Seuraavien sairauksien oireet voivat muistuttaa PHTS:n oireita. Vertailu voi olla hyödyllistä geneettisen erotusdiagnoosin laatimiseksi.
Hereditäärinen rinta- ja munasarjasyöpäoireyhtymä (HBOC) on samankaltainen kuin PHTS siinä mielessä, että potilailla on suuri elinikäinen riski sairastua rintasyöpään. Myös munasarja-, haima- ja eturauhassyövät sekä melanooma on yhdistetty. HBOC-potilailla ei kuitenkaan ole suurentunutta riskiä sairastua muihin hyvän- tai pahanlaatuisiin kasvaimiin tai neurologisiin kehityshäiriöihin, jotka liittyvät PHTS:ään. HBOC periytyy autosomaalisesti dominantisti ja johtuu mutaatiosta joko BRCA1- tai BRCA2-geenissä.
Lynchin oireyhtymä, jota aiemmin kutsuttiin perinnölliseksi nonpolyposis-kolorektaalisyövän oireyhtymäksi, aiheuttaa suurentuneen riskin sairastua pääasiassa paksusuolen, kohdun, munasarjojen ja mahalaukun syöpiin. Keskustelua käydään siitä, onko myös rintasyövän riski suurentunut. Lynchin oireyhtymä periytyy autosomaalisesti dominantisti. Kuten HBOC:ssa, Lynchin oireyhtymää sairastavilla potilailla ei ole suurentunutta riskiä sairastua kilpirauhassyöpään tai muihin hyvänlaatuisiin kasvaimiin ja neurologisiin kehityspiirteisiin, joita esiintyy PHTS:ssä. Tällä hetkellä viiden geenin tiedetään aiheuttavan Lynchin oireyhtymää; nämä geenit ovat osa mismatch repair -kompleksia.
Familiaalinen adenomatoottinen polyposis (FAP) ja MUTYH-assosioitunut polyposis (MAP) ovat sairauksia, jotka PTHS:n tavoin aiheuttavat lisääntynyttä riskiä sairastua polypoosiin ja paksusuolen ja peräsuolen syöpiin. FAP/MAP-potilaille kehittyy kuitenkin yleensä adenomatoottisia polyyppeja, kun taas PHTS-potilailla on useimmiten hyperplastisia tai hamartomatoottisia polyyppeja. Lisäksi FAP/MAP-potilailla ei havaita PHTS:n ekstrakolonisia piirteitä, lukuun ottamatta papillaarista kilpirauhassyöpää, joka on yhdistetty FAP:hen. FAP periytyy autosomaalisesti dominantisti ja MAP autosomaalisesti resessiivisesti. FAP ja MAP johtuvat APC:n mutaatiosta.
Familiaaliselle juveniilipolypoosille on ominaista pienet moninkertaiset kasvaimet (polyypit) ruoansulatuskanavassa. Oireita voivat olla ruoansulatuskanavan verenvuoto, vatsakipu, ripuli, peräsuolen prolapsi, suolen osan romahtaminen itseensä ja/tai ruoansulatuskanavan tukos. Joillakin sairastuneilla voi esiintyä proteiinikatoa, aliravitsemusta ja yleistä huonovointisuutta (kakeksia). Perinnöllisestä nuoruusiän polypoosista kärsivillä henkilöillä voi olla suurentunut paksusuolen syövän riski. Muita oireita voivat olla sormien ja varpaiden luutuminen, kyvyttömyys menestyä, alhainen punasolujen määrä (anemia). Familiaalinen juveniili polypoosi periytyy autosomaalisesti dominantisti. Familiaalinen juveniili polypoosi voi johtua mutaatioista BMPR1A-geenissä tai mutaatioista SMAD4-geenissä, joka tunnetaan myös nimellä MADH4- tai DPC4-geeni. Harvinainen juveniilipolypoosin alaryhmä, jota kutsutaan lapsuusiän juveniilipolypoosiksi, voi johtua sekä BMPR1A- että PTEN-geenin käsittävän kromosomin 10 osan deleetioinnista.
Peutz Jeghersin oireyhtymä on harvinainen, perinnöllinen ruoansulatuskanavan häiriö, jolle on ominaista polyyppien kehittyminen suolen limakalvoille ja tummat värimuutokset iholle ja limakalvoille. Oireita ovat pahoinvointi, oksentelu ja vatsakipu, jotka johtuvat eräänlaisesta suolitukoksesta (intussuskeptiosta). Muita oireita ovat verenvuoto peräsuolesta ja tummat ihon värimuutokset huulten ympärillä, poskien sisäpuolella ja käsivarsissa. Vakava peräsuolen verenvuoto voi aiheuttaa anemiaa ja toistuvia, voimakkaita vatsakipukohtauksia. Peutz-Jeghersin oireyhtymä periytyy autosomaalisesti dominantisti ja johtuu kromosomissa 19 sijaitsevan geenin mutaatioista. (Lisätietoja tästä häiriöstä saat valitsemalla hakusanaksi ”Peutz-Jeghers” harvinaisten sairauksien tietokannassa.)
