Informacje laboratoryjne
LIMS to narzędzie do zarządzania „informacjami laboratoryjnymi”. Głównym celem systemu LIMS jest przechwytywanie wszelkiego rodzaju danych naukowych wytwarzanych lub wykorzystywanych przez laboratorium. Większość laboratoriów musi zarządzać trzema kategoriami danych: stanami magazynowymi, próbkami i wynikami testów. Niektóre laboratoria pracujące ze zwierzętami lub roślinami mają szczególne potrzeby w zakresie zarządzania danymi.
Zarządzanie zapasami
Złe zarządzanie zapasami laboratoryjnymi może być kosztownym błędem. Brak wystarczającej ilości materiałów może opóźnić eksperymenty. Zamawianie większej ilości materiałów niż jest to konieczne prowadzi do rozrzutnych wydatków, ponieważ materiały o ograniczonym terminie przydatności do spożycia muszą zostać wyrzucone. Zamawianie niewłaściwych materiałów może prowadzić do problemów z odtwarzalnością.
Zarządzanie zapasami jest zatem kluczowym elementem systemu LIMS. Powinien on zapewnić członkom laboratorium listę standardowych materiałów eksploatacyjnych, śledzić dostępne ilości materiałów eksploatacyjnych w laboratorium wraz z datą ważności. Wreszcie, powinien ułatwiać zamawianie materiałów eksploatacyjnych i śledzić proces zaopatrzenia w materiały eksploatacyjne.
Śledzenie próbek
Inną ważną funkcją laboratoryjnych systemów informacyjnych (LIS) jest śledzenie próbek. Śledzenie próbek oznacza znajomość zawartości i lokalizacji każdej probówki i innych pojemników w laboratorium. Może to być zniechęcające zadanie, ponieważ nawet średniej wielkości laboratorium może przetwarzać tysiące próbek miesięcznie.
Solidny system śledzenia próbek opiera się na dwóch elementach: definicji typów próbek i solidnym rozwiązaniu do etykietowania próbek.
Definiowanie różnych typów próbek umożliwia określenie, jakie dane muszą być powiązane z próbkami, aby prawidłowo opisać próbkę. Należy się spodziewać, że różne laboratoria będą definiować typy próbek w oparciu o rodzaj wykonywanych eksperymentów.
Wytrzymały system etykietowania próbek umożliwia łatwe drukowanie etykiet, które mogą być dołączone do każdego rodzaju próbki używanej w laboratorium. Jako minimum, etykiety powinny zawierać nazwę próbki wydrukowaną czytelnie oraz kod kreskowy 1D lub 2D (znany również jako DataMatrix) kodujący unikalny identyfikator. Personel laboratorium powinien być w stanie zeskanować kod kreskowy i pobrać szczegółowy opis próbki z laboratoryjnego systemu informacyjnego.
Wiele laboratoriów pracuje ze zwierzętami laboratoryjnymi. Inne pracują z roślinami. Podczas gdy te „obiekty” nie są ogólnie uważane za „próbki”, mogą być nimi, gdy LIMS jest wystarczająco elastyczny, aby umożliwić definicję szerokiego zakresu typów próbek. Zwierzęta laboratoryjne wymagają jednak specyficznych rozwiązań w zakresie identyfikacji.
Lokalizacje magazynowe
Aby zarządzać próbkami, należy powiązać próbki z lokalizacjami, tak aby personel laboratorium wiedział, gdzie je znaleźć. Laboratoryjny system informacyjny musi umożliwiać kierownikom laboratoriów definiowanie miejsc przechowywania. Jako minimum, powinno to obejmować zamrażarki laboratoryjne, ponieważ mają one zazwyczaj złożoną strukturę obejmującą wiele warstw od przedziałów, stojaków, szuflad, pudełek, aż po komórki umożliwiające przechowywanie pojedynczej probówki.
Idealnie, system zarządzania przechowywaniem powinien być wystarczająco elastyczny, aby umożliwić użytkownikom zdefiniowanie innych miejsc przechowywania. Każde miejsce, które może przechowywać próbkę na stałe lub tymczasowo, powinno być uwzględnione w modelu przechowywania. Obejmuje to chłodziarki, komory chłodnicze, inkubatory, półki w szafach, a nawet ławki.
Wyniki badań
Wreszcie, jedną z głównych funkcji laboratoryjnego systemu informacyjnego jest kojarzenie wyników badań z próbkami. Gdy wynik testu jest prostym punktem danych, takim jak stężenie, możliwe jest bezpośrednie zapisanie wyniku testu w rekordzie próbki. Jednakże coraz częściej zdarza się, że wyniki badań są początkowo dostarczane w formie dużych zbiorów danych zebranych dla pojedynczej próbki lub partii próbek. Eksperyment mikroskopowy wytwarzający serię obrazów lub film jest przykładem zbioru danych związanego z pojedynczą próbką. Wyniki eksperymentu sekwencjonowania będą prawdopodobnie zawierać surowe dane z wielu próbek. W takich sytuacjach LIMS musi zapewnić integralność danych poprzez relacje między próbkami, surowymi zbiorami danych i przetworzonymi danymi.
