Fold change (FC) je míra popisující stupeň změny množství mezi konečnou a původní hodnotou. Například pro soubor dat s původní hodnotou 20 a konečnou hodnotou 80 je odpovídající násobná změna 3, neboli obecně řečeno trojnásobné zvýšení. Fold change se vypočítá jednoduše jako poměr změn mezi konečnou a původní hodnotou vůči původní hodnotě. Je-li tedy původní hodnota X a konečná hodnota Y, je násobná změna (Y – X)/X nebo ekvivalentně Y/X – 1. Jiný příklad: změna z 60 na 30 by byla násobná změna -0,5, zatímco změna z 30 na 60 by byla násobná změna 1 (změna dvojnásobku původní hodnoty).
Z tohoto použití však mohou vznikat nejasnosti a zmatky. Například, ačkoli 2násobné zvýšení je 200 % neboli 2x, je, jak bylo uvedeno výše, některými chápáno jako zvýšení o 300 %, jako ve větě „90 je 2krát větší než 30“. Přesto několik slovníků, včetně Oxford English Dictionary a Merriam-Webster Dictionary, stejně jako Collins’s Dictionary of Mathematics, definuje „-fold“ ve významu „krát“, jako ve slově „3-fold“ = „4 krát“. Pravděpodobně kvůli této definici mnoho vědců používá „fold“ i „fold change“ jako synonyma pro „times“, jako například „2-fold larger“ = „2krát větší“. Mezi některými odborníky v této oblasti přetrvává používání výrazu „fold change“ ve smyslu „40 je 1krát větší než 20“. Proto by se dalo tvrdit, že by se mělo zcela vyhnout používání fold change, jako ve větě „X je 3krát větší než 15“, protože někteří to budou interpretovat tak, že X je 45, zatímco jiní to budou chápat tak, že A je 60.
Metoda fold change se často používá při analýze dat genové exprese v transkriptomice, proteomice a metabolomice, pro měření změn za různých podmínek. Zřejmou výhodou analýzy fold change je, že má pro biology smysl. Nevýhodou a vážným rizikem použití metody fold change v tomto prostředí je, že je zkreslená a může přehlédnout diferenciálně exprimované geny s velkými rozdíly (Y-X), ale malými poměry (X/Y), což vede k vysoké míře přehlédnutí při vysokých intenzitách.
Jak objednat:
*Pokud vaše organizace vyžaduje podepsání dohody o mlčenlivosti, kontaktujte nás prosím e-mailem
