Laboratoriotiedot
LIMS on työkalu ”laboratoriotietojen” hallintaan. LIMS-järjestelmän päätarkoitus on tallentaa kaikenlaista laboratorion tuottamaa tai käyttämää tieteellistä tietoa. Useimmissa laboratorioissa on hallinnoitava kolmea tietoluokkaa: varasto, näytteet ja testitulokset. Joillakin laboratorioilla, jotka työskentelevät eläinten tai kasvien kanssa, on erityisiä tiedonhallintatarpeita.
Varastonhallinta
Laboratoriotarvikkeiden huono hallinta voi olla kallis virhe. Jos tarvikkeita ei ole riittävästi käsillä, se voi viivästyttää kokeita. Tarvikkeiden tilaaminen yli tarpeellisen määrän johtaa tuhlaaviin kuluihin, kun tarvikkeita, joiden säilyvyysaika on rajallinen, joudutaan hävittämään. Väärien tarvikkeiden tilaaminen voi johtaa toistettavuusongelmiin.
Varastonhallinta on siis LIMS-järjestelmän keskeinen osa. Sen pitäisi tarjota laboratorion jäsenille luettelo vakiotarvikkeista, seurata laboratoriossa käytettävissä olevien tarvikkeiden määriä sekä niiden viimeinen käyttöpäivä. Lopuksi sen pitäisi helpottaa tarvikkeiden tilaamista ja seurata tarvikkeiden hankintaprosessia.
Näytteiden seuranta
Laboratoriotietojärjestelmien (LIS) toinen tärkeä tehtävä on näytteiden seuranta. Näytteiden seuranta tarkoittaa sitä, että tiedetään jokaisen koeputken ja muiden laboratoriossa olevien astioiden sisältö ja sijainti. Tämä voi olla pelottava tehtävä, sillä jopa keskikokoinen laboratorio voi käsitellä tuhansia näytteitä kuukaudessa.
Varma näytteiden seurantajärjestelmä perustuu kahteen komponenttiin: näytetyyppien määrittelyyn ja vankkaan näytteiden merkintäratkaisuun.
Erilaisia näytetyyppejä määrittelemällä voidaan määrittää, mitä tietoja näytteisiin on liitettävä, jotta näyte voidaan kuvata asianmukaisesti. On odotettavissa, että eri laboratoriot määrittelevät näytetyypit sen perusteella, millaisia kokeita ne suorittavat.
Vahva näytteiden merkintäjärjestelmä mahdollistaa sellaisten tarrojen helpon tulostamisen, jotka voidaan kiinnittää mihin tahansa laboratoriossa käytössä olevaan näytteeseen. Vähintäänkin etiketeissä olisi oltava näytteen nimi painettuna selvästi ja 1D- tai 2D-viivakoodi (tunnetaan myös nimellä DataMatrix), joka koodaa yksilöllisen tunnisteen. Laboratoriohenkilöstön olisi voitava skannata viivakoodi ja hakea yksityiskohtainen näytteen kuvaus laboratorion tietojärjestelmästä.
Monissa laboratorioissa työskennellään koe-eläinten kanssa. Toiset työskentelevät kasvien kanssa. Vaikka näitä ”esineitä” ei yleensä pidetä ”näytteinä”, niitä voitaisiin pitää, kun LIMS-järjestelmä on riittävän joustava, jotta se mahdollistaa laajan näytetyyppien valikoiman määrittelyn. Laboratorioeläimet vaativat kuitenkin erityisiä tunnistusratkaisuja.
Varastointipaikat
Näytteiden hallitsemiseksi näytteet on yhdistettävä paikkoihin, jotta laboratoriohenkilökunta tietää, mistä ne löytyvät. Laboratoriotietojärjestelmän on annettava laboratoriopäälliköille mahdollisuus määritellä varastointipaikat. Vähimmäisvaatimuksena olisi oltava laboratorion pakastimet, koska niissä on yleensä monimutkaisia rakenteita, joissa on useita kerroksia lokeroista, telineistä, laatikoista, laatikoista ja laatikoista aina soluihin asti, jotka mahdollistavat yksittäisen putken säilytyksen.
Varastoinnin hallintajärjestelmän tulisi olla riittävän joustava, jotta käyttäjät voivat määritellä muita varastointipaikkoja. Kaikki paikat, joissa näytettä voidaan säilyttää pysyvästi tai tilapäisesti, olisi sisällytettävä varastointimalliin. Tähän kuuluvat jääkaapit, kylmähuoneet, inkubaattorit, kaappien hyllyt ja jopa penkit.
Testitulokset
Viimeiseksi yksi laboratoriotietojärjestelmän tärkeimmistä tehtävistä on yhdistää testitulokset näytteisiin. Kun testin tulos on yksinkertainen datapiste, kuten pitoisuus, testitulos voidaan kirjata suoraan näytetietueeseen. On kuitenkin yhä yleisempää, että testitulokset tulevat aluksi suurina tietokokonaisuuksina, jotka on kerätty yhdestä näytteestä tai näyte-erästä. Mikroskooppikokeilu, joka tuottaa sarjan kuvia tai elokuvan, on esimerkki yksittäiseen näytteeseen liittyvästä tietokokonaisuudesta. Sekvensointikokeen tulokset sisältävät todennäköisesti raakadataa useista näytteistä. Näissä tilanteissa LIMS-järjestelmän on varmistettava tietojen eheys näytteiden, raakatietoaineistojen ja käsiteltyjen tietojen välisten suhteiden avulla.
