Laboratóriumi információk
A LIMS a “laboratóriumi információk” kezelésére szolgáló eszköz. A LIMS-rendszer fő célja a laboratórium által előállított vagy használt mindenféle tudományos adat rögzítése. A legtöbb laboratóriumnak három adatkategóriát kell kezelnie: leltár, minták és vizsgálati eredmények. Néhány, állatokkal vagy növényekkel dolgozó laboratóriumnak speciális adatkezelési igényei vannak.
Készletgazdálkodás
A laboratóriumi készletek rossz kezelése költséges hiba lehet. Ha nincs elegendő készlet kéznél, az késleltetheti a kísérleteket. A szükségesnél több készlet rendelése pazarló kiadásokhoz vezet, mivel a korlátozott eltarthatósági idejű készleteket ki kell dobni. A rossz kellékek megrendelése reprodukálhatósági problémákhoz vezethet.
A készletgazdálkodás ezért a LIMS-rendszer kulcsfontosságú eleme. A rendszernek biztosítania kell a laboratóriumi tagok számára a szabványos készletek listáját, nyomon kell követnie a laboratóriumban rendelkezésre álló készletek mennyiségét a lejárati idővel együtt. Végül pedig meg kell könnyítenie a készletek megrendelését és nyomon kell követnie a készletbeszerzési folyamatot.
Mintakövetés
A laboratóriumi információs rendszerek (LIS) másik fontos funkciója a minták nyomon követése. A minták nyomon követése azt jelenti, hogy ismerjük minden kémcső és egyéb tárolóedény tartalmát és helyét a laboratóriumban. Ez ijesztő feladat lehet, mivel még egy közepes méretű laboratórium is több ezer mintát dolgozhat fel havonta.
A robusztus mintakövetési rendszer két összetevőre támaszkodik: a mintatípusok meghatározására és egy megbízható mintacímkézési megoldásra.
A különböző mintatípusok meghatározása lehetővé teszi annak meghatározását, hogy milyen adatokat kell a mintákhoz társítani a minta megfelelő leírásához. Elvárható, hogy a különböző laboratóriumok az általuk végzett kísérletek típusa alapján határozzák meg a mintatípusokat.
A robusztus mintacímkézési rendszer lehetővé teszi olyan címkék egyszerű nyomtatását, amelyek a laboratóriumban használt bármilyen típusú mintára felragaszthatók. A címkéknek legalább egy jól láthatóan nyomtatott mintanevet és egy egyedi azonosítót kódoló 1D vagy 2D vonalkódot (más néven DataMatrix) kell tartalmazniuk. A laboratóriumi személyzetnek képesnek kell lennie a vonalkód beolvasására és a minta részletes leírásának lekérdezésére a laboratóriumi információs rendszerből.
Sok laboratórium dolgozik laboratóriumi állatokkal. Mások növényekkel dolgoznak. Bár ezeket az “objektumokat” általában nem tekintik “mintáknak”, mégis azok lehetnek, ha a LIMS elég rugalmas ahhoz, hogy lehetővé tegye a mintatípusok széles körének meghatározását. A laboratóriumi állatok azonban speciális azonosítási megoldásokat igényelnek.
Tárolási helyek
A minták kezelése érdekében a mintákat helyekhez kell rendelni, hogy a laboratóriumi személyzet tudja, hol találja őket. A laboratóriumi információs rendszernek lehetővé kell tennie a laboratóriumi vezetők számára a tárolási helyek meghatározását. Ennek legalább a laboratóriumi fagyasztókra ki kell terjednie, mivel ezek általában összetett szerkezetűek, több réteget tartalmaznak a rekeszek, állványok, fiókok, dobozok és egészen az egyetlen cső tárolását lehetővé tevő cellákig.
A raktárkezelő rendszernek elég rugalmasnak kell lennie ahhoz, hogy a felhasználók más tárolási helyeket is meghatározhassanak. Minden olyan helyet, amely állandó vagy ideiglenes jelleggel képes mintát tárolni, be kell vonni a tárolási modellbe. Ide tartoznak a hűtőszekrények, hűtőkamrák, inkubátorok, szekrények polcai és még a padok is.
Vizsgálati eredmények
Végül a laboratóriumi információs rendszer egyik fő funkciója a vizsgálati eredmények és a minták összekapcsolása. Ha egy vizsgálat eredménye egy egyszerű adatpont, például egy koncentráció, akkor a vizsgálati eredményt közvetlenül a minta nyilvántartásában lehet rögzíteni. Egyre gyakoribb azonban, hogy a vizsgálati eredmények kezdetben egyetlen mintán vagy mintatételen gyűjtött nagy adathalmazok formájában érkeznek. Egy mikroszkópos kísérlet, amely képsorozatot vagy filmet készít, egy példa az egyetlen mintához kapcsolódó adathalmazra. Egy szekvenálási kísérlet eredményei valószínűleg több mintából származó nyers adatokat tartalmaznak. Ezekben a helyzetekben a LIMS-nek biztosítania kell az adatok integritását a minták, a nyers adatkészletek és a feldolgozott adatok közötti kapcsolatokon keresztül.