Sotosin oireyhtymä on harvinainen perinnöllinen häiriö, jolle on ominaista liiallinen kasvu, jota esiintyy ennen syntymää ja syntymän jälkeen (synnytystä edeltävästi ja synnytyksen jälkeen). Syntyessään sairastuneilla lapsilla on epätavallisen suuri ruumiinpituus, joka on epänormaalissa suhteessa painoon, joka voi myös olla keskimääräistä suurempi; lisäksi vastasyntyneillä on tyypillisesti pitkälle edennyt luuston kasvu, epätavallisen suuret kädet ja/tai jalat sekä tyypilliset kasvonpiirteet. Poikkeuksellisen nopea kasvu jatkuu syntymän jälkeen noin neljän tai viiden vuoden ikään asti, jolloin kasvu voi hidastua normaaliin tahtiin. Sairastuneen henkilön lopullinen pituus on usein normaalin rajoissa. Sairastuneilla imeväisillä ja lapsilla voi esiintyä kehityspoikkeavuuksia, kuten viiveet kehityksen virstanpylväiden saavuttamisessa (esim. istuminen, ryömiminen, käveleminen), viiveet sellaisten taitojen omaksumisessa, jotka edellyttävät lihas- ja älyllisen toiminnan yhteensovittamista (psykomotorinen jälkeenjääneisyys), viiveet kielellisissä taidoissa ja lievä tai vaikea älyllinen kehitysvamma. Samoin kuin PHTS:ssä, tyypillisiin kasvojen poikkeavuuksiin voi kuulua epätavallisen suuri pää (makrokefalia), joka voi näyttää pitkänomaiselta (dolikokefalia). Muita kasvojen poikkeavuuksia ovat muun muassa ulkoneva otsa (frontal bossing), laajalle levinneet silmät (okulaarinen hypertelorismi), alaspäin vinoilevat silmäluomien poimut (palpebral fissures), pitkälle kaareutunut suulaen katto (palate), alaleuan ulkonema (prognathism) ja/tai teräväkärkinen leuka. Toisin kuin PHTS, useimmat Sotosin oireyhtymätapaukset esiintyvät satunnaisesti ilman tunnettua syytä (sporadisesti). Harvoissa tapauksissa, kun suvussa on positiivinen sukuhistoria, häiriö voi kuitenkin periytyä autosomaalisesti dominoivana geneettisenä ominaisuutena. Sekä PHTS:n että Sotosin oireyhtymän neurologisten kehitysvammojen ja makrokefalian päällekkäisyys osoittaa geneettisen testauksen tarpeen väärän diagnoosin välttämiseksi. (Lisätietoja tästä häiriöstä saat valitsemalla hakusanaksi ”Sotos” harvinaisten sairauksien tietokannassa.)
Neurofibromatoosi 1 (NF1) voi jäljitellä PHTS:ää siten, että molempia sairauksia sairastavilla potilailla voi esiintyä ihomuutoksia ja ruoansulatuskanavan ganglioneuromatoosia (eräänlainen hamartooma), ja heillä voi esiintyä makrokefaliaa ja kehityksellisiä viivästyksiä. Suurimmalla osalla NF1-potilaista on kuitenkin myös useita café-au-lait-makroja (vaaleanruskeita syntymämerkkejä), pisamia kainaloissa ja nivusissa sekä lisch-kyhmyjä, hyvänlaatuisia pisamankaltaisia leesioita silmän värillisen osan päällä. Lisäksi ensisijainen ihomuutos, joka kehittyy, on neurofibrooma. NF1 periytyy autosomaalisesti dominantisti ja johtuu neurofibromiinigeenin mutaatiosta. (Lisätietoja tästä sairaudesta saat valitsemalla hakusanaksi ”NF1” harvinaisten sairauksien tietokannassa.)
Multiple endocrine neoplasia 2B (MEN 2B) on päällekkäinen PHTS:n kanssa siinä mielessä, että molemmat sairaudet aiheuttavat gastrointestinaalista ganglioneuromatoosia, limakalvomuutoksia ja suurentuneen kilpirauhassyövän riskin. Medullaarinen kilpirauhassyöpä on yleisin tyyppi MEN 2B:ssä, kun taas follikulaariset tai papillaariset kilpirauhassyövät ovat vallitsevia potilailla, joilla on PHTS. Lisäksi MEN 2B:tä sairastavilla potilailla ei ole muita PHTS:n systeemisiä ilmenemismuotoja, ja heillä on taipumus olla marfanoidinen ruumiinrakenne (pitkät ja hoikat, pitkät käsivarret ja jalat). Lisäksi toisin kuin MEN 2B:hen liittyvässä ganglioneuromatoosissa, PHTS:ään liittyvät vauriot ovat ganglioneuromatoottisia polyyppeja.
