning, som nämnts ovan, av vissa som en ökning på 300%, som i ”90 är 2 gånger större än 30”. Flera ordböcker, däribland Oxford English Dictionary och Merriam-Webster Dictionary samt Collins’s Dictionary of Mathematics, definierar dock ”-fold” som ”gånger”, som i ”3-fold” = ”4 gånger”. Troligen på grund av denna definition använder många forskare både ”fold” och ”fold change” som synonymt med ”times”, som i ”2-fold larger” = ”2 times larger”. Bland vissa experter på detta område används persists av fold change som i ”40 är 1-faldigt större än 20”. Därför kan man hävda att användningen av fold change, som i ”X är 3 gånger större än 15” bör undvikas helt och hållet, eftersom vissa kommer att tolka detta som att X är 45 medan andra kommer att tolka det som att A är 60.
Fold change-metoden används ofta vid analys av genuttrycksdata inom transkriptomik, proteomik och metabolomik, för att mäta förändringarna under olika förhållanden. Den uppenbara fördelen med fold change-analysen är att den är meningsfull för biologer. En nackdel och allvarlig risk med att använda fold change-metoden i denna miljö är att den är partisk och kan missa differentiellt uttryckta gener med stora skillnader (Y-X) men små förhållanden (X/Y), vilket leder till en hög missfrekvens vid höga intensiteter.
Hur man gör en beställning:
*Om din organisation kräver att du skriver under ett sekretessavtal, vänligen kontakta oss via e-post
