Taittomuutos (FC) on mitta, joka kuvaa määrän muutoksen astetta lopullisen ja alkuperäisen arvon välillä. Esimerkiksi aineistolle, jonka alkuperäinen arvo on 20 ja lopullinen arvo 80, vastaava kertaistunut muutos on 3 eli yleiskielellä sanottuna kolminkertainen lisäys. Kerrannaismuutos lasketaan yksinkertaisesti loppuarvon ja alkuperäisen arvon välisten muutosten suhteena alkuarvoon. Jos siis alkuperäinen arvo on X ja lopullinen arvo on Y, muutoskerroin on (Y – X)/X tai vastaavasti Y/X – 1. Toisena esimerkkinä muutos 60:stä 30:een olisi muutoskerroin -0,5, kun taas muutos 30:stä 60:een olisi muutoskerroin 1 (muutos 2 kertaa alkuperäisen arvo).
Tästä käytöstä voi kuitenkin aiheutua sekaannusta ja epäselvyyttä. Vaikka esimerkiksi 2-kertainen on 200 % eli 2-kertainen, jotkut ymmärtävät, kuten edellä todettiin, 2-kertaisen kasvun tarkoittavan 300 %:n kasvua, kuten esimerkiksi ”90 on 2 kertaa suurempi kuin 30”. Kuitenkin useat sanakirjat, kuten Oxford English Dictionary ja Merriam-Webster Dictionary sekä Collins’s Dictionary of Mathematics, määrittelevät ”-kertaisen” tarkoittavan ”kertaa”, kuten ”3-kertainen” = ”4 kertaa”. Todennäköisesti tämän määritelmän vuoksi monet tutkijat käyttävät sekä ”fold” että ”fold change” synonyymeinä ”kertaa”, kuten esimerkiksi ”2-fold larger” = ”2 kertaa suurempi”. Joidenkin alan asiantuntijoiden keskuudessa käytetään edelleen sanaa ”kertainen muutos”, kuten ”40 on 1-kertaisesti suurempi kuin 20”. Voidaankin väittää, että kertaisen muutoksen käyttöä, kuten ”X on 3-kertaisesti suurempi kuin 15”, tulisi välttää kokonaan, koska jotkut tulkitsevat sen tarkoittavan, että X on 45, kun taas toiset ymmärtävät sen tarkoittavan, että A on 60.
Kertaisen muutoksen menetelmää käytetään usein geeniekspressiodatan analysoinnissa transkriptomiikassa, proteomiikassa ja metaboliamiikassa muutosten mittaamiseen eri olosuhteissa. Taitosmuutosanalyysin ilmeinen etu on se, että se on biologien kannalta järkevä. Haittapuolena ja vakavana riskinä taittomuutosmenetelmän käytössä tässä ympäristössä on se, että se on puolueellinen ja saattaa jättää huomiotta differentiaalisesti ilmentyneet geenit, joilla on suuria eroja (Y-X) mutta pieniä suhteita (X/Y), mikä johtaa suureen ohitusprosenttiin suurilla intensiteeteillä.
Tilauksen tekeminen:
*Jos organisaatiosi edellyttää salassapitosopimuksen allekirjoittamista, ota yhteyttä meihin sähköpostitse
